NLR FAMILY,半胱天冬酶招募 DOMAIN-CONTAINING 3;NLRC3
NLR 系列,包含卡域 3
NLR 系列,含卡 3
CATERPILLER 16.2
CLR16.2
HGNC 批准的基因符号:NLRC3
细胞遗传学定位:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:3,539,033-3,577,403(来自 NCBI)
▼ 说明
NLR(核苷酸结合、富含亮氨酸重复序列(LRR))传感器家族具有多种功能,包括炎症和抗炎作用。NLRC3 是 NLR 家族成员,通过与受体或其下游转换因子相互作用来抑制信号分子,从而减弱免疫细胞的激活(Schneider et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
通过数据库检索CIITA(MHC2TA)相关序列;600005),Harton et al.(2002)获得了NLRC3的部分序列,他们称之为CLR16.2。Conti等人(2005)使用基于该部分CLR16.2序列的引物对Raji淋巴瘤细胞mRNA进行RT-PCR,然后进行5-prime和3-prime RACE,孤立出全长CLR16.2。预测的 1,065 个氨基酸的蛋白质缺乏 N 端热蛋白结构域,但具有 N 端核苷酸结合结构域(NBD)和 14 个 C 端 LRR。对人类细胞系的 RT-PCR 分析检测到 CLR16.2 在各种免疫细胞系中表达,特别是在 T 细胞中,但在上皮细胞系中表达较差。免疫荧光显微镜显示转染的 HeLa 细胞中有细胞质表达。
▼ 基因结构
Conti et al.(2005)确定CLR16.2基因包含15个编码外显子。一个大的外显子编码 NBD,14 个较小的外显子编码 LRR。
▼ 测绘
Harton et al.(2002)通过基因组序列分析,将CLR16.2基因定位到染色体16p13.3。
▼ 基因功能
Conti et al.(2005)发现,在有丝分裂原刺激的人T细胞中表达CLR16.2会导致NFKB(见164011)、AP1(165160)和NFAT(见600490)活性降低,CD25(IL2RA)降低;147730)和IL2(147680)表达。CLR16.2 过表达后 NFKB 激活减少似乎是由于 IKBA 改变(NFKBIA; 164008)退化。Conti et al.(2005)提出CLR16.2在减弱T细胞激活中发挥作用。
Schneider et al.(2012)观察到,在脂多糖(LPS)刺激后,与未转染的细胞相比,转染NLRC3的人单核细胞系中NFKB信号传导减弱,IL6(147620)和TNF(191160)表达减少。NFKB 信号传导减少是由 NLRC3 通过其 NBD 与 Toll 样受体(TLR)信号转换因子 TRAF6(602355)关联并改变 TRAF6 泛素化而引起的。Schneider et al.(2012)提出NLRC3影响TRAF6泛素化并改变TLR信号传导。
Zhang et al.(2014)发现Nlrc3减少Sting(TMEM173;612374)小鼠细胞响应胞质DNA、环二-GMP和DNA病毒的先天免疫功能。缺乏Nlrc3的胚胎成纤维细胞响应产生环二GMP的细菌而产生更多的Ifnb(147640)和Il6。重组人 NLRC3 和 STING 的 Pull-down 实验显示蛋白质之间存在直接相互作用。NLRC3 的核苷酸结合域与膜结合的 STING 相关。NLRC3与TBK1(604834)的N末端相互作用并阻碍STING-TBK1相互作用和下游I型干扰素的产生。NLRC3 阻止 STING 正确转运至核周和点状区域。张等人(2014)得出结论,NLR 和 STING 通路的相互作用可以微调宿主对细胞内 DNA、环二 GMP 和 DNA 病毒的反应。
▼ 动物模型
Schneider et al.(2012)通过同源重组产生了健康且具有生育能力的Nlrc3缺陷小鼠。与野生型巨噬细胞相比,用 LPS 刺激 Nlrc3 缺陷型巨噬细胞会导致促炎细胞因子的产生增加以及 Traf6 和 Nfkb 的更大激活。与野生型小鼠相比,向 Nlrc3 缺陷小鼠注射非致死剂量的 LPS 会导致体温下降幅度更大,体重减轻更多,血清 Tnf 增加,尤其是 Il6 增加。Schneider et al.(2012)得出结论,NLRC3在内毒素休克中发挥保护作用。
张等人(2014)发现,与感染的野生型小鼠相比,缺乏Nlrc3并感染单纯疱疹病毒(HSV)-1的小鼠表现出增强的先天免疫反应、降低的发病率和病毒载量。相比之下,野生型小鼠和Nlrc3缺陷小鼠在感染水泡性口炎病毒(VSV)后没有表现出显着差异。张等人(2014)得出结论,Nlrc3 减弱宿主对 HSV-1(一种 DNA 病毒)的反应,但不会减弱宿主对 VSV(一种 RNA 病毒)的反应。
Karki et al.(2016)表明,缺乏NLRC3的小鼠对结肠炎和结直肠肿瘤高度敏感。NLRC3的作用在肠细胞中最为显着,它抑制mTOR(601231)信号通路的激活,并抑制细胞增殖和干细胞源性类器官的形成。NLRC3 与 PI3K 相关,并在与生长因子受体或 TLR4(603030)结合后阻断 PI3K 依赖性激酶 AKT(164730)的激活。Karki 等人(2016)得出的结论是,他们的发现揭示了 NLRC3 作为 mTOR 通路抑制剂的关键作用,介导对结直肠癌的保护。