RAB 鸟嘌呤核苷酸交换因子 1； RABGEF1

RAB5 的 RABAPTIN 5 相关交换因子；RABEX5

HGNC 批准的基因符号：RABGEF1

细胞遗传学位置：7q11.21 基因组坐标（GRCh38）：7:66,654,567-66,811,464（来自 NCBI）

▼ 说明

RABGEF1 与内吞膜融合所需的 rabaptin-5（RABPT5; 603616） 形成复合物，并且它充当 RAB5（RAB5A; 179512） 的特异性鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）（Horiuchi et al., 1997）。

▼ 克隆与表达

Horiuchi 等人使用 HeLa 细胞和牛脑细胞质的重叠测定来鉴定 RAB5 相互作用蛋白，然后进行质谱分析、EST 数据库分析并筛选牛脑 cDNA 文库（1997） 克隆了牛 Rabgef1，他们将其命名为 Rabex5。推导的 492 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 57.1 kD，与酵母 Vps9（一种参与内吞转移的蛋白质）具有显着的同源性。在 HeLa 细胞、牛脑和所有检查的小鼠组织中检测到 60-kD RABGEF1 蛋白，表明它普遍表达。

佩内戈等人（2006） 确定 491 个氨基酸的人 RABEX5 蛋白具有 2 个相邻的 N 端泛素（参见 191339）结合域，他们将其称为 RUZ（RABEX5 泛素结合锌指）和 MIU（与泛素相互作用的基序）域，以及一个中心 Vps9 结构域，其中包含 RAB5-GEF 催化活性。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 RABGEF1 基因定位到 7 号染色体（RH75235）。

Gross（2016） 根据 RABGEF1 序列（GenBank BC015330） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 RABGEF1 基因对应到染色体 7q11.21。

▼ 基因功能

Horiuchi 等人使用免疫耗竭实验（1997）发现RABGEF1-RABPT5复合物对于同型和异型内体融合都是必需的。在 GTP 而不是 GDP 存在的情况下，RABGEF1 和 RABPT5 均优先结合 RAB5。将 RAB5 递送至膜后，RABGEF1 在 RAB5 上显示出特定的 GDP/GTP 交换活性。

马特拉等人（2003） 发现 GGA（例如 GGA1；606004）是参与选择跨高尔基体网络货物的 ARF（参见 103180）依赖性网格蛋白接头家族，在体外和体内与 RABGEF1-RABPT5 复合物相互作用。

谭等人（2004） 发现激活的小鼠肥大细胞显示 Rabgef1 mRNA 表达快速上调，随后蛋白质表达急剧下降。免疫沉淀分析表明 Rabgef1 与激活的 Ras（HRAS; 190020）-GTP 相互作用并抑制 Ras 介导的反应。反义 Rabgef1 负向调节活化肥大细胞释放细胞因子和脂质介质。谭等人（2004） 得出结论，RABGEF1 与 RAS 结合并抑制 RAS 激活和 RAS 介导的功能反应。

Penengo 等人使用体外 Pull-down 测定（2006） 发现人 RABEX5 的 RUZ 和 MIU 结构域孤立结合泛素。突变分析表明，在转染的 HeLa 细胞中，MIU 结构域（而非 RUZ 结构域）持续偶联 RABEX5 的单泛素化。免疫共沉淀分析显示，FLAG 标记的和内源性 RABEX5 通过其 RUZ 和 MIU 结构域与内源性泛素化 EGFR（131550） 结合。共聚焦显微镜显示，在 EGF（131530） 处理后，GFP 标记的 RABEX5 被募集至质膜，并在内吞途径的多个站点与 EGFR 保持共定位。结构和生化分析表明，RABEX5 的 RUZ 和 MIU 结构域同时与泛素上分别以 asp58 和 ile44 为中心的不同表面相互作用。

▼ 动物模型

谭等人（2004） 产生了 Rabgef1 -/- 小鼠，其中大多数在出生后不久就死亡。 ELISA 分析检测到 Rabgef1 缺陷的活化肥大细胞中 Hexb（606873）、促炎细胞因子和脂质介质的释放显着增强。所有存活到成年的突变小鼠均出现严重的皮肤炎症，伴有表皮增生、真皮炎症、肥大细胞丰富、血管分布增加，但没有检测到皮肤病原体。 Rabgef1 -/- 小鼠的血清 IgE 和组胺也增加。