MAF 转录调节子 RNA，非编码；MAFTRR

长基因间非编码 RNA MAF4
lincRNA MAF4
lincMAF4

HGNC 批准的基因符号：MAFTRR

细胞遗传学定位：16q23.2 基因组坐标（GRCh38）：16:79,721,312-79,770,532（来自 NCBI）

▼ 说明

MAFTRR是一种染色质相关的长基因间非编码RNA，特异性针对CD4（186940）阳性T辅助性T-1（Th1）细胞。其表达与Th2相关转录因子MAF（177075）的表达呈负相关（Ranzani et al., 2015）。

▼ 克隆与表达

Ranzani等人（2015）通过对13个淋巴细胞亚群的cDNA进行高通量测序和从头转录组重建，鉴定了563个新的lincRNA，其中包括MAFTRR，他们将其称为lincMAF4。他们指出，lincRNA 基因比蛋白质编码基因（包括受体编码基因）与淋巴细胞亚群聚集得更紧密。Ranzani et al.（2015）发现MAFTRR在CD4阳性Th1淋巴细胞亚群中特异性表达。

▼ 基因功能

Ranzani等（2015）发现邻近基因MAFTRR和MAF的表达量呈负相关，Th1细胞高表达MAFTRR，低表达MAF，而Th2和Th17细胞低表达MAFTRR，高表达MAF 。MAFTRR的表达与其近端上游蛋白编码基因CDYL2（618816）和DYNLRB2（607168）的表达没有相关性。通过激活的 CD4 阳性初始 T 细胞中的小干扰 RNA 敲低 MAFTRR 导致 MAF 表达增加。与 Th1 细胞相比，Th2 细胞表现出 RNA 聚合酶 II 结合增加，MAF 启动子区域 lys4 处三甲基化的组蛋白丰度增加。MAFTRR的敲低还导致IL4（147780）和GATA3（131320）的表达增加，这是Th2细胞的特征。亚细胞分级分离显示染色质中 MAFTRR 富集。RNA免疫沉淀分析检测MAFTRR与染色质修饰剂EZH2（601573）和LSD1（KDM1A）的相互作用；609132）。MAFTRR 的敲低与 EZH2 和 LSD1 丰度降低以及 MAF 启动子处 EZH2 酶活性降低相关。Ranzani et al.（2015）得出结论，MAFTRR和MAF的基因组区域之间存在长距离相互作用，MAFTRR作为支架招募EZH2和LSD1并调节MAF启动子处的EZH2酶活性，从而调节MAF转录。

▼ 测绘

Gross（2015）根据MAFTRR序列（GenBank HG508324）与基因组序列（GRCh38）的比对，将MAFTRR基因定位到染色体16q23.2。

Ranzani et al.（2015）报道MAFTRR基因位于MAF基因上游139.5 kb。