DNAJ/HSP40 同源物,亚科 C,成员 21;DNAJC21

DNAJ 同源亚族 A,成员 5;DNAJA5

HGNC 批准的基因符号:DNAJC21

细胞遗传学定位:5p13.2 基因组坐标(GRCh38):5:34,929,559-34,958,964(来自 NCBI)

▼ 说明

DNAJC21 属于高度保守的蛋白质家族,主要通过刺激伴侣蛋白 HSP70(参见 HSPA1A, 140550)家族成员的 ATPase 活性来参与蛋白质的折叠、解折叠、易位和降解(Qiu 总结)等,2006)。

▼ 克隆与表达

Chen等人(2004)在对人胎脑cDNA文库进行大规模序列分析时克隆了DNAJC21,他们将其称为DNAJA5。推导的 531 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 62.1 kD。它有一个 N 端 J 结构域,其中有一个绝对保守的 HPD 三肽,后面是几个 GF 残基和 2 个 C2H2 型锌指,一个位于中心区域,另一个位于 C 末端。人类蛋白与大鼠和线虫直向同源物分别具有 38.8% 和 33.2% 的同一性。RT-PCR 在人脑、胎盘、肾脏和胰腺中检测到 DNAJA5,但在心脏、肺、肝脏或骨骼肌中未检测到 DNAJA5。Tummala et al.(2016)通过数据库分析发现DNAJC21在人体组织中普遍表达。免疫组织化学分析在 HeLa 和 293T 细胞的细胞质和细胞核中检测到 DNAJC21。在细胞核内,它主要定位于核仁。

▼ 基因功能

Tummala et al.(2016)发现,在抑制rRNA合成后,DNAJC21从细胞质转位至细胞核。对转染 HeLa 细胞核提取物的免疫沉淀分析表明,荧光标记的 DNAJC21 与前体 45S rRNA(参见 RNR1 180450)以及 60S 核糖体成熟因子 PA2G4(602145)、ZNF622(608694)和 HSPA8(600816)相互作用。通过小干扰 RNA 敲低 HeLa 细胞中的 DNAJC21 会导致 PA2G4 在细胞质中积聚、细胞形态延长和细胞死亡。重新引入 DNAJC21 可以挽救细胞活力并恢复正常的 PA2G4 运输。Tummala et al.(2016)得出结论,DNAJC21参与核仁rRNA生物发生和核输出因子PA2G4的细胞质循环以促进60S核糖体子单元的成熟。

▼ 基因结构

Chen et al.(2004)确定DNAJC21基因至少有12个外显子,跨度超过25.6 kb。

▼ 测绘

Chen等(2004)通过基因组序列分析,将DNAJC21基因定位到染色体5p13-p12。

Hartz(2016)根据DNAJC21序列(GenBank AK022694)与基因组序列(GRCh38)的比对,将DNAJC21基因定位到染色体5p13.2。

▼ 分子遗传学

4名无血缘关系的儿童,均为近亲父母所生,患有骨髓衰竭综合征-3(BMFS3; 617052),Tummala et al.(2016)鉴定出DNAJC21基因的纯合突变(617048.0001-617048.0004)。这些突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。其中三个突变预计会导致蛋白质被截短并丧失功能;第四个是错义突变。1个截短突变(R173X;R173X)的体外功能表达研究 617048.0001)表明它不与60S核糖体成熟因子相互作用,与功能丧失一致。错义突变的研究(P32A;617048.0003)显示与HSPA8(600816)交互失败。与对照相比,来自 1 名截短突变患者(617048.0004)的 T 细胞在促有丝分裂刺激后表现出生长障碍,对放线菌素 D 的反应细胞活力降低,并且 rRNA 子单元水平降低。研究结果表明,突变导致核糖体生物发生缺陷。

Dhanraj et al.(2017)在来自3个不相关家族的4名BMFS3患者中鉴定出DNAJC21基因的纯合突变,其中包括无义突变(Q174X;617048.0005)和一个错义(K34E; 617048.0006)突变和基因内缺失。这些突变是通过全外显子组测序和纯合性图谱相结合发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。患者细胞的 DNAJC21 蛋白水平下降,与功能丧失一致。没有对变体进行额外的功能研究。

