SEPTIN 6; SEPT6
SEP2,果蝇,同源物; SEP2
KIAA0128
此条目中代表的其他实体:
SEPT6/MLL 融合基因,包括
HGNC 批准的基因符号:SEPTIN6
细胞遗传学定位:Xq24 基因组坐标(GRCh38):X:119,615,724-119,693,168(来自 NCBI)
▼ 说明
Septin,例如 SEPT6,是保守的 GTP 结合蛋白,可作为动态、可调节的支架来招募其他蛋白。它们参与膜动力学、囊泡运输、细胞凋亡和细胞骨架重塑(Kim et al., 2007)。
▼ 克隆与表达
Nagase等人(1995)通过筛选骨髓细胞系cDNA文库中编码大蛋白的cDNA,克隆了SEPT6,他们将其命名为KIAA0128。推导的424个氨基酸的蛋白质与CDC10(SEPT7;603151)并含有 ATP/GTP 结合位点基序。Northern印迹分析检测到几乎无处不在的表达,其中在胸腺中表达水平最高。
▼ 基因功能
Low and Macara(2006)指出,脓蛋白的特定组合可以在体外和体内异源寡聚化并形成丝。他们利用荧光共振能量转移、尺寸排阻色谱和多角度光散射分析,对SEPT2(601506)、SEPT6和SEPT7形成的复合物进行了表征。SEPT6和SEPT7通过平行的卷曲螺旋结构域相互作用,SEPT2通过其C端卷曲螺旋结构域与SEPT6相互作用。
Kim等(2007)通过酵母2-杂交筛选,发现丙型肝炎病毒(HCV; 参见609532)NS5b RNA聚合酶与SEPT6相互作用。SEPT6还与另一种NS5b结合蛋白HNRNPA1(164017)相互作用,表明三分子复合物的存在。HNRNPA1 或 SEPT6 的敲低可抑制 HCV 复制。
Kremer et al.(2007)表明,HeLa细胞中SEPT2、SEPT6和SEPT7的敲低导致肌动蛋白应力纤维解体,细胞失去极性。他们发现这些septin通过SOCS7(608788)发挥作用,限制NCK(NCK1;NCK1;)的核积累。600508)。在没有脓蛋白丝的情况下,SOCS7 将 NCK 招募到细胞核中。此外,细胞质中 NCK 的消耗引发了肌动蛋白应力纤维的溶解和细胞极性的丧失。Kremer et al.(2007)也表明septins、SOCS7和NCK之间的关联在DNA损伤检查点反应中发挥作用。NCK 在 DNA 损伤后进入细胞核,是紫外线(UV)诱导的细胞周期停滞所必需的。此外,核NCK对于p53(TP53;TP53;191170)响应紫外线引起的 DNA 损伤。Kremer et al.(2007)得出结论,septins、SOCS7 和 NCK 是信号通路的一部分,该信号通路将 DNA 损伤反应的调节与细胞骨架耦合起来。
Sharma等人(2013)利用RT-PCR分析发现microRNA-766(MIR766; 301062)位于SEPT6的内含子内,并被转录为包含SEPT6 mRNA的更大转录物的一部分。通过Western blot分析,他们发现老年受试者来源的细胞中SIRT6(606211)的表达通过MIR766的转录后调节而降低。MIR766 的表达在老年受试者的真皮成纤维细胞中较高,并且与 SIRT6 蛋白水平呈负相关。SEPT6 表达的增加导致老年受试者真皮成纤维细胞中 MIR766 的水平升高。随后,较高水平的 MIR766 会降低转录后 SIRT6 水平。
▼ 生化特征
晶体结构
Sirajuddin et al.(2007)展示了人SEPT2 G结构域和异源三聚体人SEPT2-SEPT6-SEPT7复合物的晶体结构。这种结构揭示了一种通用的双极聚合物构建块,由延伸的 G 结构域组成,通过相邻核苷酸结合位点和/或氨基和羧基末端延伸之间的保守相互作用形成寡聚物和丝。出乎意料的是,X射线晶体学和电子显微镜显示预测的卷曲线圈不参与或不需要复杂和/或细丝的形成。不对称异源三聚体头对头结合形成六聚体单元,该六聚体单元沿丝轴非极化,但旋转不对称。Sirajuddin et al.(2007)得出结论,隔膜丝的结构与其他细胞骨架结构有根本的不同。
▼ 测绘
Nagase等人(1995)通过对人类/啮齿动物杂交组的PCR分析,将SEPT6基因定位到X染色体。Kadkol et al.(2006)指出SEPT6基因对应到染色体Xq24。
▼ 细胞遗传学
Kadkol et al.(2006)描述了一名患有急性髓性白血病(AML;AML;601626),染色体11q23和Xq24之间发生重排。FISH分析显示MLL(159555)断裂,RT-PCR分析证实MLL/SEPT6融合转录物的表达。