溶质载体家族 16(单羧酸转运蛋白),成员 4; SLC16A4
单羧酸盐转运蛋白 5;MCT5
HGNC 批准的基因符号:SLC16A4
细胞遗传学定位:1p13.3 基因组坐标(GRCh38):1:110,362,857-110,391,026(来自 NCBI)
▼ 正文
有关单羧酸转运蛋白(MCT) 家族的一般信息,请参阅 MCT4(SLC16A3;603877)。
▼ 克隆与表达
Price 等人使用通过搜索 EST 数据库获得的序列数据以及多个 MCT 的蛋白质序列(1998)筛选了人胎盘cDNA文库并分离出编码新的MCT家族成员MCT5的cDNA。全长 MCT5 cDNA 预测为 487 个氨基酸的蛋白质,具有 10 至 12 个跨膜结构域。MCT5 与 MCT1(600682)、MCT2(603654)、MCT4、MCT6(603879) 和 MCT7(603880) 具有 25% 至 30% 的氨基酸同一性。MCT5 的 C 端尾部比其他家族成员的 C 端尾部短得多。作者推测这可能是由于 MCT5 的 3-prime UTR 中存在的 Alu 序列插入所致。MCT5的5素UTR有5个短的重叠的开放解读码组,或称小顺反子,这表明它可能受到光电调节。Northern 印迹分析在人体组织中检测到 3.0-kb 的转录物;与其他家族成员相比,MCT4具有独特的组织分布。
MCT5编码序列已存入GenBank(U59185)。
▼ 命名法
尹等人(1999) 指出,SLC16A4 基因最初称为 MCT4,但随后更名为 MCT5。
▼ 分子遗传学
胰腺癌的体细胞突变
比安金等人(2012) 进行了外显子组测序和拷贝数分析,以确定前瞻性临床队列中的基因组畸变,该队列由 142 名早期(I 期和 II 期)散发性胰腺导管腺癌患者组成。对 99 个信息丰富的肿瘤的详细分析发现了显着的异质性,其中包括 2,016 个非沉默突变和 1,628 个拷贝数变异。比安金等人(2012) 定义了 16 个显着突变的基因,重申了已知的突变并发现了新的突变基因,包括参与染色质修饰的其他基因(EPC1, 610999 和 ARID2, 609539)、DNA 损伤修复(ATM;607585)和其他机制(ZIM2(参见601483);MAP2K4,601335;NALCN,611549;SLC16A4;和 MAGEA6,300176)。与体外功能数据和动物模型的综合分析为这些遗传畸变在致癌作用中的潜在作用提供了支持证据。对反复突变基因的基于通路的分析概括了胰腺导管腺癌核心信号通路中的聚类,并在每个通路中鉴定了新的突变基因。比安金等人(2012) 还发现了传统上被描述为轴突引导胚胎调节因子的基因中频繁且多样的体细胞畸变,特别是 SLIT/ROBO(见 603742)信号传导,这在小鼠睡美人转座子介导的胰腺癌体细胞突变模型中也很明显,提供轴突引导基因可能参与胰腺癌发生的进一步支持证据。