D\'Amours et al.(2018)在 5 名无关的 BMFS3 患者中鉴定出 K34E 突变的纯合性。没有对该变体进行功能研究。

▼ 等位基因变异体(6个精选例子):

.0001 骨髓衰竭综合症 3

DNAJC21、ARG173TER

一名近亲父母出生的法国女孩,患有骨髓衰竭综合征-3(BMFS3; 617052),Tummala et al.(2016)在DNAJC21基因中发现了一个纯合的c.517C-T转换(c.517C-T, NM_001012339.2),导致arg173-to-ter(R173X)取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离,并且在 ExAC 数据库中未发现。体外功能表达研究表明,R173X 突变体无法与 DNAJC21 伴侣相互作用,这与功能丧失一致。此外,突变转录本预计会导致体内无义介导的 mRNA 衰减。

.0002 骨髓衰竭综合症 3

DNAJC21, 983+1G-T

一名阿尔及利亚血统近亲父母所生女孩患有骨髓衰竭综合征-3(BMFS3; 617052),Tummala et al.(2016)在DNAJC21基因中发现了一个纯合的c.983+1G-T颠换(c.983+1G-T, NM_001012339.2),导致剪接位点缺陷,外显子跳跃7、移码和提前终止(Gly299AlafsTer2)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在ExAC数据库中杂合状态下以低频率(120,170个等位基因中的5个)被发现。

.0003 骨髓衰竭综合症 3

DNAJC21、PRO32ALA

一名巴基斯坦血统近亲父母所生男孩,患有骨髓衰竭综合征-3(BMFS3; 617052),Tummala et al.(2016)在DNAJC21基因中发现了纯合的c.94C-G颠换(c.94C-G, NM_001012339.2),导致pro32-to-ala(P32A)高度替换HPD 基序中位于 J 结构域核心的保守残基。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离,并且在 ExAC 数据库中未发现。该突变预计会破坏蛋白质相互作用,体外研究表明它无法与 HSPA8(600816)相互作用。

.0004 骨髓衰竭综合症 3

DNAJC21、GLU265TER

一名巴基斯坦血统近亲父母所生女孩患有骨髓衰竭综合征-3(BMFS3; 617052),Tummala et al.(2016)在DNAJC21基因中鉴定出纯合的c.793G-T颠换(c.793G-T, NM_001012339.2),导致DNA中出现glu265-to-ter(E265X)取代-结合域。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离,并且在 ExAC 数据库中未发现。与对照相比,患者来源的 T 细胞表现出缺乏 DNAJC21 免疫反应性、有丝分裂刺激后生长障碍、响应放线菌素 D 的细胞活力降低以及 rRNA 子单元水平降低。所有这些发现都与核糖体生物发生的功能丧失和缺陷一致。

.0005 骨髓衰竭综合症 3

DNAJC21、GLN174TER

一名阿富汗近亲父母(家庭1)所生女孩患有骨髓衰竭综合征-3(BMFS3;617052),Dhanraj et al.(2017)在DNAJC21基因的外显子5中鉴定出纯合的c.520C-T转换(c.520C-T, NM_001012339.2),导致gln174-to-ter(Q174X)取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。与对照组相比,患者细胞的 DNAJC21 蛋白水平显着降低。

.0006 骨髓衰竭综合症 3

DNAJC21、LYS34GLU

2 名同胞,由加拿大原住民血统的近亲父母所生(家庭 2),患有骨髓衰竭综合征 3(BMFS3;Dhanraj et al.(2017)在DNAJC21基因的外显子2中发现了纯合的c.100A-G转换,导致J结构域中高度保守的残基发生lys34-to-glu(K34E)取代(617052)。该突变是通过纯合性作图和直接桑格测序相结合发现的,与该家族中的疾病分离。与对照组相比,患者细胞的 DNAJC21 蛋白水平降低了约 40%。

D\'Amours et al.(2018)在 5 名无关的 BMFS3 患者中发现了纯合 K34E 突变。没有对该变体进行功能研究。

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