TAP-结合蛋白样; TAPBPL
Tap-结合蛋白相关蛋白;TAPBPR
TAPBP相关蛋白
胰蛋白酶相关蛋白
HGNC 批准的基因符号:TAPBPL
细胞遗传学定位:12p13.31 基因组坐标(GRCh38):12:6,451,649-6,472,006(来自 NCBI)
▼ 说明
Tapasin,或TAPBP(601962),是可变-恒定Ig超家族的成员,它将主要组织相容性复合体(MHC)I类分子与抗原加工相关的转运蛋白(TAP; 见170260)在内质网(ER)中。TAPBP 基因位于染色体 6p21.3 上的 MHC 复合体附近。TAPBPL 是 Ig 超家族的成员,定位于染色体 12p13.3,该区域与 MHC 有一定的旁系同源性(Teng et al., 2002)。
▼ 克隆与表达
Teng等(2002)通过以TAPBP为探针的数据库检索、PAC克隆分析和5-prime RACE分析,鉴定出编码TAPBPR的cDNA。推导的 468 个氨基酸的蛋白质与 TAPBP 有 22% 相同。它包含一个N端信号序列,一个与Ig样或纤连蛋白弱相似的区域(FN1; 135600)样结构域、IgV 结构域、IgC1 结构域、跨膜区和 42 个残基的细胞质尾部,无 ER 保留基序。与 TAPBP 不同,TAPBPR 在其 N 末端不具有保守的 I 类分子结合区。RT-PCR 分析检测到小鼠组织中广泛表达,其中肾脏、脂肪组织、唾液腺、胎盘、卵巢和肠道组织中的表达水平升高。荧光显微镜显示主要在内质网中表达,但也在细胞表面上表达。免疫沉淀和免疫印迹分析支持表面表达的 52-kD 蛋白质的存在,与预测的大小相对应。Teng et al.(2002)得出结论,TAPBPR 可能通过一种未知的机制保留在 ER 中。
▼ 基因结构
Teng等(2002)通过基因组序列分析确定TAPBPR基因包含7个外显子,跨度10 kb。与 TAPBP 一样,TAPBPR 启动子区域缺少 TATA 和 CAATT 框。与TAPBP相比,TAPBPR还缺乏γ-干扰素(IFNG;147570)归纳元件,这一发现得到了泛函分析的支持。
▼ 生化特征
晶体结构
Thomas和Tampe(2017)提出了TAPBPR-MHC I复合物的X射线结构,它描绘了催化的中心步骤。TAPBPR 通过重塑 MHC I α-2-1-螺旋区域、稳定空的结合凹槽并将环插入凹槽中来干扰肽结合,从而发挥肽选择器的作用。Thomas 和 Tampe(2017)得出的结论是,该复合物解释了 MHC I 特异性伴侣的突变如何导致抗原加工缺陷,并提出了肽校对的统一机制。
Jiang et al.(2017)报道了MHC I与肽编辑器TAPBPR(tapasin同源物)复合物的晶体结构。TAPBPR 重塑 MHC I 的肽结合沟,导致低亲和力肽的释放。变化包括凹槽松弛、键结合袋的修改以及结构域调整。Jiang et al.(2017)得出结论,该结构捕获了 MHC I 的肽接受状态,并为 TAPBPR 以及 Tapasin 的肽编辑机制提供了见解。
▼ 测绘
Teng等(2002)通过基因组序列分析,将TAPBPL基因定位于染色体12p13.3的CD27(TNFRSF7;TNFRSF7;TNFRSF7)之间。186711)和VAMP1(185880)基因。
▼ 基因功能
Morozov et al.(2016)通过检测重组人TAPBPR与人和小鼠MHC-I分子的结合相互作用,发现TAPBPR结合了HLA-A*02:01(见142800)和肽中的其他MHC-I分子-游离状态或负载低亲和力肽时。TAPBPR 结合增强了 MHC-I 的肽结合。表面等离子体共振和荧光偏振分析表明,TAPBPR/MHC 复合物解离为与 MHC-I 分子结合的肽。突变分析表明,TAPBPR 与无肽 HLA-A2 的相互作用取决于 TAPBPR 的第二和第三结构域以及 N 结构域的成分,并且 TAPBPR 和 tapasin 具有结构相似性和与 MHC-I 结合的相似模式。Morozov et al.(2016)得出结论,TAPBPR 具有稳定 MHC-1 肽受体构象的作用,从而允许肽编辑。