具有序列相似性的家族48,成员A;FAM48A

p38-相互作用蛋白;P38IP
染色体 13 开放解读码组 19; C13ORF19

HGNC 批准的基因符号:SUPT20H

细胞遗传学定位:13q13.3 基因组坐标(GRCh38):13:37,009,312-37,059,688(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Schmidt et al.(2001)利用差异显示PCR鉴定恶性前列腺组织中下调的基因,然后筛选前列腺cDNA文库和5-prime RACE,克隆了FAM48A,并将其命名为C13。该转录物包含一个短上游 ORF 和一个主要 ORF,编码推导的 733 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 80 kD。该蛋白具有 N 端核靶向信号,随后是富含 α 螺旋的结构域、PEST 基序和 C 端谷氨酰胺簇。它还具有几个潜在的丝氨酸磷酸化位点。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 3.0 和 4.4 kb 的转录本。Northern印迹和表达阵列分析显示睾丸中的表达最高,其次是各个成人脑区域和一些胎儿组织,包括肺、脑、脾、胸腺和肾。正常人前列腺原位杂交检测到FAM48A主要存在于上皮细胞。

Zohn等人(2006)指出,人类FAM48A(他们称之为p38IP)包含2个C端富含丝氨酸的结构域。相比之下,由 530 个氨基酸组成的小鼠蛋白仅具有 1 个富含丝氨酸的结构域。

▼ 基因功能

Zohn et al.(2006)证明内源性p38(MAPK14; 600289)和p38IP在人胚胎肾细胞中相互作用。酵母 2 杂交分析证实了 HeLa 细胞中的相互作用。p38IP 不与其他检查的 MAP 激酶相互作用。突变分析表明,p38IP 的 C 端一半(包括 2 个富含丝氨酸的结构域)是与 p38 相互作用所必需的。

▼ 测绘

Schmidt et al.(2001)利用FISH和放射杂交分析将FAM48A基因定位到染色体13q13.3。

▼ 动物模型

Zohn等人(2006)在N-乙基-N-亚硝基脲诱变筛选中鉴定了突变体“下垂眼”(drey)。Drey 突变小鼠在神经管闭合、眼睛发育和原肠胚形成方面表现出不完全渗透性缺陷。Zohn等人(2006)表明drey是p38ip中的一个剪接位点突变,引入了提前终止密码子。Drey 突变小鼠产生了一小部分野生型转录本,这可能是外显率不完全的原因。Drey 突变体 p38ip 不结合 p38,导致胚胎组织中 p38 及其下游底物的激活受损。Zohn等人(2006)还鉴定出具有更严重的p38ip突变p38ip(RRK)纯合子的小鼠,该突变导致完全渗透性原肠胚形成缺陷,其中中胚层远离原条的迁移受到损害。p38ip(RRK)纯合子小鼠未能激活原条中的p38,导致E-cadherin(CDH1)的下调失败;192090),它阻断了正常中胚层迁移和原肠胚形成所需的上皮到间质的转变。

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