含钾通道四聚化结构域的蛋白质 5;KCTD5

HGNC 批准基因符号:KCTD5

细胞遗传学定位:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:2,682,523-2,709,030(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

使用 HeLa 细胞 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选,Weger 等人(2007)鉴定了一种新的 cDNA,命名为 KCTD5,编码推导的 234 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质与腺病毒的大调节蛋白 Rep78 和 Rep68 相互作用。相关病毒-2(AAV-2)。KCTD5含有N端电压门控钾通道四聚化结构域(T1)。当存在辅助病毒(例如腺病毒)时,Rep68 和 Rep78 蛋白对于 AAV-2 DNA 复制和 AAV 表达的调节至关重要。它们是 ATP 依赖性解旋酶,具有位点和链特异性核酸内切酶活性,以及​​序列特异性 DNA 结合蛋白,负责 AAV-2 在染色体 19 上的位点特异性整合。Rep78/Rep68 的表达也可以抑制 HIV -1 生产。

▼ 基因功能

Weger等人(2007)利用免疫共沉淀实验证实了KCTD5与Rep68/Rep78蛋白的相互作用。通过缺失突变体实验,他们表明这种相互作用需要Rep68的N端DNA结合结构域和核定位信号周围的区域以及KCTD5的T1四聚化结构域和C端氨基酸204-234。免疫荧光实验表明,在没有 Rep 蛋白表达的情况下,KCTD5 几乎完全位于细胞质中;在 Rep78 或 Rep68 表达后,发现 KCTD5 主要存在于细胞核中。KCTD5 过表达完全消除了 Rep68 介导的 HIV-LTR 驱动的荧光素酶报告基因的转录后激活。Weger et al.(2007)得出结论,KCTD5通过结合Rep68/Rep78蛋白,是受感染细胞的细胞核和细胞质中AAV生命周期的潜在调节剂。

Brockmann et al.(2017)利用单倍体人类细胞中的随机诱变检查了一系列细胞过程,例如转录诱导、蛋白质丰度和剪接的调节、信号级联和表观遗传修饰。这种可扩展的、基于测序的程序阐明了控制蛋白质状态的遗传景观,识别了导致非常狭窄的表型效应的基因和导致广泛的表型后果的基因。由此产生的基因接线图将 E3 连接酶底物转换因子 KCTD5 鉴定为 AKT(参见 AKT1, 164730)途径的负调节因子,AKT 途径是癌症中经常失调的关键信号级联。KCTD5 缺陷细胞显示 S473 磷酸化 AKT 水平升高,这不能归因于对经典途径成分的影响。为了揭示该表型的遗传要求,Brockmann et al.(2017)迭代分析了敲除背景下与 AKT 活性相关的调控网络。这种基因修饰筛选暴露了 KCTD5 表型的抑制因子,并从机制上证明 KCTD5 通过触发从 G-β-γ 异二聚体(参见 GNG5, 600874)解离来充当 G 蛋白偶联受体(GPCR)信号传导的开关。 G-α 子单元(参见 GNAI1, 139310)。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将KCTD5基因定位到染色体16(RH66453)。

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