WT1 反义 RNA;WT1AS

WIT1基因

HGNC 批准的基因符号:WT1-AS

细胞遗传学定位:11p13 基因组坐标(GRCh38):11:32,435,518-32,458,769(来自 NCBI)

▼ 说明

WIT1基因的转录方向与WT1基因(607102)相反,WT1基因在Wilms瘤(194070)中发生突变,并且一些WIT1剪接变体包含WT1的反义部分。部分或全部小WIT1转录本可能具有RNA的功能并在WT1的转录调控中发挥作用(Campbell et al., 1994)。

▼ 克隆与表达

Huang等人(1990)从Wilms肿瘤细胞系中纯合缺失的染色体区域克隆了WIT1和WT1。推导的WIT1蛋白含有92个氨基酸。Northern 印迹分析显示,主要的 2.5 kb 转录物在胎儿肾脏和脾脏中表达,但在所检查的任何其他胎儿组织中均不表达。WIT1的表达量普遍低于WT1,且两者在胎儿肾脏中的表达量均高于5岁儿童和成人肾脏。

Campbell et al.(1994)鉴定出WIT1的多个转录起始位点以及一个可变剪接的外显子。

WIT1/WT1-反义融合转录本

Campbell 等人(1994)表明,一些 WIT1 转录本包含来自 WT1 基因外显子 1 的反义序列。

Eccles et al.(1994)通过筛选与WT1同源的序列,鉴定出包含WIT1基因部分、WIT1和WT1之间的序列以及WT1的外显子1和内含子1序列的cDNA。Northern 印迹和 RNase 保护分析检测到胎儿肾脏和肾母细胞瘤组织中表达的 7 至 10 kb RNA。他们确定该 RNA 的转录方向与 WIT1 相同。

▼ 基因功能

Plass et al.(1999)发现WIT1在急性髓性白血病(AML)患者的诊断样本和完全缓解样本中正常,但在同一患者的复发样本中外显子2和内含子1内特异性高甲基化。对更大患者群体的分析显示,难治性 AML 中 WIT1 甲基化的发生率显着高于化疗敏感性 AML。

▼ 基因结构

Huang等(1990)确定WIT1 mRNA以端粒到着丝粒的方向转录,而WT1的转录以相反的方向进行。两个转录本的 5-prime 末端对应到单个富含 CpG 的区域,并且两个转录本的最多 5-prime 外显子不重叠,并且在约 0.6 kb 内分布不同。间插序列可以起到双向启动子的作用。

Campbell等人(1994)使用含有WIT1和WT1基因之间插入序列的两个方向的报告质粒,证实了几种转染的人和小鼠细胞系中报告区域的双向性。通过 DNase 足迹分析,他们确定 WT1 最丰富的形式(+KTS 形式)可以结合启动子区域内的至少 4 个元件。

Hofmann et al.(1993)在WIT1启动子内鉴定了WT1/EGR(见128990)、PAX8(167415)和GAGA样转录因子的识别位点。

▼ 测绘

Huang等(1990)将WIT1基因(WT1AS)定位到染色体11p13(194070)上的Wilms肿瘤位点。

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