异戊烯基二磷酸酯 δ 异构酶 2;IDI2

IPPI2

HGNC 批准的基因符号:IDI2

细胞遗传学定位:10p15.3 基因组坐标(GRCh38):10:1,018,910-1,025,859(来自 NCBI)

▼ 说明

5-碳异戊烯基二磷酸(IPP)及其高亲电子异构体二甲基烯丙基二磷酸(DMAPP)是合成香叶基二磷酸、法尼基二磷酸以及最终非甾醇产品和胆固醇的基础材料。异戊烯基二磷酸异构酶(EC 5.3.3.2),例如IDI2,将非反应性IPP转化为其反应性异构体DMAPP(Clizbe等人总结,2007)。

▼ 克隆与表达

Breitling et al.(2003)在人类和小鼠体内发现了一种串联重复,产生了 IDI1(604055)和 IDI2 基因。推导的IDI2蛋白含有与IDI1不同的催化中心,并且IDI1和IDI2都具有可能的C端过氧化物酶体靶向信号。Idi2 缺乏过氧化物酶体靶向信号。EST 数据库分析预测 IDI1 在人类和小鼠组织中普遍表达,而 IDI2 似乎几乎只在骨骼肌中表达。

Clizbe et al.(2007)利用RT-PCR克隆了人类IDI2,其中包含一个684-bp的ORF。对 12 种人体组织的 Northern 印迹分析仅在骨骼肌中检测到 1.9 kb 的转录物。相比之下,IDI1 显示出普遍表达。实时定量 PCR 检测到 IDI2 仅在骨骼肌中表达,其表达水平高于 IDI1。荧光标记的 IDI1 和 IDI2 与过氧化物酶体标记在转染的 HeLa 细胞中呈点状分布共定位。

▼ 基因功能

在酵母中,单拷贝异戊烯基二磷酸异构酶基因 Idi1 的缺失是致命的。Clizbe et al.(2007)发现在Idi1缺失的酵母中表达人类IDI2可以挽救致死表型。部分纯化的重组人IDI2在酵母中表达,在体外将IPP异构化为DMAP,最适pH为8.0,在Mn(2+)存在下活性最大。在小鼠骨骼肌中,暴露于降胆固醇药物他汀类药物和贝特类药物后,Idi2 mRNA 显着降低,而 Idi1 和 HMG-CoA 还原酶(HMGCR;) mRNA 水平显着降低。142910)不变。给小鼠喂食高脂肪饮食也显着减少了骨骼肌 Idi2 mRNA,但增加了 Idi1 mRNA。Idi2在成肌细胞中的过度表达减少了胆固醇、脂肪酸和多甘醇的合成,并减少了细胞总胆固醇。Idi2 的过度表达也会降低 Hmgcr 活性,但不会降低 Hmgcr mRNA。

▼ 基因结构

Breitling et al.(2003)确定IDI1和IDI2基因均含有5个外显子,其中包括一个非编码的第一个外显子。他们在两个基因的内含子序列和基因之间的插入序列中发现了几个随机插入的 Alu 重复序列。

▼ 测绘

Breitling et al.(2003)通过基因组序列分析,将IDI1和IDI2基因定位到染色体10p的亚端粒区域。他们将小鼠 Idi1 和 Idi2 基因定位到染色体 13 的亚着丝粒区域,该区域与人类染色体 10 的亚端粒区域具有同源性。 Breitling et al.(2003)还鉴定了 HT009 基因(IDI2AS1;615391)在人类的相反链上,但不是老鼠。HT009 的外显子与 IDI1 和 IDI2 重叠。

Hartz(2013)根据IDI2序列(GenBank BC040651)与基因组序列(GRCh37)的比对,将IDI2基因定位到染色体10p15。

▼ 进化

Breitling et al.(2003)发现,IDI基因在高等哺乳动物中经历了古老的复制事件,但在低等脊椎动物(如鱼类和原索动物)中则不然。第二个副本 IDI2 在人类和小鼠中比 IDI1 更加分歧且进化得更快。

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