调整因子 X, 7; RFX7
RFXDC2
HGNC 批准的基因符号:RFX7
细胞遗传学定位:15q21.3 基因组坐标(GRCh38):15:56,087,280-56,245,082(来自 NCBI)
▼ 说明
RFX7 是转录因子调节因子 X(RFX)家族的成员(参见 RFX1, 600006)(Aftab et al., 2008)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析寻找含有RFX DNA结合域(DBD)的序列,Aftab等人(2008)鉴定出RFX7和5个相应的哺乳动物直向同源物。推导的 1,281 个氨基酸蛋白是 DNA 结合蛋白翼螺旋家族的成员,与 DBD 具有高度相似性,并且与 RFX5 具有最高的总体相似性。RFX7 包含一个翼状螺旋区域(预计与 DNA 大沟相互作用)和一个保守螺旋 H3(预计与小沟相互作用)。EST数据库分析显示RFX7在人肾肿瘤组织、胸腺、大脑和胎盘中表达。在 SAGE 文库中检测到小鼠 Rfx7 的类似广泛表达模式。
Harris等人(2021)指出,RFX7在人脑发育过程中在大脑皮层中高表达。RFX7 在内侧神经节隆起的中间神经元中表达;它在抑制性和兴奋性神经元中都有发现。
▼ 基因功能
Aftab et al.(2008)在大规模酵母2-杂交蛋白质组分析中没有发现明显的RFX7蛋白相互作用。
▼ 基因结构
Aftab et al.(2008)确定RFX7基因含有9个外显子。
▼ 测绘
通过数据库分析,Aftab et al.(2008)将RFX7基因定位到染色体15q21.3。
▼ 分子遗传学
13名无血缘关系的常染色体显性智力发育障碍患者中71名行为异常(MRD71;620330),Harris 等人(2021)在 RFX7 基因中鉴定了 13 个不同的从头杂合突变(参见例如 612660.0001-612660.0004)。在外显子组测序鉴定出突变后,通过共同努力确定了这些患者。有6个移码,5个无义突变,2个错义突变;gnomAD 中没有一个。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究,但考虑到大多数突变是移码或无意义的,作者提出以单倍体不足为功能丧失效应的发病机制。
Ledger等人(2023)在一名患有MRD71的21个月大男孩身上发现了RFX7基因的从头杂合错义突变(P1028S;612660.0005)。该突变是通过基于三重奏的全外显子组测序发现的。尚未进行该变体的功能研究和患者细胞的研究,但预测其具有致病性。
▼ 等位基因变异体(5个精选例子):
.0001 智力发育障碍,常染色体显性遗传 71,伴有行为异常
RFX7、1-BP DEL、NT3032
一名3岁女孩(RFX7-1)患有常染色体显性智力发育障碍-71,伴有行为异常(MRD71;620330),Harris等人(2021)在RFX7基因中发现了一个从头杂合的1-bp缺失(c.3032del,NM_022841.5),预计会导致移码和提前终止(Ser1011IlefsTer19)。该突变是通过外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。尚未进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致单倍剂量不足的功能丧失。该患者患有小头畸形、轻度整体发育迟缓、智力发育受损、语言迟缓和畸形特征。
.0002 智力发育障碍,常染色体显性遗传 71,伴有行为异常
RFX7、TYR906TER
一名3岁男孩(RFX7-3),患有常染色体显性遗传性智力发育障碍-71,伴有行为异常(MRD71;620330),Harris等人(2021)在RFX7基因中鉴定出一个从头杂合的c.2718C-A颠换(c.2718C-A, NM_022841.5),导致tyr906-to-ter(Y906X)取代。该突变是通过外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。尚未进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致单倍剂量不足的功能丧失。该患者患有整体发育迟缓、智力发育受损、自闭症谱系障碍、多动症和畸形特征。
.0003 智力发育障碍,常染色体显性遗传 71,伴有行为异常
RFX7、1-BP DUP、NT2113
一名7岁男孩(RFX7-5),患有常染色体显性遗传性智力发育障碍-71,伴有行为异常(MRD71;620330),Harris 等人(2021)在 RFX7 基因中发现了一个从头杂合的 1-bp 重复(c.2113dup, NM_022841.5),预计会导致移码和提前终止(Thr705AsnfsTer12)。该突变是通过外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。尚未进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致单倍剂量不足的功能丧失。患者患有整体发育迟缓、智力发育受损、患有自闭症谱系障碍;还注意到了大头畸形。
.0004 智力发育障碍,常染色体显性遗传 71,伴有行为异常
RFX7、PRO1028LEU
一名14岁男孩(RFX7-10)患有常染色体显性智力发育障碍-71,伴有行为异常(MRD71;620330),Harris et al.(2021)在RFX7基因中发现了一个从头杂合的c.3083C-T转换(c.3083C-T, NM_022841.5),导致pro1028到leu(P1028L)的取代高度保守的残基。该突变是通过外显子组测序发现的,但在 gnomAD 数据库中并不存在。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。患者存在发育迟缓、智力发育受损、睡眠障碍、肌阵挛发作、肌张力障碍、视神经萎缩、小头畸形、脑部影像学基底节异常以及畸形特征。
.0005 智力发育障碍,常染色体显性遗传 71,伴有行为异常
RFX7、PRO1028SER
一名21个月大的常染色体显性智力发育障碍-71男孩,伴有行为异常(MRD71;620330),Ledger et al.(2023)在RFX7基因中发现了一个从头杂合的c.3082C-T转换(c.3082C-T, NM_022841.7),导致pro1028到ser(P1028S)的取代高度保守的残基。该突变是通过基于三重奏的全外显子组测序发现的。尚未进行该变体的功能研究和患者细胞的研究,但预测其具有致病性。患者因小头畸形(-4.17 SD)、整体发育迟缓、言语迟缓、运动障碍和动眼神经失用而发育迟缓。脑成像显示进行性脑室扩大和白质丢失。