核糖体移码的无移位抗病毒抑制剂;SHFL
登革热病毒产生的抑制剂; RYDEN
染色体 19 开放解读码组 66; C19ORF66
HGNC 批准的基因符号:SHFL
细胞遗传学定位:19p13.2 基因组坐标(GRCh38):19:10,086,317-10,093,243(来自 NCBI)
▼ 说明
C19ORF66,即RYDEN,是一种干扰素刺激基因(ISG),可抑制登革热病毒(DENV;DENV;参见 614371),以及其他病毒(Suzuki et al., 2016)。
▼ 克隆与表达
Suzuki 等人(2016)使用来自 I 型 IFN 刺激的 HeLa 细胞的 cDNA 文库进行功能增益筛选(参见 IFNA1, 147660),鉴定出 C19ORF66,他们将其命名为 RYDEN,作为赋予细胞对 DENV 抗性的基因。人体细胞。预测的 RYDEN 蛋白由 291 个氨基酸组成,包含 8 个 α 螺旋和 7 条 β 链。它在其 N 端半部具有核定位序列(NLS)和锌带结构域,在其 C 端半部具有核输出信号(NES)、卷曲螺旋基序和富含 glu 的区域。IFN 刺激后,内源性 RYDEN 定位于 HepG2 细胞的细胞质,并且在其他几种人类细胞系中也观察到了细胞质定位。仅当包含推定 NES 的 C 末端区域被删除时,RYDEN 才定位于细胞核。
▼ 基因功能
Suzuki et al.(2016)利用免疫印迹分析表明,HeLa 细胞中 RYDEN 表达在 IFNA/IFNW1(147553)、IFNG(147570)或 IFNL(607403)处理后增加。定量 RT-PCR 显示,在所有检查的人类细胞系中,通过 I 型 IFN 处理,RYDEN 上调。对人类细胞系的攻击表明,所有 4 种 DENV 血清型在 RYDEN 存在下均受到抑制。用 RYDEN 处理小发夹 RNA 的细胞可逆转对 DENV 复制的抵抗力。RYDEN的敲低并不影响ISG15(147571)的表达,表明RYDEN不是IFN反应的调节剂。亲和纯化和质谱分析表明RYDEN与mRNA结合蛋白PABPC1(604679)和LARP1(612059)相互作用。通过小干扰 RNA 敲低 PABPC1 或 LARP1 可减少 DENV 复制,表明这些蛋白促进 DENV 表达。突变分析表明,RYDEN 的中心区域与 PABPC1 相互作用是 RYDEN 抗 DENV 活性以及 RYDEN 与 DENV RNA 结合所必需的。Suzuki et al.(2016)得出的结论是,RYDEN是一种抗病毒ISG,可被I、II和III型IFN上调,并可能干扰DENV的转录机制,从而抑制病毒复制。
▼ 基因结构
Suzuki et al.(2016)确定C19ORF66基因包含8个外显子,跨度7.1 kb。
▼ 测绘
Suzuki et al.(2016)指出C19ORF66基因定位于染色体19p13.2。