起始结构域蛋白 7; STARD7

妊娠滋养细胞肿瘤蛋白 1;GTT1

HGNC 批准的基因符号:STARD7

细胞遗传学定位:2q11.2 基因组坐标(GRCh38):2:96,184,859-96,208,827(来自 NCBI)

▼ 说明

STARD7属于STARD2(PCTP;606055)类固醇生成急性调节蛋白相关脂质转移(START)结构域蛋白亚家族。这些蛋白质在细胞内膜之间转移磷脂(Yang et al., 2015 总结)。

▼ 克隆与表达

Durand等(2004)通过筛选胎盘和HeLa细胞cDNA文库,克隆了STARD7,他们将其命名为GTT1。推导的 295 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 34.7 kD。它与 PCTP 具有序列相似性,并包含保守的 START 结构域和多个潜在的磷酸化位点。Northern 印迹和 RT-PCR 分析显示,3.5 kb 转录物在胎盘绒毛膜癌细胞系中表达最高,而在正常早期胎盘和葡萄胎细胞系中表达较低。在肿瘤细胞系中检测到可变表达。数据库分析揭示了几种潜在的剪接变体。

通过数据库分析,Horibata和Sugimoto(2010)鉴定出了全长的人类STARD7,他们将其命名为STARD7-I。与之前鉴定的 STARD7 亚型(作者称为 STARD7-II)相比,STARD7-I 多了 75 个 N 端氨基酸,包括线粒体靶向信号(MTS)。STARD7-I 的分子量估计为 43.1 kD。脉冲追踪实验表明,在胞质核糖体中翻译的 STARD7-I 被导入线粒体,然后裂解 MTS,产生与 STARD7-II 无法区分的 33 kD 成熟形式。免疫荧光和分级分析表明,STARD7-I 定位于线粒体和细胞质,而 STARD7-II 定位于细胞质。

Yang等人(2017)利用Western blot分析表明,在BEAS-2B人细支气管上皮细胞中,STARD7-I靶向线粒体,N端75个氨基酸肽被切割,生成STARD7-II。

Horibata et al.(2017)在 STARD7-1 中紧接着 MTS 后发现了一个跨膜(TM)结构域。STARD7-1通过TM结构域锚定在线粒体外膜(OMM)上,但TM结构域对于定位到细胞质也很重要。MTS 和 TM 结构域足以将 STARD7-1 锚定到 OMM 上,但不足以将其释放到细胞质中。膜整合对于 STARD7-1 促进磷脂酰胆碱(PC)转移至线粒体至关重要。质谱分析表明,STARD7 通过 2 个孤立的蛋白水解步骤被切割两次,产生成熟形式。

Saita等人(2018)发现STARD7同时定位于线粒体的胞质和膜间隙(IMS),但它并不像之前报道的那样锚定于OMM。STARD7是PARL(607858)的底物,调控STARD7的双重定位。在胞质核糖体上合成后,STARD7 前体首先被输入线粒体,然后再重新分布到胞质中。STARD7前体在其MTS和TM结构域内分别被MPP(603131)和PARL切割,形成成熟蛋白。成熟的 STARD7 保留在线粒体 IMS 中以完成导入,并且不释放到细胞质中。相反,在输入过程中,PARL 介导的 STARD7 在线粒体内膜上的加工与 STARD7 TM 结构域侧翼的带负电荷的氨基酸相结合,允许将成熟 STARD7 的一部分释放到细胞质中。TIMM23(605034)也促进了 STARD7 定位到线粒体,因为 TIMM23 的消耗促进了 STARD7 释放到细胞质中。

▼ 基因功能

Horibata and Sugimoto(2010)表明STARTD7-I是PC特异性脂质转运蛋白,促进PC转运至线粒体。

Horibata et al.(2016)发现,Stard7减少或缺失会降低HEPA-1细胞中Mtco1(516030)的水平,损害线粒体呼吸,改变线粒体PC含量和组成,降低ATP含量和生长速率。这些缺陷可以通过 Stard7 的外源表达来弥补。此外,Stard7 的缺失减少了线粒体重超复合物的形成并改变了线粒体形态。

Yang等(2017)发现BEAS-2B细胞中STARD7的敲低产生过多的活性氧并引起线粒体DNA损伤,导致线粒体结构和功能改变以及上皮屏障通透性增加。

Saita等人(2018)对STARD7缺陷的HeLa细胞进行了表征,发现STARD7在IMS中充当线粒体内脂质转移蛋白,以确保PC在内膜中的积累。STARD7 定位到 IMS 对于保留线粒体的这种功能是必要且充分的。

