细胞质聚腺苷酸化元件结合蛋白 3;CPEB3

KIAA0940

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包含 CPEB3 核酶

HGNC 批准的基因符号:CPEB3

细胞遗传学定位:10q23.32 基因组坐标(GRCh38):10:92,046,692-92,291,233(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Nagase等人(1999)通过对从大小分级的成人大脑cDNA文库中获得的克隆进行测序,克隆了CPEB3,他们将其命名为KIAA0940。RT-PCR ELISA检测到脑中高表达,肾、心脏、肺、肝脏、骨骼肌、睾丸、卵巢、胰腺和胎肝中中表达,脾和胎脑中低表达。CPEB3 在所检查的所有特定成人大脑区域中表达,其中杏仁核和黑质中水平最高。

Salehi-Ashtiani et al.(2006)指出CPEB3转录物使用2个交替的非翻译第一外显子,一个在肝脏和睾丸中表达,另一个在大脑中表达。698 个氨基酸的 CPEB3 蛋白具有一个 N 端富含谷氨酰胺的结构域,后面是 2 个 RNA 识别基序和一个 C 端锌指结构域。其他 CPEB 中不存在富含谷氨酰胺的结构域。

CPEB3核酶

Salehi-Ashtiani等人(2006)利用体外自选择技术,鉴定出与嗅觉受体OR4K15、胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)相关的自裂解核酶;147370),一个LINE-1反转录转座子(见LRE1;151626)和CPEB3。CPEB3 核酶位于内含子 3 内,在结构上与人类 δ 型肝炎病毒(HDV)的核酶相关,HDV 是一种用于乙型肝炎感染的单链 RNA 卫星病毒(参见 610424)。EST数据库分析和人和小鼠总RNA提取物的RT-PCR表明CPEB3核酶在体内表达并自我切割。Salehi-Ashtiani 等人(2006)仅在哺乳动物脊椎动物中鉴定出 CPEB3 核酶。他们提出 HDV 核酶和 CPEB3 核酶在进化上相关,并且 HDV 起源于人类转录组。

▼ 基因功能

CPEB3核酶

Salehi-Ashtiani et al.(2006)将CPEB3核酶的活性序列缩小到81个核苷酸。该 81 个核苷酸的构建体被切割,产生一个包含 2-prime-to-3-prime 环磷酸的 9-核苷酸上游片段,以及一个包含 5-prime 末端羟基的 72-核苷酸下游片段,可以用多核苷酸激酶磷酸化(人民党;605610)。该核酶对Mg(2+)的需求量较低,并且在Mn(2+)和Ca(2+)存在下也具有活性。核酶活性在 pH 5.5 和 8.5 之间几乎恒定,表明存在 2 个官能团。

▼ 基因结构

Salehi-Ashtiani et al.(2006)报道CPEB3基因全长242 kb,包含11个外显子,其中包括2个选择性剪​​接、非翻译的第一个外显子。内含子 3 跨度为 46 kb,包含核酶。

▼ 测绘

Nagase等(1999)通过辐射杂交分析将CPEB3基因定位到染色体10。

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