前列腺癌相关转录 4;PCAT4

前列腺中差异表达的基因; GDEP

HGNC 批准的基因符号:PCAT4

细胞遗传学定位:4q21.21 基因组坐标(GRCh38):4:79,827,471-79,863,247(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Olsson等人(2001)通过EST数据库搜索前列腺特异表达的序列,鉴定出一种新的转录本,他们将其命名为GDEP。体外转录/转录实验表明GDEP编码34个氨基酸的蛋白质。RNA 斑点印迹分析仅在前列腺中检测到 GDEP 信号。Northern 印迹分析还显示出强烈的前列腺特异性表达,有 3 个条带,一个主要的 0.5-kb 条带和次要的 1.5-kb 和 2.3-kb 条带,被认为是由于使用替代的聚腺苷酸化位点所致。RT-PCR分析证实在前列腺中强表达,并在唾液腺和肝脏中检测到弱表达。RT-PCR 在 2 个正常、2 个良性增生性和 5 个非转移性前列腺癌样本中检测到表达。在 2 个高度未分化的前列腺癌细胞系中检测不到表达,而在分化程度较高的 LNCaP 细胞系中表达较弱。原位杂交显示GDEP在前列腺上皮细胞中表达。

▼ 基因结构

Olsson et al.(2001)确定GDEP基因含有2个外显子。

▼ 测绘

Olsson等(2001)通过辐射杂交分析将PCAT4基因定位到D4S2947和D4S400之间的染色体4q21.1上。

Tags: none