▼ 基因结构

Durand et al.(2004)确定STARD7基因至少包含9个外显子,跨度近30 kb。

▼ 测绘

Durand等(2004)通过基因组序列分析,将STARD7基因定位到染色体2p12-p11.2。然而,Gross(2015)根据STARD7序列(GenBank BC007894)与基因组序列(GRCh38)的比对,将STARD7基因定位到染色体2q11.2。

▼ 分子遗传学

来自22个无关家庭的158名患有家族性成人肌阵挛性癫痫-2(FAME2;607876),Corbett et al.(2019)在STARD7基因(616712.0001)的内含子1中发现了杂合的5-bp重复扩展(ATTTC)n。除了插入异常(ATTTC)n 重复之外,受影响的个体还存在内源性(ATTTT)n 重复的可变扩展,作者指出,这在其他形式的 FAME 中也有类似的分子发现。扩增重复最初是使用重复扩增检测技术来评估来自3个先前报道的大FAME家族的全基因组测序数据,这些家族显示出与染色体2q的连锁(家族1由Crompton等人报道,2012年,家族3由Suppa等人报道) ., 2009, 以及 Saint-Martin 等人报道的家族 19, 2008)。然后,作者使用特异性重复引物 PCR(RP-PCR),在来自另外 19 个家族的受影响个体中鉴定出了扩展的(ATTTC)n 重复。在约 100 个对照 DNA 样本中未发现(ATTTC)n 重复扩增。在所有 158 名(ATTTC)n 扩增检测呈阳性的个体中,内源性(ATTTT)n 重复序列的启动仅从内源重复序列的端粒末端成功。无法确定所有患者的重复次数,但对 2 名不相关患者的长读长测序表明重复大小存在体细胞差异。该队列包括2个先前被鉴定为ADRA2B基因具有ins/del变异的家庭(104260.0001)(Guerrini et al., 2001;De Fusco et al., 2014),表明 ADRA2B 变异等位基因不是致病原因。对家族 1 的 4 个成纤维细胞系的分析显示,与对照相比,STARD7 mRNA 或蛋白质表达没有差异,来自 2 个家族的患者来源的成纤维细胞的 RNA-seq 数据显示,受影响和未受影响个体之间的 STARD7 基因表达没有显着差异。作者推测疾病机制可能与 RNA 毒性有关。

▼ 动物模型

Yang et al.(2015)发现大多数纯合的Stard7 -/- 小鼠都会出现胚胎致死现象。幸存的 Stard7 -/- 雄性不育,但幸存的雄性和雌性具有正常的预期寿命。杂合子 Stard7 +/- 小鼠在卵清蛋白致敏后出现 Th2 介导的肺部炎症增加、粘液细胞化生、气道高反应性和特异性 IgE。致敏的 Stard7 +/- 小鼠还表现出肺上皮通透性增加和促炎树突状细胞活化,这可以在转移到野生型小鼠时赋予表型。肺部过敏反应的增强伴随着自发性特应性皮炎的年龄依赖性发展。Yang et al.(2015)提出STARD7是暴露于环境的组织中保护途径的一个组成部分。

Yang等(2017)发现,小鼠肺气道上皮细胞中Stard7的靶向缺失改变了线粒体的结构和功能,导致上皮屏障完整性改变。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 癫痫,家族性成人肌阵挛,2

STARD7,(ATTTC)n重复扩展

来自22个无关家庭的158名患有家族性成人肌阵挛性癫痫-2(FAME2;607876),Corbett et al.(2019)在STARD7基因的内含子1中发现了一个杂合的5-bp重复扩展(ATTTC)n。受影响的个体除了插入异常的(ATTTC)n重复序列外,还存在内源性(ATTTT)n重复序列的可变扩增。扩展重复最初是使用重复扩展检测技术来评估来自 3 个先前报告的显示与染色体 2q 连锁的大 FAME 家族的全基因组测序数据而确定的。然后,作者使用特异性重复引物 PCR(RP-PCR),在来自另外 19 个家族的受影响个体中鉴定出了扩展的(ATTTC)n 重复。在约 100 个对照 DNA 样本中未发现(ATTTC)n 重复扩增。对家族 1 的 4 个成纤维细胞系的分析显示,与对照相比,STARD7 mRNA 或蛋白质表达没有差异,来自 2 个家族的患者来源的成纤维细胞的 RNA-seq 数据显示,受影响和未受影响个体之间的 STARD7 基因表达没有显着差异。作者推测疾病机制可能与 RNA 毒性有关。

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