长基因间非编码 RNA 1018; LINC01018
lincRNA 1018
SRHC
HGNC 批准的基因符号:LINC01018
细胞遗传学位置:5p15.31 基因组坐标(GRCh38):5:6,582,136-6,588,500(来自 NCBI)
▼ 说明
长非编码 RNA(lncRNA),如 LINC01018,长度超过 200 个核苷酸,缺乏蛋白质编码能力,通常是聚腺苷酸化的,并由 RNA 聚合酶 II 转录(参见 180660)。它们是主要与 mRNA 相关并调节其翻译的调节分子(Zheng 等人,2015 年总结)。
▼ 克隆与表达
郑等人(2015) 通过肝细胞癌(HCC; 114550) 中下调的非编码转录物的表达谱鉴定了 LINC01018,他们将其称为 SRHC。通过5-prime和3-prime RACE,他们鉴定了3个SRHC剪接变体。
▼ 基因功能
郑等人(2015) 发现与邻近正常组织相比,HCC 肿瘤中 3 种 SRHC 剪接变体的表达不同程度下调。血清甲胎蛋白(AFP;104150)含量高的低分化组织往往表现出较低的 SRHC 表达。与正常肝细胞系相比,2 个 HCC 细胞系中与 SRHC 相关的富含 CpG 的岛高度甲基化,表明 SRHC 在肿瘤组织中通过 DNA 甲基化下调。
▼ 基因结构
郑等人(2015) 确定 LINC01018 基因包含至少 3 个选择性剪接的外显子。外显子 1 包含一个 CpG 岛。
▼ 测绘
Hartz(2015) 根据 LINC01018 序列(GenBank BC043253) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 LINC01018 基因对应到染色体 5p15.31。