SWI/SNF 相关、基质相关、肌节蛋白依赖性染色质调节因子，亚科 C，成员 1； SMARCC1

哺乳动物染色质重塑复合物，BRG1 相关因子 155
BRG1 相关因子，155-KD； BAF155
染色质重塑复合体 BAF155 亚基
SWI3，酵母，同源物

HGNC 批准的基因符号：SMARCC1

细胞遗传学位置：3p21.31 基因组坐标（GRCh38）：3:47,585,269-47,781,893（来自 NCBI）

▼ 说明

SMARCC1 基因编码 BAF155，即 SWI/SNF 染色质重塑复合体的 155 kD 亚基（Wang 等，1996）。另请参见 BAF60a（601735）、-b（601736）和 -c（601373），以及该复合物中的其他亚基。

SMARCC1 是一种 ATP 依赖性染色质重塑剂，可调节端脑发育过程中神经干细胞增殖、分化和存活所需的基因表达（Jin 等人总结，2020）。

▼ 克隆与表达

染色质在发育过程中积极重塑。某些基因的染色质重塑似乎先于其转录激活。在酵母中，多亚基 SWI/SNF 复合物被认为负责染色质重塑。王等人（1996）从人类 YT 细胞中分离出类似的 SWI/SNF 复合物。他们发现所得复合物由 9 至 12 个多肽组成，他们将其称为 BAF（BRG1 相关因子）。王等人（1996）从人类 Jurkat T 细胞 cDNA 文库中分离出 BAF155。该基因编码 1,104 个氨基酸的多肽，与酵母 SWI3 基因和 BAF170（该染色质重塑复合物（601734）中的另一种蛋白质）同源。 SWI3、BAF155 和 BAF170 均包含预测的亮氨酸拉链区域（多种转录因子的二聚化基序）和 myb 样色氨酸重复结构域。 Western blot分析和EST数据库分析表明BAF155在许多组织中表达。

弗雷等人（2018）指出，Smarcc1 在发育中的小鼠大脑的神经上皮和脑室区的纤毛细胞中高度表达，在大脑发育后期表达较少。

▼ 生化特征

冷冻电子显微镜

他等人（2020）报道了与核小体结合的人 BRG1（SMARCA4; 603254）/BRM 相关因子复合物（包括 SMARCC）的 3.7 埃分辨率冷冻电子显微镜结构。该结构揭示了核小体被碱基和 ATPase 模块夹在中间，这些模块通过肌节蛋白相关蛋白（ARP）模块桥接，该模块由 ACTL6A（604958）-ACTB（102630）异二聚体和长 α 螺旋组成。 SMARCA4 的解旋酶-SANT 相关区（HSA）。 ATP 酶马达位于核小体 DNA 附近，在 ATP 水解后，与核小体结合并沿核小体泵送 DNA。 SMARCB1 的 C 端 α 螺旋富含癌症中经常突变的带正电荷残基，介导与核小体酸性斑块的相互作用。 ARID1A（603024）和 SWI/SNF 复合体亚基 SMARCC 分别充当基础模块组织中的结构核心和支架。

▼ 测绘

通过体细胞杂交组的 PCR 和辐射杂交分析，Ring 等人（1998）将 SMARCC1 基因定位到染色体 3p23-p21。

▼ 分子遗传学

Furey 等人在 2 名患有先天性脑积水 5（HYC5; 620241）的无关儿童中进行了研究（2018）鉴定了 SMARCC1 基因中的杂合变异体（601732.0001 和 601732.0002）。这些变异通过外显子组测序进行鉴定，并通过桑格测序进行确认。其中一种变异（错义变异）在患者体内从头发生，而另一种变异（移码变异）则遗传自未受影响的父亲。在另外 3 名具有 HYC5 的先证者中鉴定出 SMARCC1 基因中的另外 3 个杂合推定功能丧失变异。然而，在 2 例病例中，该变异是从未受影响的父母遗传而来的。第三次没有进行父母研究。 gnomAD 数据库中不存在任何变体。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。所有 5 人均患有导水管狭窄。总体而言，这些发现与不完全外显率和可变表达性一致。根据 SMARCC1 的表达模式，作者认为这种形式的脑积水与神经发生受损或破坏有关，而不是与活跃的脑脊液积聚有关。这些患者属于接受全外显子组测序的 88 名交通性脑积水先证者和 89 名患有导水管狭窄相关脑积水先证者的队列中的一部分。

Jin 等人在来自 5 个不相关家庭的 6 名 HYC5 患者中（2020）鉴定了 SMARCC1 基因中杂合的假定功能丧失变异（参见，例如 601732.0003 和 601732.0004）。这些变异是通过外显子组测序发现的，并通过桑格测序证实。其中1个变异是从头发生的，3个变异是从未受影响的父母遗传的，1个个体的遗传模式无法确定。这些发现与不完全外显率和可变表达性一致。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。没有提供临床细节。

▼ 等位基因变异体（4 个选定示例）：

.0001 先天性脑积水，5 ，伴导水管狭窄，易感
SMARCC1，1-BP DEL

在一名因导水管狭窄而患有先天性脑积水 5（HYC5; 620241）的男孩（Hydro106 家族）中，Furey 等人（2018）在 SMARCC1 基因中发现了一个杂合 1-bp 缺失（delA），预计会导致移码和提前终止（Lys891fsTer4）。该变异是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的，遗传自未受影响的父亲，而该变异是从头发生的。先证者的两名同胞在产前被诊断患有先天性脑积水并伴有导水管狭窄，导致死亡；无法从这些人身上获得 DNA。先证者的另一名未受影响的同胞也携带该变异，表明外显率不完全。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，但预计会导致功能丧失。 gnomAD 数据库中不存在该变体。

.0002 先天性脑积水，5 ，伴导水管狭窄，易感
SMARCC1、HIS526PRO

在一名患有先天性脑积水 5（HYC5；620241）并伴有导水管狭窄的女孩（Hydro105 家族）中，Furey 等人（2018）在 SMARCC1 基因中 SWIRM 结构域的保守位置上发现了一个从头杂合的 his526-to-pro（H526P）取代，该取代介导 BAF 复合亚基相互作用。通过外显子组测序发现该突变，并通过桑格测序证实；它不存在于 gnomAD 数据库中。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，但预计会导致功能丧失。

.0003 先天性脑积水，5，易感
SMARCC1、GLN575TER

Jin 等人在 2 名患有先天性脑积水 5（HYC5; 620241）的男孩（KCHYD363 家族）中进行了研究（2020）在 SMARCC1 基因中发现了杂合性 gln575-to-ter（Q575X）取代。该变异是通过外显子组测序发现的，并通过桑格测序证实。它遗传自未受影响的母亲，也存在于另一个未受影响的同胞中，表明外显率不完全且表现力可变。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，但预计会导致功能丧失。

.0004 先天性脑积水，5，易感
SMARCC1、IVSDS、G-A、+1

Jin 等人在一名患有先天性脑积水 5（HYC5; 620241）的女孩中进行了研究（2020）在 SMARCC1 基因中发现了一个从头杂合的 G 到 A 的转变（c.1571+1G-A），预计会破坏剪接位点。该变异是通过外显子组测序发现的，并通过桑格测序证实。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，但预计会导致功能丧失。