前 mRNA 加工因子 38A； PRPF38A

前体 mRNA 加工因子 38，酿酒酵母，A 的同源物； PRP38A
PRP38

HGNC 批准的基因符号：PRPF38A

细胞遗传学位置：1p32.3 基因组坐标（GRCh38）：1:52,404,602-52,420,836（来自 NCBI）

▼ 说明

PRPF38A 是一种高度保守的蛋白质，可作为临时蛋白质-蛋白质相互作用平台，用于在前 mRNA 剪接过程中组装、激活和催化剪接体 B 复合物（Schutze et al., 2016）。

▼ 克隆与表达

舒茨等人（2016） 克隆了人类 PRPF38A，他们将其称为 PRP38。推导的 312 个氨基酸蛋白具有高度保守的 N 端结构域（NTD），随后是酸性接头（AL） 区域和具有 16 个精氨酸-丝氨酸（RS） 重复序列的 C 端区域。数据库分析表明 PRP38 在人体组织中普遍表达。

▼ 基因功能

Schutze 等人使用酵母 2-杂交分析（2016） 发现人 PRP38 的 NTD 与几种人剪接体蛋白相互作用，其中大多数对 B 复合体具有特异性，包括 MFAP1（600215）、SNU23（ZMAT2; 619930） 和 RED（IK; 600549），或者是在 B 复合体阶段招募，包括 PRP31（PRPF31; 606419）、SNU66（SART1; 605941） 和 SKIP（SKIIP; 603055）。全长 PRP38 与多种 AL/RS 结构域结合蛋白相互作用，包括 RNPS1（606447）、SRSF4（601940） 和 SRPK2（602980），以及 NTD 结合蛋白的子集，包括 MFAP1 和 SNU66。突变分析揭示了 PRP38 NTD 中蛋白质-蛋白质相互作用的 4 个不同界面，并且 PRP38 可以通过 2 个不同界面同时结合至少 2 个蛋白质。野生型 PRP38 NTD 加上 AL 的过表达（而非相互作用缺陷的突变体 NTD）会在 B 复合物形成后阻碍剪接体组装，导致 B 复合物无法继续激活和催化。 NTD 与 MFAP1 的相互作用对于剪接抑制很重要。舒茨等人（2016） 得出结论，PRP38 充当 B 复合物特异性蛋白质的组织者，同时可以与核仁核糖核蛋白小颗粒的成分相互作用。

▼ 生化特征

舒茨等人（2016） 将人 PRP38 NTD 的晶体结构解析为 1.28 埃分辨率。 NTD 表现为 3 对反向平行的 α 螺旋，由长环、β 发夹和 4 个附加螺旋连接并包围。

▼ 测绘

Hartz（2016） 根据 PRPF38A 序列（GenBank AK027842） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 PRPF38A 基因对应到染色体 1p32.3。