POM121 跨膜核孔蛋白 C; POM121C
POM121-2
HGNC 批准的基因符号:POM121C
细胞遗传学定位:7q11.23 基因组坐标(GRCh38):7:75,416,786-75,486,299(来自 NCBI)
▼ 说明
核孔复合体(NPC)介导大分子穿过核膜的运输。POM121C 是 NPC 的一种膜蛋白,预计在 NPC 结构和功能中发挥作用(Funakoshi et al., 2007)。
▼ 克隆与表达
Funakoshi等人(2007)通过检索数据库中的POM121(615753)直系同源物,然后进行HeLa细胞总RNA的5-prime RACE,克隆了全长人POM121C。推导的 1,229 个氨基酸的蛋白质在 N 末端附近有一个跨膜结构域。数据库分析还发现剪接变体编码 985 个氨基酸的亚型,与全长 POM121C 相比,该亚型在 N 末端被截短并且缺乏跨膜结构域。蛋白质印迹和质谱分析显示 HeLa 细胞核膜组分含有全长 POM121 和 POM121C,两者的表观分子质量约为 150 kD。
▼ 基因功能
Funakoshi等人(2007)利用小干扰RNA发现,单独敲低POM121或POM121C会导致HeLa细胞中NPC聚集。除了导致 NPC 聚集外,两者的敲低都会减少核膜上 NPC 的组装。删除分析显示,POM121 和 POM121C 的 N 末端区域(包括跨膜结构域)是将蛋白质靶向 NPC 所必需的。
▼ 基因结构
Funakoshi et al.(2007)确定POM121C基因含有16个外显子。外显子 1 至 3 未翻译,外显子 4 和 5 包含替代起始密码子。
▼ 测绘
Funakoshi等(2007)通过基因组序列分析,将POM121C基因定位到染色体7q11.23上约3.3Mb的POM121基因簇上。POM121是该簇中端粒最长的POM121基因,该簇还包括POM121和POM121B(非转录假基因)。