聚合酶 III,RNA,G-LIKE 子单元;POLR3GL

RNA 聚合酶 III,32-KD 子单元,β
RPC32-β
RNA 聚合酶 III,子单元 C7-LIKE

HGNC 批准的基因符号:POLR3GL

细胞遗传学定位:1q21.1 基因组坐标(GRCh38):1:145,964,690-145,978,848(来自 NCBI)

▼ 说明

核 DNA 的转录由 RNA 聚合酶 Pol I、Pol II 和 Pol III 介导。Pol III 专门指导参与转录、剪接和其他细胞过程的小非编码 RNA 的转录。POLR3GL 和 POLR3G(617456)是替代的 Pol III 子单元(Haurie et al., 2010)。

▼ 克隆与表达

Haurie等人(2010)利用RPC32-α(POLR3G)的序列查询人类数据库,鉴定出了POLR3GL,他们将其称为RPC32-β。推导的 218 个氨基酸蛋白与 RPC32-α 有 51% 的同一性。RNA斑点印迹分析在所有正常人体组织和肿瘤细胞系中检测到RPC32-β,而RPC32-α仅在人胚胎干细胞(ESC)和肿瘤细胞中表达。表位标记的 RPC32-α 和 RPC32-β 定位于转染的 HeLa 细胞的细胞核。

▼ 基因结构

Renaud et al.(2014)确定POLR3GL基因有7个外显子。

▼ 测绘

Renaud et al.(2014)确定POLR3GL基因与染色体1q21.1上的ANKRD34A基因处于头对头的方向。

▼ 基因功能

Haurie et al.(2010)发现含有RPC32-α和RPC32-β的纯化人RNA Pol III在转录5S rRNA(RN5S1;RN5S1;180420)、tRNA-met(参见TRNAM1、180621)、腺病毒相关RNA、7SK RNA(RN7SK; 601515)。然而,在人类细胞系中通过短发夹 RNA 敲低 RPC32-α 或 RPC32-β 揭示了不同的细胞效应。Huh7肝癌细胞中RPC32-α的敲低几乎没有影响,而RPC32-β的敲低则显着降低了细胞生长并显着增加了细胞死亡。RPC32-α(而非 RPC32-β)的过表达增强了 IMR90 人成纤维细胞转化、集落形成和贴壁依赖性生长,并增强了 Pol III 转录基因的表达。RPC32-α(而非 RPC32-β)的过表达也显着增加了与细胞存活、肿瘤生长和转移相关的几种 Pol III 转录基因的表达,同时减少了几种具有肿瘤抑制活性的基因的表达。Haurie et al.(2010)得出结论,RPC32-β是人Pol III一般形式的子单元,是细胞存活所必需的,并且RPC32-α在未分化的ESC和转化细胞中发挥作用。

Renaud et al.(2014)利用免疫共沉淀和质谱分析发现 POLR3G 和 POLR3GL 存在于单独纯化的 HeLa 细胞 Pol III 复合物中。POLR3G和POLR3GL在不同条件和不同细胞类型中表达差异,其中含有POLR3G的Pol III在分裂细胞中相对更丰富。然而,两者都与POLR3D(187280)相互作用并占据相同的靶基因。POLR3G启动子而非POLR2GL启动子结合转录因子MYC(190080)。

▼ 分子遗传学

身材矮小、牙齿少、面容畸形、运动迟缓的同卵双胞胎姐妹(SOFM;619234),Terhal et al.(2020)鉴定了 POLR3GL 基因(617457.0001)剪接突变的纯合性。Terhal等人(2020)在一位不相关但受影响相似的女性中鉴定出POLR3GL(617457.0002)中相同剪接突变和另一个剪接突变的复合杂合性。

Beauregard-Lacroix 等人(2020)在一名 3 岁法裔加拿大女孩身上发现了 POLR3GL 基因(R120X;R120X; 617457.0003)。

▼ 等位基因变异体(3个精选例子):

.0001 身材矮小、牙齿少、面部畸形和运动迟缓

POLR3GL、IVS4AS、GA、-1

19岁同卵双胞胎姐妹(P1和P2),身材矮小,少牙,面容畸形,运动迟缓(SOFM;619234),Terhal et al.(2020)鉴定了 POLR3GL 基因内含子 4 的剪接突变(c.326-1G-A,NM_032305.1)的纯合性。他们未受影响的父母是该突变的杂合子。家谱分析显示,父母之间关系疏远,有 7 代人的共同祖先。患者 P2 血液样本的 RNA-seq 显示 POLR3GL 转录物中外显子 5 的跳跃。在一名无关但类似受影响的 36 岁女性(P3)中,Terhal 等人(2020)鉴定了 POLR3GL 内含子 1 中 c.326-1G-A 剪接突变和另一个剪接突变的复合杂合性(c.-) 41-1G-A);她的父母均具有其中一种突变的杂合子。患者 P3 血液样本的 RNA-seq 显示 POLR3GL 转录物中仅部分包含外显子 2 或外显子 5;PCR 分析证实不存在包含外显子 2 和外显子 5 的全长 POLR3GL。家谱研究没有发现这两个家族之间存在关系的证据。gnomAD 数据库中报道了两种 POLR3GL 变体,但仅处于杂合状态且等位基因频率非常低(c.-41-1G-A, 0.00002475; c.326-1G-A,0.000007955)。所有 3 名患者均表现出轴向骨内膜骨质增生。

.0002 身材矮小、牙齿少、面部畸形和运动迟缓

POLR3GL、IVS1AS、GA、-1

讨论一名36岁身材矮小、少牙女性(P3)复合杂合状态的POLR3GL基因内含子1剪接​​突变(c.-41-1G-A, NM_032305.1) 、畸形相和运动迟缓(SOFM; 619234),Terhal 等人(2020),参见 617457.0001。

.0003 身材矮小、牙齿少、面部畸形和运动迟缓

POLR3GL、ARG120TER

一名 3 岁法裔加拿大女孩,患有身材矮小、少牙、面容畸形和运动迟缓(SOFM;Beauregard-Lacroix 等人(619234)也表现出早衰症的一些特征,Beauregard-Lacroix 等人(2020)鉴定出 POLR3GL 基因外显子 5 中 c.358C-T 转换(c.358C-T, NM_032305.2)的纯合性,从而得出arg120-to-ter(R120X)替换。她未受影响的父母都是该突变的杂合子,该突变在 gnomAD 数据库中的 3 个个体中存在杂合性。对患者血液样本的 qRT-PCR 分析显示,与对照相比,POLR3GL mRNA 水平降低了 84%,表明存在无义介导的衰变。

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