核糖体蛋白 L5; RPL5

HGNC 批准基因符号:RPL5

细胞遗传学定位:1p22.1 基因组坐标(GRCh38):1:92,831,986-92,841,924(来自 NCBI)

▼ 说明

哺乳动物核糖体是4种RNA(rRNA;参见 180450)和大约 80 种不同的蛋白质,包括 RPL5(Kenmochi 等人,1998)。

▼ 克隆与表达

Frigerio et al.(1995)通过从人结直肠cDNA文库中随机选择的cDNA的部分序列搜索序列数据库,鉴定出编码大鼠核糖体蛋白S5(RPS5;RPS5;603630)、S9(RPS9;603631)、S10(RPS10;603632)、S29(RPS29;603633)、L5(RPL5)、L21(RPL21;603636)、L27a(RPL27A;603637)、L28(RPL28;603638)。Frigerio 等人(1995)完成了这些人类核糖体蛋白的 cDNA 序列。推导的297个氨基酸的人RPL5与大鼠RPL5有4个氨基酸不同。Northern印迹分析表明,与邻近正常组织相比,结直肠癌中RPL5的表达存在差异,尽管没有发现表达水平与疾病严重程度之间的相关性。

Pogue-Geile 等人(1991)通过使用大鼠 Rpl5 探针的 Northern 印迹分析证明,相对于匹配的正常结肠粘膜,RPL5 在人类结直肠肿瘤和息肉中过度表达。RPL5 表达为 1.2-kb 转录本。

▼ 基因结构

Boria et al.(2010)指出RPL5基因包含8个外显子,跨度9.8 kb。

▼ 测绘

Qu et al.(1994)在人类和小鼠中发现,U21 snoRNA(603635)编码在RPL5基因的内含子5中。

Kenmochi等(1998)通过体细胞杂交和放射杂交作图分析,将RPL5基因定位到染色体1p。

Boria et al.(2010)指出RPL5基因定位于染色体1p22.1。

▼ 基因功能

阻碍核糖体生物合成会产生核糖体应激,从而激活 p53(TP53; 191170)以停止细胞生长。Dai et al.(2006)指出核糖体蛋白L5、L11(RPL11;604175)、L23(RPL23;603662)与MDM2(164785)相互作用并抑制MDM2介导的p53泛素化和核糖体应激反应的降解。他们发现 L5 和 L23 抑制人类细胞系中 p53 和 MDM2 的泛素化。相比之下,L11 抑制蛋白酶体介导的泛素化 MDM2 降解,但不抑制 p53,从而使 p53 稳定。

核糖体蛋白L5与5S rRNA(见180420)结合形成核糖体5S RNA-蛋白(5S rRNP)复合物。Lin等人(2001)利用多核糖体分析和体外翻译的人类mRNA交联实验发现,只有当5S rRNA存在于L5转录起始处时,5S rRNP复合物才能形成。如果 L5 合成完成后添加 5S rRNA,则不会观察到 5S rRNP 复合物。突变分析显示,L5 的残基 35 至 50 参与了相互作用,但 L5 蛋白的其余部分是 5S rRNP 复合物稳定形成所必需的。L5 与 5S rRNA 的结合显着增强了 L5 向注射的非洲爪蟾卵母细胞的核输入。

▼ 分子遗传学

Gazda et al.(2008)筛选了 196 名 Diamond-Blackfan 贫血先证者(参见 DBA6, 612561),检测 25 个编码核糖体蛋白的基因突变,并在 18 名先证者和 6 个其他家族成员中鉴定出 RPL5 基因的 15 种不同突变(参见,例如,603634.0001-603634.0006);其中3名突变阳性患者来自Aase和Smith(1969)最初描述的DBA家族(见603634.0005)。这些突变在多重家族中随疾病分离,并且在至少 150 个对照中未发现。对 DBA 患者建立的类淋巴母细胞的前 rRNA 进行分析,发现与对照相比,32S 和 12S 前 rRNA 以及更小的 5.8S rRNA 前体积累,表明内转录间隔区 2(ITS2)在初始阶段的成熟缺陷32S pre-rRNA 中以及后续处理步骤中的核酸内切裂解。

Gerrard et al.(2013)在 19 名 DBA 患者中的 5 名中发现了 4 种不同的 RPL5 基因杂合截短突变(参见例如 603634.0007 和 603634.0008),这些患者接受了 80 个核糖体蛋白基因突变的筛查。

T 细胞 ALL 中的体细胞突变

De Keersmaecker 等人(2013)在 211 例儿童和成人 T 细胞 ALL 中,有 4 例(1.9%)发现了核糖体蛋白 RPL5 突变。

▼ 等位基因变异体(8个精选示例):

