LSM10、U7 小核 RNA 相关蛋白; LSM10
HGNC 批准基因符号:LSM10
细胞遗传学定位:1p34.3 基因组坐标(GRCh38):1:36,393,436-36,397,908(来自 NCBI)
▼ 说明
小核核糖核蛋白(snRNPs)参与mRNA加工,由小核RNA加上几个Sm和/或Sm样蛋白(例如SNRPB,182282)组成,形成环形核心。LSM10 是 U7 snRNP 特异性的 14-kD Sm 样子单元(参见 RNU7-1, 617876),在加工复制依赖性组蛋白前体 mRNA 的 3 素茎环结构中具有特定作用(Pillai)等,2001)。
▼ 克隆与表达
Pillai et al.(2001)通过质谱分析鉴定用U7 snRNP从HeLa细胞核裂解物中纯化的蛋白质,然后进行EST数据库分析,鉴定出LSM10。推导的 123 个氨基酸的蛋白质具有 Sm 基序 1 和 2 以及 C 端 GR 二肽基序。LSM10与Sm蛋白D1(SNRPD1;SNRPD1)有显着相似性 601063)和D3(SNRPD3;601062)。通过 SDS-PAGE 检测,LSM10 的表观分子量为 14 kD。HeLa 细胞的免疫组织化学分析将 LSM10 定位于细胞核内的卡哈尔小体,并显示被排除在核仁之外。数据库分析仅在脊椎动物中检测到 LSM10 的直系同源物。
▼ 基因功能
Pillai等人(2001)通过对HeLa细胞核提取物进行免疫沉淀分析,证实LSM10是U7 snRNP的子单元。突变分析表明,LSM10 与 U7 snRNP 的关联取决于 U7 RNA 中的非经典 Sm 蛋白结合位点。
Wagner 和 Marzluff(2006)利用小干扰 RNA 发现,ZFP100(617908)的敲低(而不是 LSM10 或 LSM11(617910))会降低报告基因的活性,模拟组蛋白 mRNA 3-prime 茎环结构的加工。HeLa 或 U2OS 细胞中 ZFP100、LSM10 或 LSM11 的耗尽导致细胞周期停滞在 G1 期。LSM10 或 LSM11 的过表达(而非 ZFP100)增加了 U7 snRNP 的细胞含量。相反,ZFP100 的过表达增加了 U7 snRNP 在处理组蛋白 mRNA 3-prime 茎环结构中的活性。Wagner and Marzluff(2006)得出结论,LSM10和LSM11增加了U7 snRNP的细胞含量,而ZFP100特异性地增加了U7 snRNP在组蛋白mRNA加工中的活性。
▼ 测绘
Pillai et al.(2001)通过基因组序列分析,将LSM10基因定位到染色体1。
Hartz(2018)根据LSM10序列(GenBank BC007623)与基因组序列(GRCh38)的比对,将LSM10基因定位到染色体1p34.3。