钠通道和网格蛋白连接子 1;SCLT1
网格蛋白相关蛋白 1A;CAP1A
HGNC 批准的基因符号:SCLT1
细胞遗传学定位:4q28.2 基因组坐标(GRCh38):4:128,873,241-129,093,539(来自 NCBI)
▼ 说明
SCLT1作为电压门控钠通道Na(v)1.8(SCN10A)之间的连接蛋白;604427)和网格蛋白(参见 CLTC, 118955)(Liu et al., 2005)。
▼ 克隆与表达
Liu等(2005)利用酵母2-杂交分析,以大鼠Scn10a的C端为诱饵,筛选大鼠脑cDNA文库,克隆了大鼠Sclt1,他们将其命名为CAP1A。通过数据库分析,他们鉴定了小鼠和人类 SCLT1 序列。推导的 688 个氨基酸的人 SCLT1 蛋白与大鼠蛋白具有 76% 的序列同一性。SCLT1包含肌球蛋白尾部结构域(MTD)、液泡ATP酶同源结构域(V-pump)和C末端的双亮氨酸基序。SCLT1 缺乏信号肽和跨膜片段。免疫荧光研究在小脑中的背根神经节(DRG)神经元和坐骨神经 C 型纤维中检测到大鼠 Sclt1 蛋白,免疫染色较低。在肝脏或心脏中未检测到信号。免疫染色研究将大鼠 Sclt1 与 Scn10a 共定位于 DRG 神经元中,并与网格蛋白共定位于 DRG 的地下区域。
▼ 基因功能
Liu et al.(2005)使用酵母2-杂交分析、GST Pull-down 分析以及对大鼠 Sclt1 和 Scn10a 的全长和截短形式的免疫共沉淀分析表明,Sclt1-Scn10a 相互作用需要 Sclt1 MTD 和 Scn10a 保守。区域1(氨基酸1724-1788)。GST Pull-down 实验显示大鼠 Sclt1 C 末端结构域(CTD)与网格蛋白结合。SDS-PAGE 和免疫印迹后的蛋白质结合测定表明,Scn10a-Sclt1 复合物结合网格蛋白,而单独的 Scn10a 与网格蛋白没有直接相互作用。Liu等人(2005)得出结论,Sclt1作为连接蛋白,在多蛋白复合物中结合网格蛋白和Scn10a。Scn10a和Sclt1的共转染表明,Sclt1的过表达选择性地降低了Scn10a电流的幅度;添加巴弗洛霉素 A1(一种液泡 H+ ATP 酶抑制剂)可抑制这种减少。Liu et al.(2005)得出结论,Slct1对Scn10a电流的调节可能涉及内吞过程。
▼ 基因结构
Liu et al.(2005)确定SCLT1基因含有20个外显子。
▼ 分子遗传学
Adly 等人(2014)报道了一名沙特近亲父母所生的患有显着多系统器官受累(提示纤毛病)的男性,其 SCLT1 基因存在纯合剪接位点突变(611399.0001)。
▼ 等位基因变异体(1个精选示例):
.0001 意义不明的变体
SCLT1、IVS5、TC、+2
该变异被归类为意义不明的变异,因为其对口腔手指综合征 IX(258865)的贡献尚未得到证实。
Adly et al.(2014)在一名健康近亲父母所生的沙特男孩中检测到 SCLT1 基因纯合剪接位点突变(c.290+),该男孩患有严重纤毛病表型,包括中线裂、小头畸形和缺损性小眼畸形/无眼畸形。 2T-C)使用外显子组测序。该男孩患有严重的中线唇腭裂、小头畸形和后鼻孔闭锁。他还患有严重的眼部缺损、房间隔缺损(ASD)和室间隔缺损(VSD)。他有小阴茎,但没有模糊的生殖器。脑成像显示脑回肥厚和胼胝体缺失。内耳结构异常。他在三个月大时因严重呼吸道感染而死亡。该突变完全废除了外显子5的共有供体位点;RT-PCR 显示外显子 5 完全跳过,导致移码并引入提前终止密码子(Lys79ValfsTer4)。没有证据表明无义介导的衰变(NMD)。通过对 96 个沙特对照进行 Sanger 测序,或者在 dbSNP、1000 Genomes 或 Exome Variant Server 数据库中,未在 250 个沙特内部外显子组中发现这种突变。Adly 等人(2014)考虑到其患者的严重纤毛病表型最适合 OFD IX 型,尽管患者缺乏典型的舌头受累(Gurrieri 等人,2007),但考虑到突出的眼部受累。