BRCA1 基因 2 的邻居,非编码; NBR2

长非编码 RNA NBR2
长链非编码RNANBR2

HGNC 批准的基因符号:NBR2

细胞遗传学定位:17q21.31 基因组坐标(GRCh38):17:43,125,557-43,153,671(来自 NCBI)

▼ 说明

NBR2是一种介导能量应激反应的长链非编码RNA(lncRNA)(Liu et al., 2016)。

▼ 克隆与表达

Xu等人(1997)从胎盘cDNA文库中克隆了人NBR2。预测的 NBR2 蛋白含有 112 个氨基酸,计算分子量为 12.4 kD。Northern 印迹分析在人体组织中检测到多个 NBR2 转录本,与选择性剪接一致。跨物种 DNA 杂交在灵长类动物中检测到 NBR2,但在其他物种(包括小鼠)中未检测到。

Liu et al.(2016)指出NBR2是一种lncRNA。通过分级分析,他们表明 NBR2 定位于人肾腺癌细胞的细胞核和细胞质。

▼ 基因结构

Xu et al.(1997)确定NBR2基因包含5个外显子,跨度约为30 kb。

Suen et al.(2005)报道NBR2和BRCA1(113705)基因共享一个56 bp的片段作为双向启动子。作者鉴定了 NBR2 的一个 18 bp 转录抑制元件,位于 NBR2 第一个内含子的 948 bp 处。阻遏元件与转录因子结合并关闭 NBR2 转录,但不影响 BRCA1 转录。

▼ 测绘

Gross(2019)根据NBR2序列(GenBank BC107773)与基因组序列(GRCh38)的比对,将NBR2基因定位到染色体17q21.31。

Xu et al.(1997)确定NBR2基因位于BRCA1基因和假BRCA1基因之间,并且与BRCA1以头对头方向排列。NBR2 和 BRCA1 的转录起始位点相距 218 bp。

▼ 基因功能

Liu et al.(2016)发现NBR2在能量应激反应中调节细胞增殖、凋亡和自噬。在能量胁迫下,NBR2 的表达通过 AMPK(见 602739)激活的前馈机制进行调节,因为 AMPK 在能量胁迫下促进 NBR2 的表达,而 NBR2 的表达反过来调节 AMPK 的激活。NBR2 响应能量应激的表达增强了其与 AMPK 的相互作用,激活了 AMPK,并促进了 AMPK 激酶活性。另一方面,AMPK 激活介导 NBR2 在增殖、凋亡和自噬中的功能。

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