.0001 钻石-黑风扇贫血 6

RPL5、ARG23TER

一名女性患者患有 Diamond-Blackfan 贫血(DBA6;Gazda 等人(2008)在 2 个月大时被诊断出患有唇裂和腭裂,Gazda 等人(2008)鉴定出 RPL5 基因外显子 2 中从头 67C-T 转变的杂合性,导致 arg23-to-三元(R23X)取代。在她未受影响的父母或至少 150 名对照者中未发现这种突变。

.0002 钻石-黑风扇贫血 6

RPL5、GLY140SER

一名男性患者患有 Diamond-Blackfan 贫血(DBA6;612561)在3月龄时被诊断,没有相关的畸形,Gazda et al.(2008)鉴定出RPL5基因外显子5中418G-A转变的杂合性,导致gly140到ser(G140S)代换。在他没有贫血的父亲中也发现了这种突变,但在他未受影响的母亲或 2 个兄弟姐妹或至少 150 名对照者中没有发现这种突变。

.0003 钻石-黑风扇贫血 6

RPL5、2-BP DEL、173GA

1 名女性和 2 名男性患有 Diamond-Blackfan 贫血(DBA6;612561),其中 2 人已知有多个相关异常,Gazda 等人(2008)鉴定出 RPL5 基因外显子 3 中 2 bp 缺失(173delGA)的杂合性,导致移码,导致密码子处出现终止序列111. 其中 1 名男性患者的相关特征包括双侧拇指近端长指骨和多种先天性心脏缺陷,包括右心室双出口、肺动脉狭窄、左肺动脉狭窄和动脉导管未闭;另一名男性患者有小下颌、腭裂、支气管咽部软化和轻度脑积水;无法获得该女性患者的临床信息。在未受影响的父母或女性患者的 2 名同胞或至少 150 名对照者中未发现该突变。

.0004 钻石-黑风扇贫血 6

RPL5,1-BP INS,235T

2例女性Diamond-Blackfan贫血患者(DBA6;612561),两者都有相关异常,Gazda 等人(2008)鉴定出 RPL5 基因外显子 4 中 1-bp 插入(235insT)的杂合性,导致移码,导致密码子 112 处出现终止序列。患者还患有软腭裂,另一名患者患有腭裂、悬雍垂裂和拇指发育不良。该突变在两名患者的母亲中分别被发现,她们都患有大红细胞性贫血,没有相关异常,并且在至少 150 名对照者中未发现该突变。

.0005 钻石-黑风扇贫血 6

RPL5、5-BP DEL/39-BP INS、NT498

患有 Diamond-Blackfan 贫血的家庭成员(DBA6;612561)和相关的三指骨拇指,最初由 Aase 和 Smith(1969)报道,Gazda 等人(2008)鉴定了 RPL5 基因外显子 5 中 5 bp 缺失/39 bp 插入(498delTGTGGins39)的杂合性,导致密码子 216 处的蛋白质发生移​​码和提前终止。男性先证者除了三指拇指外还患有室间隔缺损;在他受影响的兄弟(患有唇裂和三指拇指)和他受影响的女儿(无法获得其表型信息)中也发现了这种突变。在先证者未受影响的父母或姐妹或至少 150 名对照者中未发现该突变。

.0006 钻石-黑粉丝贫血 6

RPL5、IVS2DS、TG、+2

一名患有 Diamond-Blackfan 贫血的男性患者(DBA6;612561)没有相关的畸形,Gazda et al.(2008)鉴定出RPL5基因内含子2(IVS2DS+2T-G)供体剪接位点处存在从头TG颠换的杂合性,导致蛋白质过早终止。在患者未受影响的父母或兄弟或至少 150 名对照者中未发现该突变。

.0007 钻石-黑粉丝贫血 6

RPL5、GLU82TER

Gerrard et al.(2013)在一对患有DBA6(612561)的母女中发现了RPL5基因外显子4中的杂合c.244G-T颠换,导致glu82-to-ter(E82X)取代。这位39岁的母亲在5岁时被确诊。她患有生长迟缓、骨质疏松症、拇指异常和肝铁超载。她10岁的女儿患有宫内发育迟缓和牙齿窘迫,出生时就被诊断出来。她患有 Cathie 面容、腭裂、室间隔缺损、维生素 D 缺乏和铁超载。两者的红细胞腺苷脱氨酶(ADA;608958)。母亲的疾病是类固醇反应性的,而女儿则出现了继发性类固醇抵抗。

.0008 钻石-黑风扇贫血 6

RPL5、GLN222TER

Gerrard等人(2013)在一名患有DBA6(612561)的4岁白人男孩中,在RPL5基因的外显子6中发现了杂合的c.664C-T转变,导致gln222-to-ter(Q222X)代换。患者在 7 周大时被诊断出来。他患有生长迟缓、腭裂、食管狭窄、嗜酸性食管炎、三指拇指和肝铁超载。他依赖输血。

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