胶原凝集素 10; COLEC10
胶原凝集素,肝脏,1;CLL1
HGNC 批准的基因符号:COLEC10
细胞遗传学位置:8q24.12 基因组坐标(GRCh38):8:118,952,263-119,108,455(来自 NCBI)
▼ 说明
COLEC10 是 C 型凝集素的胶原凝集素亚家族的成员。胶原凝集素含有胶原蛋白样序列和碳水化合物识别域。
▼ 克隆与表达
Ohtani 等人通过搜索 EST 数据库并筛选肝脏 cDNA 文库(1999) 分离出编码 COLEC10 的 cDNA,他们将其称为 CLL1。推导的 277 个氨基酸的 COLEC10 蛋白包含一个 N 端结构域、一个胶原蛋白样结构域、一个预计介导三螺旋结构形成的颈部区域和一个 C 端保守碳水化合物识别结构域。与其他胶原凝集素富含半胱氨酸的 N 端结构域不同,COLEC10 的 N 端结构域仅含有 1 个半胱氨酸。 Northern 印迹分析检测到 1.2-和 3.8-kb 转录物主要在肝脏中表达,在胎盘中表达水平低得多。 1.2-kb 转录物在两种组织中均以较高水平表达。 RT-PCR 分析显示除骨骼肌外的所有测试组织中都有表达。对分级分离的人肝脏进行蛋白质印迹分析,检测到胞浆级分中的 COLEC10,免疫荧光分析将 COLEC10 定位于培养的原代肝细胞的细胞质中。
蒙耶等人(2017) 评估了 ATDC5 软骨细胞系细胞中 CLL1 的细胞内定位,并观察到高尔基体中与分泌肽一致的表达、与跨高尔基体网络标记 58K 的共定位以及胞质表达。此外,CLL1 与基底层中的层粘连蛋白共定位。对小鼠颅面发育过程中 CLL1 的分析显示,在胚胎第 18.5 天(E) 的胚胎腭架和颌的上皮和间质中存在 CLL1 表达。免疫荧光显示早在E13.5就有下颌上皮表达,并显示CLL1和层粘连蛋白共表达,其中CLL1在腭区基底膜中清晰可见。
▼ 测绘
作者:FISH,Ohtani 等人(1999) 将 COLEC10 基因对应到染色体 8q23-q24.1。
▼ 基因功能
大谷等人(1999) 发现缺少胶原蛋白和 N 末端结构域的 COLEC10 重组融合蛋白与甘露糖的结合较弱。它不与甘露聚糖柱结合。糖特异性分析表明,COLEC10 对甘露糖、岩藻糖和半乳糖具有亲和力,对 N-乙酰氨基葡萄糖亲和力较低,对 N-乙酰半乳糖胺亲和力最低。
蒙耶等人(2017) 研究了 CLL1 作为人类细胞趋化剂的能力。他们观察到,含有 CLL1 的椎间盘显示出 HeLa 细胞广泛迁移和侵入椎间盘。
▼ 分子遗传学
Munye 等人在 2 名巴基斯坦同胞和一名无关的巴基斯坦 3MC 综合征 3 患者(3MC3;248340)中进行了研究(2017) 鉴定了 COLEC10 基因(607620.0001-607620.0003) 突变的复合杂合性。
▼ 等位基因变异体(3 个精选示例):
.0001 3MC 综合症 3
COLEC10,ARG9TER(rs149010496)
Munye 等人在 2 名巴基斯坦同胞和一名无关的巴基斯坦 3MC 综合征 3 患者(3MC3;248340)中进行了研究(2017) 鉴定了 COLEC10 基因突变的复合杂合性:巴基斯坦兄弟姐妹(家族 19)在外显子 1 中存在 c.25C-T 转换(c.25C-T,NM_006438.4),导致 arg9- to-ter(R9X) 替换,以及外显子 3 中的 1 bp 删除(c.226delA; 607620.0002),导致预计会导致过早终止密码子(Gly77GlufsTer66) 的移码。他们未受影响的父母均具有其中一种突变的杂合子。不相关的巴基斯坦女性(家族 25)是 R9X 突变和外显子 6 中的 c.528C-G 颠换的复合杂合子,导致 CRD 结构域内的 cys176-to-trp(C176W;607620.0003)替换。她未受影响的父母和兄弟姐妹无法接受检测。 ExAC 数据库中未发现 1-bp 缺失,而 C176W 和 R9X 突变的出现频率分别为 120,850 个染色体中 1 个和 121,220 个染色体中 4 个。在使用 HeLa 和 HEK293 细胞的转染研究中,通过 R9X 和 Gly77GlufsTer66 突变体的蛋白质印迹分析没有检测到蛋白质,这表明两种转录物都经历了无义介导的衰减。相反,在细胞裂解物中检测到 C176W 突变体,但在上清液中未检测到,表明其表达但未分泌。定量 ELISA 显示细胞沉淀中 C176W 突变蛋白的水平高于野生型,但与上清液分析中的野生型相比,突变体的水平严重降低,这与 C176W 蛋白分泌受损一致。
.0002 3MC 综合症 3
COLEC10,1-BP DEL,226A
讨论 COLEC10 基因外显子 3 中的 1-bp 缺失(c.226delA, NM_006438.4),导致移码,预计会导致过早终止密码子(Gly77GlufsTer66),该密码子在巴基斯坦的复合杂合状态下被发现Munye 等人患有 3MC 综合征 3(3MC3; 248340) 的兄妹(2017),参见 607620.0001。
.0003 3MC 综合症 3
COLEC10、CYS176TRP
讨论 COLEC10 基因外显子 6 中的 c.528C-G 颠换(c.528C-G,NM_006438.4),导致 cys176-to-trp(C176W) 取代,这是在复合杂合状态中发现的一名患有 3MC 综合征 3(3MC3; 248340) 的巴基斯坦女性患者(家庭 25),作者:Munye 等人(2017),参见 607620.0001。