SMG6 无义介导的 mRNA 衰减因子; SMG6

SMG6, 线虫, 同源
更短的端粒 1，酿酒酵母，A 的同源物；EST1A
KIAA0732

HGNC 批准的基因符号：SMG6

细胞遗传学定位：17p13.3 基因组坐标（GRCh38）：17:2,059,839-2,303,785（来自 NCBI）

▼ 说明

SMG6 参与无义介导的 mRNA 衰变（Fukuhara et al., 2005）。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人（1998）通过对从按大小分级的成人脑 cDNA 文库获得的克隆进行测序，克隆了 SMG6，并将其命名为 KIAA0732。RT-PCR ELISA 检测到脑、肺、卵巢、睾丸、心脏和肾脏中高表达，骨骼肌、肝脏、胰腺和脾中中度表达。

Snow等人（2003）通过在数据库中搜索与S. cerevisiae Est1相似的序列，鉴定出了SMG6，他们将其称为EST1A。推导的 1,388 个氨基酸的蛋白质具有一个包含 2 个四三肽重复（TPR）基序的中心 Est1 同源结构域和一个 C 端 PIN 结构域，可能参与核酸结合或核酸酶活性。7.5 kb EST1A 转录本普遍表达。蛋白质印迹分析检测到 180-kD EST1A 蛋白。

通过在 EST 数据库中搜索线虫 Smg6 的直系同源物，Ohnishi 等人（2003）鉴定出了 SMG6。推导的 1,419 个氨基酸的蛋白质包含 4 个线虫 Smg6 保守区域。蛋白质印迹分析在 HeLa 细胞中检测到内源性 170-kD SMG6 蛋白。细胞分级分离实验表明，SMG6 主要存在于细胞质中，但在用核输出抑制剂处理后，它在细胞核中积累。

Fukuhara et al.（2005）发现SMG5（610962）、SMG6和SMG7（610964）的含TPR区域与14-3-3-zeta（YWHAZ）具有结构相似性；601288），包括保守的磷酸丝氨酸结合位点。

▼ 基因功能

Snow等人（2003）发现EST1A与人细胞系中的端粒酶活性相关，并在兔网织红细胞裂解物中结合人TERT（187270）。与酵母 Est1 不同，EST1A 孤立于端粒酶 RNA 结合 TERT（TERC; 602322）。EST1A 的 N 末端区域结合酵母端粒单链 DNA，更弱地结合人类端粒 DNA。用 EST1A 转染人胚胎肾细胞会导致平均端粒长度缩短，而 EST1A 与 TERT 共转染则导致端粒长度超过单独表达 TERT 的细胞。在端粒酶阴性细胞中转染带有或不带有TERT的EST1A不会导致端粒长度发生变化。

Fukuhara等人（2005）利用pull-down实验表明，重组SMG6的14-3-3-zeta样结构域与体外翻译的UPF1结合。SMG6 磷酸丝氨酸结合位点的突变损害了结合。

Azzalin et al.（2007）证明哺乳动物端粒被转录成含有端粒重复的RNA（TERRA）。TERRA 分子长度不同，从几个亚端粒位点向染色体末端转录，并定位于端粒。Azzalin et al.（2007）还表明，生殖器形态发生缺陷抑制蛋白（SMG）是无义介导的 mRNA 衰变的效应子，在体内富集于端粒，负向调节 TERRA 与染色质的关联，并保护染色体末端免受影响。端粒丢失。因此，Azzalin et al.（2007）得出结论，端粒主动转录成TERRA，SMG因子代表了TERRA调节和端粒完整性维持之间的分子联系。

▼ 基因结构

Hoff et al.（2000）在SMG6基因的5-prime UTR中发现了一个CpG岛。

▼ 测绘

通过序列分析，Hoff et al.（2000）将SMG6基因定位到染色体17p13.3的一个区域，该区域经常显示肿瘤中杂合性的丢失。