载脂蛋白 B mRNA 编辑酶,催化多肽样 2; APOBEC2
APOBEC1样
HGNC 批准的基因符号:APOBEC2
细胞遗传学定位:6p21.1 基因组坐标(GRCh38):6:41,053,202-41,064,891(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
APOBEC1(600130) 是胞苷脱氨酶超家族的成员。Liao 等人通过使用 Apobec1 氨基酸序列作为查询来搜索 EST 数据库(1999) 鉴定了几种人类和小鼠 EST 编码的多肽与 Apobec1 具有序列相似性,主要位于胞苷脱氨酶结构域区域。他们使用其中一个 EST 筛选人类心脏 cDNA 文库,孤立出编码一种蛋白质的 cDNA,并将其命名为 APOBEC2。推导的APOBEC2蛋白有224个氨基酸。基于蛋白催化结构域的胞苷脱氨酶超家族的系统发育分析表明,APOBEC2 在进化上比其他成员更接近 APOBEC1。与APOBEC1相比,APOBEC2具有更长的N端区域和更短的C端区域。Northern印迹分析表明APOBEC2仅在心脏和骨骼肌中表达。在脑、肺、肝脏、胰腺、小肠、结肠、肾、脾、胸腺、白细胞、睾丸、子宫、胎盘或前列腺中未检测到 APOBEC2 表达。
通过对小鼠肌肉的 Northern、Western 和免疫组织化学分析,Sato 等人(2010) 发现 Apobec2 主要在慢肌纤维中表达。Apobec2 表达在新生儿 小鼠成肌细胞和 C2C12 小鼠成肌细胞系的晚期分化过程中增加。小鼠腓肠肌的凝胶过滤显示 Apobec2 形成可溶性四聚体。
▼ 基因功能
廖等人(1999) 发现重组 APOBEC2 在体外测定中具有较低但明确的内在胞苷脱氨酶活性。然而,与 APOBEC1 不同,APOBEC2 不识别 APOB(107730) mRNA 作为底物。
佐藤等人(2010)表明Apobec2的表达随着比目鱼肌和趾长伸肌的去神经而增加,同时伴随着慢肌纤维比例的增加。与 APOBEC1 不同,Apobec2 不结合 RNA,而这是 RNA 编辑酶的一个关键特征。
▼ 生化特征
晶体结构
普罗赫诺等人(2007)报道了APOBEC2的晶体结构。APOBEC2 形成杆状四聚体,与游离核苷酸胞苷脱氨酶(AID; 605257) 的方形四聚体显着不同,APOBEC 蛋白与游离核苷酸胞苷脱氨酶(AID; 605257) 具有相当大的序列同源性。在 APOBEC2 中,单体结构的 2 个长 α 螺旋可防止方形四聚体的形成,并通过 2 个 APOBEC2 二聚体的头对头相互作用促进杆状四聚体的形成。APOBEC 家族成员之间广泛的序列同源性允许 Prochnow 等人(2007) 使用 AID 测试基于 APOBEC2 结构的预测。普罗赫诺等人(2007) 表明,AID 脱氨活性会受到预计会干扰寡聚化和底物接触的突变的影响。该结构表明,高 IgM-2 综合征(605258) 患者的突变如何使 AID 失活,从而导致抗体成熟缺陷。
▼ 测绘
通过辐射混合测绘,Liao 等人。Liao 等(1999) 将人类 APOBEC2 基因对应到染色体 6(1999) 将 小鼠 Apobec2 基因对应到染色体 17,它位于 D17Bir7 的远端和 D17Mit85 的近端。基于小鼠染色体 17 的该区域与人类 6p21 之间的同线性同源性,Liao 等人(1999) 得出结论,人类 APOBEC2 基因定位于 6p21。
▼ 动物模型
佐藤等人(2010) 发现 Apobec2 -/- 小鼠能够存活、表现正常并且具有生育能力。然而,它们在出生时和一生中都比野生型小鼠小。Apobec2 -/- 小鼠随着年龄的增长出现了轻度肌病,并伴有慢肌纤维比例的增加。