碳酸酐酶 IX；CA9

CA IX
膜抗原 MN; MN

HGNC 批准的基因符号：CA9

细胞遗传学定位：9p13.3 基因组坐标（GRCh38）：9:35,673,928-35,681,159（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

人类 MN 抗原最初是在 HeLa 细胞中发现的，其表达与细胞密度相关。Pastorek 等人（1994）使用抗 MN 的单克隆抗体从 HeLa 细胞文库中克隆了人类 cDNA。cDNA编码的多肽具有4个不同的结构域：分泌信号序列、N端螺旋-环-螺旋（HLH）结构域、碳酸酐酶（CA）结构域和单跨膜结构域。该序列还包含推定的核定位信号和推定的 N 连接糖基化位点。Northern印迹分析表明该基因表达为1.5 kb的mRNA。体外测定表明，表达的 MN 蛋白结合锌，具有弱 CA 活性，对 DNA 具有亲和力，并能转化 NIH 3T3 细胞。Pastorek et al.（1994）指出CA和HLH结构域之间的结构域类似于某些转录因子的激活区域。此外，他们证实了早期的研究结果，即 MN 在某些癌症中表达，而在相应的正常组织中不表达。作者推测MN可能参与细胞增殖和转化。

Hewett-Emmett and Tashian（1996）指出MN是一种α-碳酸酐酶同工酶，并建议命名为碳酸酐酶IX。α-碳酸酐酶同工酶在组织分布及其假定或确定的生物学功能方面表现出广泛的多样性。

Opavsky et al.（1996）指出，MN/CA 蛋白信号肽和 CA 结构域之间的区域类似于硫酸角蛋白附着结构域，表明 MN/CA9 可能是一种蛋白聚糖。

▼ 基因家族

碳酸酐酶（CA）是锌金属酶家族。有关 CA 系列的背景信息，请参阅 114800。

▼ 基因结构

Opavsky et al.（1996）克隆了基因组MN/CA9区域。该基因由 11 个外显子编码，跨度为 10.9 kb。外显子的组织及其与预测蛋白质结构域的关系表明该基因是由外显子改组产生的。由于基因组序列与Pastorek等人（1994）公布的cDNA序列之间的差异，Opavsky等人（1996）确定了修订后的cDNA序列（GenBank X66839）。Southern印迹分析表明MN/CA9是单拷贝基因。5-prime非翻译区不含TATA框，但具有转录因子AP1（JUN; 165160）、AP2（107580）和p53（191170），以及2个共有启动子（Inr）元件基序。

▼ 测绘

Ivanov et al.（1998）通过荧光原位杂交将CA9基因定位到17q21.2。然而，通过辐射杂交作图，Nakakawa等人（1998）将MN/CA9基因分配给9p13-p12。