磷脂酰肌醇聚糖锚生物合成 B 类蛋白; PIGB

HGNC 批准的基因符号:PIGB

细胞遗传学位置:15q21.3 基因组坐标(GRCh38):15:55,319,222-55,355,648(来自 NCBI)

▼ 说明

许多真核细胞表面蛋白通过糖基磷脂酰肌醇(GPI) 锚附着在膜上,该锚在其核心主链中包含 3 个甘露糖分子。 PIGB 将第三个甘露糖添加到 GPI 核心(Takahashi 等,1996)。

有关 PIG 基因家族以及 PIG 蛋白在 GPI 生物合成中的作用的信息,请参阅 PIGA(311770)。

▼ 克隆与表达

GPI 锚定合成或肽转移缺陷的突变细胞系(Hyman,1988;Hirose 等,1992;Mohney 等,1994)已分为几个互补类别。 Takahashi 等人利用表达克隆获得了可以补充 B 类突变鼠细胞系的人类 cDNA,该突变鼠细胞系在 GPI 锚核心添加第三个甘露糖残基方面存在缺陷(1996)分离出编码PIGB的cDNA。 PIGB cDNA 编码预测的 554 个氨基酸的跨膜蛋白,该蛋白位于内质网中。 PIGB 包含一个小的氨基末端胞质结构域和一个大的羧基末端管腔结构域。人类 PIGB 蛋白与鼠 Pigb 有 77% 的同一性,其 cDNA 也被 Takahashi 等人分离出来(1996)。 B 类淋巴母细胞系和 A 类突变细胞系的 Northern 印迹分析显示有 2.0-kb PIGB 转录物。他们得出结论,PIGB基因是B类突变体中突变的基因,并指出PIGB可能是GPI甘露糖基转移酶III。

▼ 基因结构

高桥等人(1996) 分离出包含 6 个外显子的 17 kb 部分 PIGB 基因组序列。

▼ 测绘

高桥等人(1996) 通过 FISH 将 PIGB 基因定位到染色体 15q21-q22。

▼ 基因功能

Murakami 等人使用缺乏特定 GPI 合成蛋白的中国仓鼠卵巢细胞(2012) 发现,在删除 GPI 合成中间步骤中的活性蛋白后,GPI 锚定蛋白被释放到培养基中,包括 Pigv(610274)、Pigb 和 Pigf(600153)。删除 GPI 合成早期活跃的蛋白质会导致底物蛋白质降解。类似地,GPI转酰胺酶子单元的缺失(其在该过程的后期发挥作用并将底物蛋白的GPI信号序列交换为完整的GPI锚)也导致底物蛋白的降解。 Pigv 敲低后释放的底物蛋白按照 GPI 信号序列被切割,但它们缺乏 GPI 锚。村上等人(2012) 得出结论,在具有至少 1 个甘露糖残基的未成熟 GPI 锚存在的情况下,GPI 转酰胺酶可以切割底物蛋白上的 GPI 信号序列,但转酰胺酶需要成熟的 GPI 锚才能完成 GPI 向底物蛋白的转移。

▼ 分子遗传学

Murakami 等人在来自 10 个患有发育性和癫痫性脑病 80(DEE80; 618580) 的不相关家庭的受影响个体中(2019) 鉴定了 PIGB 基因中的纯合或复合杂合突变(参见例如 604122.0001-604122.0006)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。患者淋巴细胞和成纤维细胞显示细胞表面 GPI 锚定蛋白水平不同程度降低,包括 CD16(参见例如 CD16A,146740)和 CD59(107271)。对 PIGB 缺失的 CHO 细胞中的一些突变进行的体外功能表达研究表明,突变蛋白无法完全恢复 GPI 锚定表面蛋白的表达,这与功能丧失一致,尽管突变具有不同的影响。

▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):

.0001 发育性和癫痫性脑病 80
PIGB,ARG71GLN

Murakami 等人在 3 名同胞(家庭 1)中,由摩洛哥血统的无关父母所生,患有发育性癫痫性脑病 80(DEE80;618580)(2019) 鉴定了 PIGB 基因中的复合杂合错义突变:外显子 2 中的 c.212G-A 转换(c.212G-A, NM_004855.4),导致 arg71 到 gln(R71Q) 取代,以及c.1162G-C 外显子 10 颠换,导致 ala388 变为 pro(A388P;604122.0002)替换。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。两种突变都发生在高度保守的残基处。 R71Q 变体在 ExAC(1.682 x 10(-5)) 和 gnomAD(1.07 x 10(-5)) 数据库中发现频率较低,而 A388P 变体在这两个数据库中均未发现。在 PIGB 无效的 CHO 细胞中进行的体外功能表达研究表明,与野生型相比,突变蛋白无法完全恢复 GPI 锚定表面蛋白的表达,表明 PIGB 活性受损。此外,与野生型相比,突变蛋白的水平有所降低。患者在出生后数周至数月内出现难治性癫痫发作;其中一人在童年早期就去世了。 van Bever 等人此前曾报道过该家庭(2007)。

