细胞因子诱导的含 SH2 蛋白;CISH
CIS
HGNC 批准的基因符号:CISH
细胞遗传学定位:3p21.2 基因组坐标(GRCh38):3:50,606,489-50,611,774(来自 NCBI)
▼ 说明
CIS属于细胞因子信号传导抑制因子(SOCS)家族(参见SOCS1;603597),是炎症信号传导的重要负调节因子(Hu et al., 2009)。
▼ 克隆与表达
作为寻找立即早期细胞因子反应基因的一部分,Yoshimura等人(1995)克隆了小鼠Cish,它被证明具有生长抑制功能。Cis是Cish的蛋白质产物,在其唯一结构基序的中间有一个Src同源2(SH2)结构域。
Uchida et al.(1997)分离出人类CISH cDNA。CISH 蛋白由 258 个氨基酸组成。Northern 印迹分析显示,CISH 在各种上皮组织(包括肺和肾)中以 2-kb 转录本的形式表达。
▼ 基因功能
Hu et al.(2009)指出,微小RNA(miRNA)与Toll样受体(TLR;TLR)的微调有关。见603030)介导的炎症反应。Hu et al.(2009)利用 Northern 和 Western blot 分析以及对表达多种 TLR 的人胆管细胞进行 PCR 表明,miRNA MIR98(300810)和 LET7(参见 MIRNLET7A1;605386)通过光电抑制调节CIS蛋白表达。脂多糖(LPS)或隐孢子虫暴露使CIS表达上调,这种上调涉及MIR98和LET7的下调,从而缓解MIR98和LET7介导的CIS的转录抑制。功能获得和丧失研究表明CIS加速了IKBA(NFKBIA;164008)并增强胆管细胞中响应 LPS 刺激或 C. parvum 暴露的 NFKB(参见 164011)激活。Hu et al.(2009)提出LET7和MIR98允许CIS表达以应对微生物挑战。
▼ 基因结构
Uchida et al.(1997)确定CISH基因含有2个内含子,大小约为3 kb和0.4 kb,并且在其3-prime UTR中有3个五聚体mRNA去稳定信号ATTTA重复。
▼ 测绘
Uchida et al.(1997)通过FISH将人类CISH基因定位到染色体3p21.3。小鼠基因与染色体9上的Gnai2基因(139360)紧密连锁,该区域与人类染色体3p21同线。
▼ 分子遗传学
Khor等人(2010)采用病例对照设计,在来自8,402人的血液样本中检测了CISH多态性与主要传染病易感性之间的关联,包括菌血症、结核病(607948)和严重疟疾(611162)。冈比亚、香港、肯尼亚、马拉维和越南。其他人之前曾在其中 1 个或多个样本集合中测试过 20 个其他免疫相关基因。Khor 等人(2010)观察到多个 CISH 多态性的变异等位基因与每个研究人群中每种传染病的易感性增加之间的关联。当所有5个SNP时,位于-639、-292位(rs414171; CISH 相关位点内的 602441.0001)、-163(rs6768330)、+1320(rs2239751)和 +3415(rs622502)在多 SNP 评分中被一起考虑,Khor et al.(2010)发现 CISH 之间存在关联遗传变异和对菌血症、疟疾和结核病的易感性(所有比较的 P = 3.8 x 10(-11)),其中 -292 占关联信号的大部分(P = 4.58 x 10(-7))。与野生型细胞相比,从携带-292变体的成年受试者中获得的外周血单核细胞(PBMC)对白细胞介素2(IL2;IL2;IL2)的刺激表现出减弱的反应。147680)产量,即CISH表达量减少25%至40%。Khor et al.(2010)发现,携带变异 CISH 等位基因的人患其中一种传染病的总体风险至少增加 18%。
▼ 等位基因变异体(1个精选示例):
.0001 结核病,易感性
疟疾,包括疟疾易感性
菌血症,对 2 的敏感性,包括
CISH,-292,AT(rs414171)
Khor et al.(2010)在一项病例对照研究中测试了 CISH 多态性与主要传染病易感性之间的关联,该研究涉及来自冈比亚、香港、凯恩斯、马拉维和越南的 8,402 名个体,发现 rs414171 在 -292 位置相对CISH基因导致对结核病(607948)、疟疾(611162)和侵袭性细菌性疾病(BACTS2)的易感性增加;614383)(p = 4.58 x -10(-7))。此外,与野生型细胞相比,从携带-292变体的成年受试者中获得的外周血单核细胞对白细胞介素2(IL2;IL2;)的刺激表现出减弱的反应。147680),即CISH表达减少25%至40%。