富含半胱氨酸的 PDZ 结构域结合蛋白; CRIPT
PDZ3 富含半胱氨酸相互作用子
HGNC 批准的基因符号:CRIPT
细胞遗传学位置:2p21 基因组坐标(GRCh38):2:46,617,215-46,630,176(来自 NCBI)
▼ 说明
CRIPT 结合含有 PDZ 结构域的蛋白质,似乎参与细胞骨架-膜相互作用(Niethammer 等,1998)。
▼ 克隆与表达
突触蛋白 PSD95(DLG4; 602887) 通过其前 2 个 N 末端 PDZ 结构域结合并聚集多种膜蛋白,包括 Shaker 型钾通道子单元和 NMDA 受体 NR2 子单元。为了鉴定与 PSD95 第三个 PDZ(PDZ3) 结构域结合的蛋白质,Niethammer 等人(1998) 使用酵母 2-杂交系统以 PSD95 PDZ3 结构域作为诱饵筛选了大鼠脑 cDNA 文库。他们分离出了编码一种新蛋白质的 cDNA,并将其命名为 Cript。通过搜索序列数据库,Niethammer 等人(1998) 鉴定了人类和拟南芥 EST 以及编码与大鼠 Cript 同源蛋白的线虫基因组克隆。人类EST(GenBank AA165108)包含全长编码序列,编码推导的101个氨基酸的蛋白质,该蛋白质以glu-thr-ser-val序列终止,这与PDZ结合四肽共有序列一致。人CRIPT与大鼠Cript有99%的氨基酸同一性,与拟南芥同源物有68%的同一性,与线虫同源物有48%的同一性。最保守的是 N 端和 C 端区域,其中包含多个 cys-X-X-cys 重复序列。对大鼠组织的 Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 2 个主要的 Cript 转录本,即脑、心脏、脾、肺、肝、骨骼肌、肾和睾丸; 2 个转录本可能包含不同的 3-prime UTR。免疫组织化学分析显示,Cript 在大鼠大脑中广泛表达。它在海马中表达显着,在纹状体和皮质中表达中等,在中脑中表达适度。 Cript 蛋白与神经元相关,并以体细胞树突形式分布。此外,Cript 存在于神经纤维中。 Cript 与 Psd95 在整个大脑兴奋性突触的突触后密度中共定位。在抑制性突触中未检测到 Cript。
▼ 测绘
Gross(2014) 根据 CRIPT 序列(GenBank AK291298) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 CRIPT 基因对应到染色体 2p21。
▼ 基因功能
尼特哈默等人(1998) 证明大鼠 Cript 通过其 C 末端选择性地结合 Psd95 的 PDZ3 结构域。 Cript、Psd95 和微管蛋白从大鼠脑突触体膜中进行免疫共沉淀。在异源细胞中,Cript 导致 Psd95 重新分布到微管。尼特哈默等人(1998) 表明 CRIPT 可能调节 PSD95 与兴奋性突触中基于微管蛋白的细胞骨架的相互作用。
▼ 分子遗传学
沙欣等人(2014) 报道了来自近亲家庭的 2 名无关的沙特阿拉伯男孩,他们患有身材矮小、小头畸形和独特的相貌(615789) 以及 CRIPT 基因的纯合截短突变(分别为 604594.0001 和 604594.0002)。
Leduc 等人在一名患有产后生长迟缓、小头畸形、畸形特征和色素异常的 4 岁非洲裔美国女孩中(2016) 鉴定了涉及 CRIPT 基因的突变的复合杂合性:错义突变(C3Y; 604594.0003) 和 1.3-kb 缺失(604594.0004),每个都遗传自未受影响的亲本。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 身材矮小、小头畸形、面容独特
CRIPT,2-BP INS,133GG
Shaheen 等人在一名身材矮小、小头畸形和独特面容的 3 岁沙特阿拉伯男孩中(SSMCF; 615789)(2014) 鉴定了 CRIPT 基因外显子 3 中 2 bp 插入(c.133_134insGG) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Ala45GlyfsTer87)。他未受影响的父母是该突变的杂合子。该患者还有一位已故的受影响姐妹。
.0002 身材矮小,小头畸形,面容独特
CRIPT,1-BP DEL,141T
沙欣等人(2014) 分析了一名沙特阿拉伯男性婴儿的第一代表亲父母的 DNA,该婴儿在 2 个月大时死亡,患有身材矮小、小头畸形和独特的面容(SSMCF; 615789),但无法获得该婴儿的 DNA。他的父母是 CRIPT 基因外显子 4 中 1 bp 缺失(c.141delT) 的杂合子,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Phe47LeufsTer84)。该患者还有一位已故的受影响兄弟。
.0003 身材矮小,小头畸形,面容独特
CRIPT,CYS3TYR(rs757078301)
Leduc 等人在一名患有身材矮小、小头畸形和面部畸形的 4 岁非裔美国女孩中(SSMCF; 615789)(2016) 鉴定了 CRIPT 基因外显子 1 中 c.8G-A 转换(c.8G-A, NM_014171.4) 的复合杂合性,导致高度保守残基处的 cys3-to-tyr(C3Y) 取代在第一个 CXXC 重复序列中,以及染色体 2 上的 1.3 kb 缺失(chr2: 46,844,000-46,845,330),包含 CRIPT 基因的外显子 1 以及 PIGF 基因(600153) 的非翻译外显子 1。她未受影响的父母均具有其中一种突变的杂合子。作者指出,ExAC 数据库中已报告了 C3Y 变体,但由于该变体的质量较低,因此没有报告频率或等位基因计数。
.0004 身材矮小,小头畸形,面容独特
脚本,EX1DEL
讨论染色体 2(chr2: 46,844,000-46,845,330) 上的 1.3-kb 缺失,包括 CRIPT 基因的外显子 1 以及 PIGF 基因(600153) 的非翻译外显子 1,该缺失在复合杂合状态下被发现患有身材矮小、小头畸形和面部畸形的 4 岁非裔美国女孩(SSMCF; 615789),作者:Leduc 等人(2016),参见 604594.0003。