CACTIN,剪接体 C 复合物子单元; CACTIN

仙人掌交互子,果蝇,同源物
NY-REN-24
染色体 19 开放解读码组 29; C19ORF29

HGNC 批准的基因符号:CACTIN

细胞遗传学定位:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:3,610,645-3,626,790(来自 NCBI)

▼ 说明

Cactin is a negative regulator of innate immune signaling and a functional component of the pre-mRNA splicing machinery(Atzei et al., 2010; Suzuki et al., 2016; Zanini et al., 2017).

▼ 克隆与表达

Scanlan等(1999)通过SEREX(重组cDNA表达库的血清学分析)筛选人肾癌cDNA文库,克隆了CACTIN,命名为NY-REN-24。RT-PCR 分析检测到 CACTIN 在所有 6 个测试的人体组织中表达:肺、睾丸、小肠、乳腺、肝脏和胎盘。序列分析表明 CACTIN 定位于细胞核。

Lin等人(2000)克隆了果蝇仙人掌。预测的果蝇仙人掌蛋白具有富含带电残基的 N 末端结构域、3 个潜在的二分核定位信号和 3 个卷曲螺旋结构域。果蝇 CACTIN 与预测的 758 个氨基酸的人类 CACTIN 蛋白具有 41% 的氨基酸一致性。CACTIN 在植物和动物中是保守的,所有 CACTIN 直向同源物在其 C 端半部都有一个高度保守的区域。Northern印迹分析显示Cactin在雌性果蝇中表达,但在雄性果蝇中表达较弱。在雌性中,仙人掌在卵巢和整个胚胎发生过程中以相对较高的水平存在。

Atzei et al.(2010)利用RT-PCR表明Cactin在小鼠大脑和外周器官中广泛表达。

Atzei et al.(2010)利用RT-PCR发现cactin在斑马鱼早期胚胎发育的各个阶段都有表达。

▼ 测绘

Gross(2019)根据CACTIN序列(GenBank AY917150)与基因组序列(GRCh38)的比对,将CACTIN基因定位到染色体19p13.3。

▼ 基因功能

Lin等人(2000)利用酵母2-杂交和免疫共沉淀分析,发现果蝇中的Cactin与I-kappa-B的直系同源物Cactus(参见164008)存在相互作用。突变 Cactus-A2 等位基因杂合的果蝇中 Cactin 的过度表达增强了突变表型,胚胎致死率和腹侧化显着增加。

Atzei et al.(2010)发现人CACTIN的过度表达会抑制细胞响应促炎刺激的NFKB激活(见164011),而CACTIN的敲低则会增强这种激活。同样,CACTIN 负向调节 TLR 介导的 IRF3(603734)和 IRF7(605047)激活以及 IRF 响应基因的诱导。免疫共沉淀和免疫荧光分析表明CACTIN不与细胞质IKBA(NFKBIA;164008),而是与核IKBL(NFKBIL1; NFKBIL1; 164008)共定位并相互作用。601022),被发现可以抑制脂多糖诱导的 NFKB 和 IRF 通路的激活。缺乏核定位序列的 CACTIN 被排除在细胞核之外,无法与 IKBL 相互作用,并且对 TLR 信号传导的抑制作用大大降低。

Suzuki et al.(2016)发现人CACTIN和TRIM39(605700)直接结合,并且TRIM39的B框结构域是相互作用所必需的。HEK293T 细胞的分级分析表明 CACTIN 定位于细胞核和细胞质。TRIM39 主要在细胞核中与 CACTIN 相互作用,以不依赖泛素化的方式稳定 CACTIN。进一步的分析表明,CACTIN 在 NFKB 信号通路中提供了负反馈环,因为 TRIM39 通过稳定 CACTIN 负向调节 NFKB 介导的转录活性。

Zanini et al.(2017)通过敲低分析表明,CACTIN 对于支持人类细胞的细胞增殖、基因组稳定性、正确的核形态和染色体分离至关重要。RNA 测序分析揭示了 CACTIN 耗尽细胞中数千个前 mRNA 的剪接缺陷。特别是sororin(CDCA5;的剪接)609374)在 CACTIN 耗尽的细胞中受到影响,导致未加工的 sororin 前 mRNA 积累。无内含子 sororin cDNA 的表达在不同程度上恢复了与 CACTIN 缺失相关的缺陷,表明 CACTIN 主要通过促进 sororin 前体 mRNA 的准确剪接来支持正常的染色体凝聚和核结构。质谱分析和免疫共沉淀实验表明,CACTIN 在物理和功能上与 DHX8(600396)和 SRRM2(606032)(可能在细胞核中)相互作用,以支持前 mRNA 剪接机制。

▼ 动物模型

Atzei et al.(2010)发现cactin的敲除导致斑马鱼80%的胚胎致死率。幸存的斑马鱼表现出后体形态发生缺陷的表型,表现为身体弯曲和尾巴缩短。

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