ATP 结合框,亚科 F,成员 2;ABCF2
类似于酵母 18 的人类序列; HUSSY18
HGNC 批准的基因符号:ABCF2
细胞遗传学定位:7q36.1 基因组坐标(GRCh38):7:151,211,484-151,227,205(来自 NCBI)
▼ 说明
ABC 蛋白家族的成员,例如 ABCF2,参与多种底物的能量依赖性跨膜转运(Allikmets 等人,1996)。
▼ 克隆与表达
使用PGY1的N端ATP结合域(ABCB1; Allikmets等人(1996)利用CFTR(602421)的完整序列查询人类EST数据库,从胎盘和胎儿肝/脾cDNA文库中鉴定出ABCF2的克隆,并将其命名为EST133090。Northern 印迹分析在肺、肝和骨骼肌中检测到 1.3 kb 的转录物。
通过使用酿酒酵母 ORF 搜索 EST 数据库,Stanchi 等人(2001)鉴定出了 ABCF2,他们将其命名为 HUSSY18。推导的 550 个氨基酸的蛋白质与其酵母直向同源物有 53% 的同一性。ABCF2 包含 2 个 ATP 结合域,但似乎缺乏跨膜域。
▼ 基因功能
Tsuda等人(2005)利用微阵列分析、定量PCR和定量RT-PCR发现,与浆液性卵巢囊腺癌相比,透明细胞卵巢腺癌中ABCF2 DNA拷贝数和mRNA水平升高。免疫组织化学分析显示,正常卵巢或子宫内膜异位囊肿表面上皮细胞胞浆或核均无ABCF2表达。相比之下,在检查的 22 个透明细胞病例中,有 19 个在癌细胞的细胞质和核区室中均检测到了 ABCF2 蛋白。15例浆液性细胞病例中,3例胞浆和核均表达ABCF2,4例仅胞核表达,1例仅胞浆表达。在对铂类化疗无反应的透明细胞卵巢癌中,ABCF2 细胞质染色显着高于有反应的透明细胞卵巢癌。
▼ 测绘
Allikmets et al.(1996)利用体细胞杂交、辐射杂交和YAC分析,将ABCF2基因定位到染色体7q35-q36。通过辐射杂交分析,Stanchi等(2001)将ABCF2基因定位到染色体7q36.3-qter。