皮肤/头发/眼睛色素沉着,变化,11; SHEP11
美拉尼西亚金发
皮肤/头发/眼睛色素沉着 11,蓝色/非蓝色眼睛
此条目使用了数字符号(#),因为 TYRP1 基因(115501) 中的纯合突变已被证明是美拉尼西亚人与染色体 9p23 相关的发色变异的原因。
有关皮肤、头发和眼睛色素沉着变异的遗传异质性的一般表型描述和讨论,请参阅 SHEP1(227220)。
▼ 测绘
苏勒姆等人(2008) 提出了一项针对 5,130 名冰岛人中与人类色素沉着特征相关的变异的全基因组关联研究的结果,并对 2,116 名冰岛人和 1,214 名荷兰人进行了后续分析。他们发现,染色体 9p23 上 TYRP1 附近的单核苷酸多态性(SNP) rs1408799C 与蓝眼与非蓝眼相关(OR = 1.41,p = 1.5 x 10(-9))。这种关联在冰岛和荷兰的复制样本中得到了证实,具有类似的效果。还观察到该 SNP 与金发和棕色头发存在暗示关联。TYRP1 基因编码一种在真黑素途径中发挥作用的黑素体酶。
古德贾特森等人(2008) 评估了影响欧洲人头发、眼睛和皮肤色素沉着的遗传变异对皮肤黑色素瘤(155600) 和基底细胞癌风险的影响。作者研究了 2,121 名皮肤黑色素瘤患者、2,163 名基底细胞癌患者以及 40,000 多名对照者。Sulem 等人发现 SNP rs1408799C 与蓝眼睛颜色相关(2008),与皮肤黑色素瘤的风险相关(比值比 = 1.15,p = 4.3 x 10(-4))。
Pospiech 等人对 718 名欧洲血统个体的眼睛颜色变化进行了研究(2011) 使用多因素降维和逻辑回归来检查基于 11 个已知色素沉着基因中的 SNP 的基因间相互作用。对于绿色与非绿色,HERC2(605837) 中的 rs12913832 和 TYRP1 中的 rs1408799 存在显着的相互作用效应。相互作用表现出协同效应。
▼ 临床特征
肯尼等人(2012)研究了所罗门群岛人金发的遗传基础,该人群与赤道附近紫外线辐射较高的深色皮肤和头发色素沉着的总体趋势不同。尽管来自所罗门群岛和赤道大洋洲的人的皮肤色素沉着是非洲以外最深的,但他们的金发患病率也是欧洲以外最高的(5%至10%)。
▼ 分子遗传学
肯尼等人(2012) 对 43 名金发所罗门群岛人和 42 名黑发所罗门群岛人进行了病例对照全基因组关联研究,并观察到染色体 9p23 上有一个强关联信号;最显着的SNP是rs13289810,p值为1.11 x 10(-19),在金发和黑发个体中的频率分别为0.93和0.31。作图区间包含 1 个已知基因 TYRP1。众所周知,TYRP1 突变会淡化多个物种的皮肤和/或毛发色素沉着,而 TYRP1 无效等位基因会导致人类红褐色白化病(OCA3; 203290)。TYRP1 外显子重测序发现在 chr9:12,694,273(GRCh37) 处存在 C-T 转换,对应于 TYRP1 基因外显子 2 氨基酸位置 93 处预测的 arg-to-cys 突变(R93C)(R93C;115501.0007) 。金发个体的基因型为 TT,黑发个体的基因型为 CT 或 CC。R93C 突变与金发的相关性比顶部 GWA SNP 更强(p = 9.60 x 10(-23)),并且 GWA 信号在 R93C 调节时丢失,表明错义突变的主要作用。当肯尼等人(2012) 对 918 名所罗门群岛人进行了 R93C 基因分型,他们用光谱法测量了他们的头发色素沉着,隐性模型提供了最适合的数据,R93C 基因型占头发颜色方差的 46.4%(线性回归;p = 2.19×10(-90))。所罗门群岛 93C 等位基因的频率为 0.26,对来自全球 52 个人群的另外 941 名个体进行 R93C 基因分型显示,93C 等位基因在大洋洲以外地区很少见或不存在。肯尼等人(2012) 没有发现近期基因来自欧洲的证据(即混合),也没有发现 93C 等位基因近期正选择的强烈特征。
肯尼等人(2012) 指出,R93C 突变存在于 N 末端附近的 EGF 样重复中,类似于在棕色(浅色)小鼠(R38C) 中观察到的 TYRP1 分子改变。R38C 突变被认为会干扰 15-cys EGF 重复序列形成的二硫键。棕色(浅色)小鼠表现出 TYRP1 稳定性和催化功能降低,导致头发中黑色素含量减少,Kenny 等人(2012) 认为人类 R93C 突变很可能通过类似的机制发挥作用。