HPS6 溶酶体细胞器复合体 2 的生物发生,子单元 3; HPS6

HPS6 GENE
RUBY-EYE, 小鼠, 同源; RU

HGNC 批准的基因符号:HPS6

细胞遗传学定位:10q24.32 基因组坐标(GRCh38):10:102,065,349-102,068,036(来自 NCBI)

▼ 说明

HPS6基因编码参与溶酶体相关细胞器复合体2(BLOC2)生物发生的蛋白质(Zhang et al., 2003)。

▼ 克隆与表达

在小鼠体内,至少有 16 种自然发生的赫曼斯基-普德拉克综合征(HPS;203300),其中 9 个已在分子水平上进行了表征。张等人(2003)利用位置候选和转基因拯救方法鉴定了ruby-eye-2(ru2;)中突变的基因。607521)和 ruby​​-eye(ru),2 个“模仿”HPS 模型。他们确定这些基因是分别在具有 HPS5 和 HPS6 的个体中突变的人类基因的直系同源物。这两个基因仅在高等真核生物中发现。人类 ru 直系同源物含有 775 个氨基酸,与小鼠蛋白 80% 相同。小鼠组织的 Northern 印迹分析在所有测试的组织中检测到 2.6-kb ru 转录物,其中骨骼肌中的表达最低。张等人(2003)得出结论,ru和ru2代表了一类新的基因,它们在高等生物中进化来控制高度特化的溶酶体相关细胞器的合成。

▼ 基因功能

通过免疫共沉淀和酵母2-杂交分析,Zhang等人(2003)表明ru和ru2蛋白在复合物中直接相互作用,他们将其称为“溶酶体相关细胞器复合物-2的生物发生”或BLOC2。

▼ 基因结构

通过基因组序列分析,Zhang et al.(2003)确定单个大外显子包含了小鼠ru基因和人类HPS6基因的整个开放解读码组。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Zhang et al.(2003)将小鼠ru基因定位到染色体19,将人类HPS6基因定位到染色体10q24.32。

▼ 分子遗传学

一名 39 岁比利时女性患有 Hermansky-Pudlak 综合征(HPS6; 614075),Zhang et al.(2003)在HPS6基因中发现了一个纯合的4-bp缺失(607522.0001)。

Schreyer-Shafir 等人(2006)在患有 Hermansky-Pudlak 综合征的以色列贝都因大家族的一个大的血缘关系成员中,主要表现出眼皮肤白化病,Schreyer-Shafir 等人(2006)鉴定出 HPS6 基因(607522.0002)中 1-bp 插入的纯合性。

Huizing et al.(2009)在4名无关的Hermansky-Pudlak综合征患者中鉴定出HPS6基因纯合或复合杂合突变(607522.0003-607522.0007)。除 1 个突变外,所有突变均导致蛋白质被截短。该表型的特点是早发性眼球震颤、眼皮肤白化病和轻度出血素质,但没有肺纤维化、肉芽肿性结肠炎或肾脏受累。然而,2名患者出现胃肠道症状。对患者黑色素细胞进行的体外细胞研究表明,黑色素生成蛋白的细胞质分布模式异常,并且 TYRP1(115501)通过质膜的运输增加,表明溶酶体相关细胞器存在缺陷。

Miyamichi等人(2016)在2名患有眼皮肤白化病且缺乏血小板致密体的日本姐妹中鉴定出1-bp缺失(607522.0009)和无义突变(Q680X)的复合杂合性;607522.0010)在HPS6基因中。

▼ 动物模型

张等人(2003)指出,ru 和 ru2 小鼠在外观上完全没有区别。尽管两只小鼠的溶酶体形态均正常,但肾脏近曲小管细胞将溶酶体酶分泌到尿液中的速率大大降低。血小板致密颗粒非常缺乏关键成分,例如血清素和腺嘌呤核苷酸,导致血小板功能异常和出血时间延长。另一种亚细胞器,即肥大细胞颗粒,在 ru 小鼠的肥大细胞质膜上进行不受调节的“亲吻并奔跑”融合。

▼ 等位基因变异体(10个精选例子):

.0001 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6、4-BP DEL、CODON 571、TCTG

一名 39 岁比利时女性患有 Hermansky-Pudlak 综合征(HPS6; 614075),Zhang et al.(2003)鉴定了HPS6基因密码子cys571至leu572处的4-bp缺失(TCTG)纯合性。该突变导致移码,并在密码子 610 处截断无义多肽,导致 C 末端蛋白质丢失 30%。

