FOXF1 相邻非编码发育调节 RNA; FENDRR

FOXF1 反义 RNA 1，非编码；FOXF1AS1
FOXF1 长基因间非编码 RNA
lincFOXF1
lncFOXF1
TCONS_00024240

HGNC 批准的基因符号：FENDRR

细胞遗传学位置：16q24.1 基因组坐标（GRCh38）：16:86,474,525-86,508,860（来自 NCBI）

▼ 说明

长基因间非编码 RNA（lincRNA），例如 FOXF1AS1，被认为参与染色质结构和基因表达的远程控制（Khalil et al., 2009）。

▼ 克隆与表达

卡里尔等人（2009） 开发了一种基于独特的染色质特征来识别 lincRNA 的方法，该特征标记了活跃转录的基因，然后选择缺乏蛋白质编码潜力的基因。利用这种方法，他们在人类细胞中鉴定出了 FOXF1AS1，并将其称为 lincFOXF1。RNA FISH 检测到位于人胎儿足成纤维细胞核灶的 lincFOXF1。

Szafranski 等人通过寻找肺泡毛细血管发育不良伴肺静脉错位（ACDMPV; 265380）（一种致命的肺部发育障碍）患者缺失的染色体 16 区域中的基因，发现了该区域的基因缺失（2013） 鉴定出 FOXF1AS1。定量PCR检测到新生人肺中FOXF1AS1表达，人肺微血管内皮细胞和HEK293细胞表达量低得多，淋巴母细胞中无表达。

▼ 基因功能

卡里尔等人（2009） 表明，FOXF1AS1 与 SUZ12（606245） 共免疫沉淀，SUZ12 是人胎肺和足成纤维细胞中多梳抑制复合物 2（PRC2） 的一个组成部分，但在 HeLa 细胞中则不然。FOXF1AS1 还与胎儿成纤维细胞中的 COREST（RCOR; 607675） 抑制复合物发生共免疫沉淀，但在 HeLa 细胞中则不然。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Szafranski 等人（2013） 将 FOXF1AS1 基因对应到染色体 16q24.1，其中它与相反链上的 FOXF1（601089） 启动子部分重叠。