自噬相关蛋白 101;ATG101
染色体 12 开放解读码组 44; C12ORF44
HGNC 批准的基因符号:ATG101
细胞遗传学定位:12q13.13 基因组坐标(GRCh38):12:52,065,300-52,077,495(来自 NCBI)
▼ 说明
巨自噬是溶酶体介导的细胞质蛋白、细胞器和大分子降解的分解代谢过程。ATG 蛋白,例如 ATG101,是自噬体形成所必需的,自噬体是在与溶酶体融合之前包围并隔离细胞质货物的双膜囊泡(Mercer 等,2009)。
▼ 克隆与表达
通过在数据库中搜索果蝇Atg13(615088)相互作用蛋白的直向同源物,Mercer et al.(2009)鉴定出了人类ATG101。
Hosokawa et al.(2009)利用质谱分析鉴定与小鼠自噬体蛋白Ulk1(603168)和Ulk2(608650)共免疫沉淀的蛋白,然后通过数据库分析和HEK293T细胞总RNA的PCR,克隆了人ATG101。推导的 218 个氨基酸的蛋白质被预测为胞质亲水蛋白。Hosokawa et al.(2009)指出ATG101在酿酒酵母中没有直系同源物。
▼ 基因功能
Mercer等人(2009)利用蛋白质相互作用分析发现ATG101与ATG13以及巨自噬蛋白ULK1和FIP200(RB1CC1; 606837)。免疫沉淀分析显示,ATG13、ATG101、ULK1 和 FIP200 形成复合物,在 HEK293 细胞中饥饿诱导的自噬后,该复合物重新分布为点状结构。在饥饿的 HEK293 细胞中敲低 ATG13 或 ATG101 可减少脂质修饰形式 LC3B(MAP1LC3B;609604)与自噬体相关。ATG13 是 ATG101 在自噬复合体中稳定和定位所必需的。ATG13 和 ATG101 是自噬体形成所必需的,但下游囊泡运输或与溶酶体融合不需要。
Hosokawa 等人(2009)利用凝胶过滤和 HeLa 细胞裂解物的蛋白质印迹分析,孤立鉴定出 ATG101 是包含 ULK1、ATG13 和 FIP200 的约 3-MDa 自噬复合物的一部分。还检测到 ATG101 仅与 ATG13 形成复合物以及作为单体。HeLa 细胞中饥饿未改变 ATG101 在 3 个级分中的分布。小干扰RNA的使用表明,ATG13介导ATG101和ULK1之间的相互作用,并且ATG101是ATG13和ULK1的稳定性和基础磷酸化所必需的。ATG101 的敲低抑制了含有 LC3 的自噬体斑点的形成。
▼ 测绘
Hartz(2013)根据ATG101序列(GenBank AK021835)与基因组序列(GRCh37)的比对,将ATG101基因定位到染色体12q13.13。