SEEK1 基因

SEEK1
银屑病易感性 1 候选基因 1;PSORS1C1
PSORS1 候选基因 1
染色体 6 开放解读码组 16; C6ORF16

HGNC 批准的基因符号:PSORS1C1

细胞遗传学定位:6p21.33 基因组坐标(GRCh38):6:31,114,800-31,140,​​092(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Holm et al.(2003)鉴定了 2 个 SEEK1 剪接变体。一种变体包含所有 6 个外显子,并编码一个推导的 152 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质与铜锌超二氧化物歧化酶(SOD1;147450)。另一种变体仅包含外显子 1 和 6,并编码推导的 101 个氨基酸蛋白质,具有独特的 5 个氨基酸 N 末端,后跟与 152 个氨基酸亚型的 C 末端相同的序列。Northern blot分析检测到6和1.8 kb的转录本在心脏、胎盘、肝脏、骨骼肌和胰腺中表达较弱,在脑、肺和肾脏中表达非常弱。

▼ 基因结构

Holm et al.(2003)确定SEEK1基因包含6个外显子,跨度为25.2 kb。外显子 1 和 3 包含转录起始位点。

▼ 测绘

Holm et al.(2003)将SEEK1基因定位到染色体6p21.3,与相反链上的SPR1(613526)和CDSN(602593)基因重叠。

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