.0002 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6,1-BP INS,1066G

以色列贝都因人大家庭的受影响成员患有赫曼斯基-普德拉克综合征-6(HPS6;614075),Schreyer-Shafir et al.(2006)在HPS6基因中鉴定出纯合的1-bp插入(1066insG)。表达研究没有显示无义介导的 mRNA 衰减,因此可能产生了截短的蛋白质。该表型有些独特,主要特征是眼皮肤白化病。血小板的电子显微镜研究显示不存在致密体,与 HPS 一致,共聚焦显微镜显示 LAMP3(605883)在患者成纤维细胞中分布异常,表明溶酶体相关细胞器的运输异常。这些发现扩大了与 HPS6 基因突变相关的表型。

.0003 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6、2-BP DEL、1865TG

一名 36 岁爱尔兰和德国血统女性患有 Hermansky-Pudlak 综合征 6(HPS6; 614075),Huizing et al.(2009)在HPS6基因中发现了一个纯合的2-bp缺失(1865delTG),导致移码、提前终止以及3-prime末端约20%的蛋白质丢失。除了部分白化病、眼球震颤和出血并发症外,该患者还接受过多次腹部疝气、肛门闭锁和臀肌皮瓣修复手术。她还有其他健康问题,包括 4 次流产、子宫内膜异位症、频繁上呼吸道和尿路感染、失禁、偏头痛和听力损失。但她没有肉芽肿性结肠炎,肾功能和肺功能也正常。

.0004 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6、GLN305TER

一名 22 岁北欧血统男性患有 Hermansky-Pudlak 综合征 6(HPS6; 614075),Huizing et al.(2009)鉴定了HPS6基因中913C-T转变的复合杂合性,导致gln305-to-ter(Q305X)取代,以及包含HPS6基因的20-kb大缺失。他出生时就有眼球震颤,3个月大时被诊断出患有眼皮肤白化病。HPS 在 16 岁时被诊断出来。

.0005 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6,1-BP DUP,238G

一名德国和荷兰血统的 13 岁女孩患有 Hermansky-Pudlak 综合征 6(HPS6; 614075),Huizing等人(2009)鉴定了HPS6基因中2个突变的复合杂合性:1-bp重复(238dupG),导致移码和提前终止,以及815C-T转变,导致thr272-到伊莱(T272I; 607522.0006)在高度保守区域的替代。在 484 个对照染色体中未发现 T272I 突变。

.0006 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6、THR272ILE

讨论HPS6基因中的thr272-to-ile(T272I)突变,该突变在赫曼斯基-普德拉克综合征-6(HPS6; Huizing 等人(2009),参见 614075),参见 607522.0005。

.0007 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6、GLN75TER

一名 52 岁意大利男性患有 Hermansky-Pudlak 综合征 6(HPS6; 614075),Huizing et al.(2009)鉴定了HPS6基因中2个突变的复合杂合性:223C-T转变,导致gln75-to-ter(Q75X)取代,以及1234C-T转变,导致gln412-to-ter(Q412X; 607522.0008)替代。他出生时患有旋转性眼球震颤,童年时​​有瘀伤,但直到44岁时才被诊断出患有胃肠道症状和眼皮肤白化病。实验室研究显示缺铁性贫血和维生素 B12 水平较低。没有间质性肺疾病或肾脏受累。据报道,两姐妹受到影响。

.0008 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6、GLN412TER

讨论赫曼斯基-普德拉克综合征-6(HPS6;HPS6;Huizing 等人(2009),参见 614075),参见 607522.0007。

.0009 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6,1-BP DEL,1898C

2位日本姐妹患有赫曼斯基-普德拉克综合征-6(HPS6; 614075),表现为眼皮肤白化病和血小板致密体缺失,Miyamichi等人(2016)鉴定出HPS6基因突变的复合杂合性:1-bp缺失(c.1898delC,NM_024747.5),导致预测的移码导致提前终止密码子(Pro633LeufsTer76),以及c.2038C-T转变,导致gln680-to-ter(Q680X;607522.0010)替代。他们未受影响的父母均具有 1 个突变杂合子,这两种突变均未在 575 个内部外显子组或 ExAC 或外显子组变异服务器数据库中发现。然而,在人类遗传变异数据库中发现 Q680X 变异的等位基因频率为 0.003。

.0010 赫曼斯基-普德拉克综合症 6

HPS6、GLN680TER

讨论 HPS6 基因中的 c.2038C-T 转换(c.2038C-T, NM_024747.5),导致 gln680-to-ter(Q680X) 取代,在 2 个日本姐妹中发现复合杂合状态赫曼斯基-普德拉克综合征6(HPS6; Miyamichi 等人(2016),参见 614075),参见 607522.0009。

Tags: none