.0002 发育性和癫痫性脑病 80
PIGB、ALA388PRO

讨论 PIGB 基因中的 c.1162G-C 颠换(c.1162G-C,NM_004855.4),导致 ala388-to-pro(A388P) 取代,在 3 个同胞中以复合杂合状态发现Murakami 等人的发育性和癫痫性脑病 80(DEE80;618580)(2019),参见 604122.0001。

.0003 发育性和癫痫性脑病 80
PIGB、ARG232HIS

Murakami 等人在患有发育性和癫痫性脑病 80(DEE80; 618580) 的 2 名同胞(家族 2)中(2019) 鉴定了 PIGB 基因中的复合杂合错义突变:外显子 6 中的 c.695G-A 转换(c.695G-A,NM_004855.4),导致 arg232 到 his(R232H)的取代,以及c.856G-C 外显子 8 颠换,导致 val286 至 leu(V286L;604122.0004) 取代。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。两种突变都发生在高度保守的残基处。 R232H 变体在 ExAC(5.174 x 10(-5)) 和 gnomAD(4.52 x 10(-5)) 数据库中发现频率较低,而 V286L 变体在这两个数据库中均未发现。与对照组相比,患者淋巴细胞和成纤维细胞的细胞表面 GPI 锚定蛋白水平降低了约 50%。在 PIGB 无效的 CHO 细胞中进行的体外功能表达研究表明,与野生型相比,突变蛋白无法完全恢复 GPI 锚定表面蛋白的表达,表明 PIGB 活性受损。此外,与野生型相比,V286L突变蛋白的水平降低。患者在出生后 6 个月内出现癫痫发作;其中一人在童年早期就去世了。

.0004 发育性和癫痫性脑病 80
PIGB,VAL286LEU

讨论 PIGB 基因中的 c.856G-C 颠换(c.856G-C,NM_004855.4),导致 val286-to-leu(V286L) 取代,在 2 个同胞的复合杂合状态中发现Murakami 等人的发育性和癫痫性脑病 80(DEE80;618580)(2019),参见 604122.0003。

.0005 发育性和癫痫性脑病 80
PIGB、HIS407ARG

Murakami 等人在一名 6 个月大的女孩中,由近​​亲父母(家庭 3)出生,患有发育性癫痫性脑病 80(DEE80;618580)(2019) 在 PIGB 基因的外显子 5 中鉴定出纯合 c.1220A-G 转换(c.1220A-G, NM_004855.4),导致高度保守残基处发生 his407 到 arg(H407R) 取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。在 ExAC 或 gnomAD 数据库中未找到它。在 PIGB 无效的 CHO 细胞中进行的体外功能表达研究显示,突变蛋白水平较低,表明其不稳定,并且与野生型相比,GPI 锚定的表面蛋白仅部分恢复。患者患有与脑电图高度节律失常相关的早发性癫痫发作,并在婴儿期死亡。

.0006 发育性和癫痫性脑病 80
PIGB、IVS7AS、A-G、-10

Murakami 等人在来自 4 个无关家庭(4、6、7 和 10)的 6 名患有发育性癫痫性脑病 80(DEE80;618580) 的患者中(2019) 鉴定了 PIGB 基因(c.847-10A-G, NM_004855.4) 内含子 7 中的纯合 A 到 G 转变,导致 mRNA 中包含内含子 7 的 9 个核苷酸和异常剪接变体(Gln282_Trp283insArgCysGln)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在所有家族中都与该疾病分离。该变体在 ExAC(0.0001592) 和 gnomAD(6.51 x 10(-5)) 数据库中以杂合状态出现频率较低。与对照组相比,一些患者的淋巴细胞和成纤维细胞显示细胞表面 GPI 锚定蛋白水平下降约 25% 至 50%。 PIGB 缺失 CHO 细胞的体外功能表达研究显示,突变蛋白水平较低,表明其不稳定,并且与野生型相比,GPI-AP 表面蛋白部分恢复。这些患者癫痫发作的年龄差异很大,从出生后的第一天到大约一年。

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