SEC16 同源物 A,内质网输出因子;SEC16A
SEC16, 酿酒酵母 , 同源物, A
SEC16L
p250
KIAA0310
HGNC 批准的基因符号:SEC16A
细胞遗传学定位:9q34.3 基因组坐标(GRCh38):9:136,440,105-136,484,740(来自 NCBI)
▼ 说明
内质网(ER)选择性输出蛋白质和脂质是由外壳蛋白复合物 II(COPII)介导的,该复合物在膜上的离散位点(称为内质网出口位点(ERES)或过渡 ER 位点)组装。SEC16A 是一种外周膜蛋白,定义了哺乳动物细胞中的 ERES,并且是从 ER 到高尔基体的蛋白质转运所必需的(Watson et al., 2006)。
▼ 克隆与表达
Nagase等人(1997)通过对从大小分级的脑cDNA文库中获得的克隆进行测序,获得了编码SEC16A的部分cDNA,他们将其命名为KIAA0310。对人体组织的RT-PCR分析检测到肝脏、肾脏、卵巢强表达,胎盘和睾丸中度表达,肺、胰腺、脾脏、胸腺、前列腺和小肠中低表达。
Watson等人(2006)通过以S. cerevisiae Sec16作为查询的数据库分析,鉴定出了人类SEC16A。免疫荧光研究将 SEC16A 定位于 HeLa 细胞的 ERES,并与 COPII 蛋白 SEC24C(607185)和 SEC31A(SEC31L1)共定位;610257)。
通过对Nagase等人(1997)获得的部分cDNA进行5-prime RACE-PCR,Iinuma等人(2007)克隆了全长SEC16A。预测的 2,357 个氨基酸蛋白质包含 3 个富含脯氨酸的区域和 1 个富含酪氨酸的区域。SEC16A 与酿酒酵母 Sec16a 具有 19.8% 的氨基酸同一性。通过 GST Pull-down 实验,作者将 Sec16a(他们称之为 p250)鉴定为 Sec23a(610511)相互作用蛋白。免疫荧光显微镜将 SEC16A 定位于 ERES,并与 COPII 成分 SEC31A 和 ER-高尔基中间室标记物 ERGIC53(LMAN1; 601567)。
Bhattacharyya and Glick(2007)阐明,SEC16有2个哺乳动物同源物,较长的SEC16A(也称为SEC16L)和较短的SEC16B(612855),均定位于过渡内质网位点,这些位点是无核糖体的内质网亚结构域。通过数据库分析,然后对人肝脏 cDNA 文库进行 PCR,他们克隆了 SEC16A。推导的 2,154 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 231 kD。
O\'Rielly et al.(2016)报道SEC16A编码推导的2,357个氨基酸的蛋白质,计算分子量为250 kD。
▼ 基因功能
Watson 等人(2006)表明,SEC16A 的 siRNA 减少导致 COPII 组装和 ER 到高尔基体蛋白转运的破坏。SEC16A 的过度表达也会破坏 ER 到高尔基体的运输。他们建议SAR1(见SAR1A;SEC16A 与 ERES 关联以及 ERES 支架的形成需要 SEC16A(编号 607691),并且需要达到最佳 ER 至高尔基体蛋白转运所需的化学计量水平的 SEC16A。
Iinuma et al.(2007)使用微粒体膜表明,SEC16A 被 SAR1 募集到 ER 膜上。作者证实,siRNA 引起的 SEC16A 减少和 SEC16A 过度表达都会导致 ERES 组织和蛋白质运输缺陷。Iinuma等人(2007)利用GST pull-down实验证明了SEC16A和COPII组分SEC23A和SEC13(SEC13L1;600152),但与 SEC24C 和 SEC31A 的交互较少。
Bhattacharyya 和 Glick(2007)确定 SEC16A N 末端区域是 HeLa 细胞中 ER 输出所必需的。免疫共沉淀研究表明 SEC16A 和 SEC16B 形成异聚复合物。
▼ 基因结构
O\'Rielly et al.(2016)确定SEC16A基因包含32个外显子。
▼ 测绘
Nagase等人(1997)通过辐射杂交分析将SEC16A基因定位到染色体9。
O\'Rielly et al.(2016)报道SEC16A基因定位于染色体9q34.3。