线粒体外膜脂质代谢调节剂 OPA3; OPA3
OPA3基因
HGNC 批准的基因符号:OPA3
细胞遗传学定位:19q13.32 基因组坐标(GRCh38):19:45,527,427-45,584,802(来自 NCBI)
▼ 说明
OPA3 是线粒体外膜的整合蛋白,可诱导线粒体断裂(Ryu et al., 2010)。
▼ 克隆与表达
通过基因组测序,在关键作图区间内进行3-甲基戊烯酸尿症III型(MGCA3;Anikster et al.(2001)在染色体 19 上鉴定了一个与 MGCA3 表型分离的点突变,该点突变位于基因内含子序列中,命名为 OPA3,对应于 cDNA 克隆 FLJ22187。OPA3 cDNA 编码推导的 179 个氨基酸的蛋白质。Northern 印迹分析表明,大约 5.0 kb 的初级转录本广泛表达,最明显的是在骨骼肌和肾脏中。与大脑其他部分相比,大脑皮层、延髓、小脑和额叶的表达略有增加。
Huizing et al.(2010)通过数据库分析和培养的人成纤维细胞的PCR,克隆了OPA3的2个剪接变体。OPA3A 和 OPA3B 变体的不同之处在于共同外显子 1 分别剪接到外显子 2 或 3 上。推导的 OPA3A 和 OPA3B 蛋白分别包含 179 个和 180 个氨基酸,并且前 47 个 N 端氨基酸相同,包括假定的线粒体定位信号。它们的 C 端序列也高度同源,并以推定的过氧化物酶体靶向信号结尾。实时定量 PCR 检测到所有检查组织中两种变体的组织特异性表达。OPA3A 在骨骼肌和心脏中表达最高,OPA3B 在睾丸中表达最高。荧光标记的 OPA3A 和 OPA3B 定位于线粒体。当线粒体定位被阻断时,OPA3A(而不是 OPA3B)定位于过氧化物酶体。数据库分析揭示了 OPA3A 从真菌到灵长类动物的保守性,而 OPA3B 仅在哺乳动物中发现。
Ryu et al.(2010)通过分级分析表明OPA3定位于HeLa细胞线粒体外膜。OPA3 锚定在外膜上,其 N 端区域暴露于线粒体膜间隙,其 C 端区域暴露于细胞质。删除分析显示 OPA3 的 N 末端是线粒体靶向所必需的。
▼ 基因结构
Anikster et al.(2001)确定OPA3基因含有2个外显子。
Huizing et al.(2010)确定OPA3基因包含3个外显子,跨度57.3 kb。内含子1包含一个LINE-1(L2MC4)转座子。外显子 2 和 3 高度相似,似乎源自片段重复。
▼ 测绘
通过序列分析,Anikster et al.(2001)将OPA3基因定位到染色体19q13.2-q13.3。Huizing et al.(2010)通过基因组序列分析将OPA3基因定位到染色体19q13.32。
▼ 基因功能
Ryu et al.(2010)发现OPA3过表达会导致HeLa细胞线粒体断裂,而OPA3敲除细胞与对照组相比有更多的细长和管状线粒体。OPA3对线粒体形态的影响与DRP1(DNM1L)无关;603850)-和FIS1(609003)-介导的线粒体裂变。相反,OPA3 的过度表达增加了对细胞凋亡信号的敏感性,而 OPA3 的耗竭则可以防止细胞凋亡。缺失分析表明 OPA3 的疏水区域是线粒体断裂所必需的。OPA3 功能似乎在进化上是保守的,因为果蝇 OPA3 的表达挽救了 OPA3 敲低的 HeLa 细胞中的线粒体形态。
▼ 分子遗传学
3-甲基戊二酸 Acduria,III 型
来自8个不同家庭的10名伊拉克犹太人患有III型3-甲基戊烯二酸尿症(MGCA3;258501),Anikster et al.(2001)在OPA3基因中发现了一个纯合剪接位点突变(606580.0001)。在 85 名健康种族匹配对照中的 8 名中也检测到了该突变,产生的携带频率为十分之一,表明存在创始人效应。作者建议,即使没有其他神经系统异常,也应在发病较晚的视神经萎缩患者中寻找 OPA3 较温和的突变。
在 14 名 MGCA3 患者中,除一名伊拉克犹太人血统外,Yahalom 等人(2014)在 OPA3 基因中鉴定出先前由 Anikster 等人(2001)鉴定的剪接位点突变的纯合性。
Kleta et al.(2002)在一名 14 岁男孩中,其第一代表兄弟为库尔德裔土耳其人,其父母为 MGCA3,鉴定出 OPA3 基因(606580.0004)外显子 2 缺失的纯合性。
Arif等人(2013)在巴基斯坦近亲所生的2个表兄弟姐妹(DYAF09家族)中发现了MGCA3的OPA3基因外显子1(L11Q;L11Q;606580.0005)。该突变是通过全基因组纯合性作图和外显子组测序鉴定出来的,并通过桑格测序得到证实。
Ho 等人(2008)在一名 18 岁 MGCA3 患者中,其父母为非近亲印度人所生,鉴定出 OPA3 基因外显子 2(Q139X;Q139X;606580.0006)。父亲是突变携带者,但母亲的 DNA 无法用于检测;因此,Ho 等人(2008)不能排除母体等位基因上外显子 2 缺失的可能性。
视神经萎缩 3 伴有白内障
2个常染色体显性遗传性视神经萎缩和白内障家族的受影响成员(OPA3;165300),Reynier et al.(2004)鉴定了 OPA3 基因中的 2 个不同突变(分别为 G93S,606580.0002 和 Q105E,606580.0003)。
▼ 等位基因变异体(6个精选例子):
.0001 3-@甲基戊二酸尿,III 型
OPA3、IVS1AS、GC、-1
Anikster et al.(2001)发现OPA3基因中的一个受体剪接位点突变IVS1-1G-C是导致III型3-甲基戊烯二酸尿症(MGCA3;258501),或视神经萎缩加综合征,发生在几名伊拉克犹太患者身上。该突变消除了患者成纤维细胞中的 mRNA 表达。在 85 名健康种族匹配对照中的 8 名中也检测到了该突变,产生的携带频率为十分之一,表明存在创始人效应。
Yahalom等人(2014)在14名MGCA3患者中,除一名伊拉克犹太血统外,均鉴定出OPA3基因中IVS1-1G-C(c.143-1G-C)突变的纯合性。
Carmi et al.(2015)在一名由近亲叙利亚犹太人父母所生的 MGCA3 5 岁女孩中鉴定出 OPA3 基因中 c.143-1G-C 突变的纯合性。
.0002 视神经萎缩和白内障,常染色体显性遗传
OPA3、GLY93SER
患有常染色体显性遗传性视神经萎缩和白内障的法国家庭成员(OPA3;165300)首先由 Garcin 等人(1961)描述,Reynier 等人(2004)在 OPA3 基因的外显子 2 中发现了一个杂合的 277G-A 转换,导致 gly93 到 Ser(G93S)的取代。
.0003 视神经萎缩和白内障,常染色体显性遗传
OPA3、GLN105GLU
患有常染色体显性遗传性视神经萎缩和白内障的家族成员(OPA3;165300),Reynier et al.(2004)在OPA3基因的外显子2中发现了一个杂合的313C-G颠换,导致gln105-to-glu(Q105E)取代。
.0004 3-@甲基戊二酸尿,III 型
OPA3、18-BP DEL、NT320
一名 14 岁男孩,其父母是库尔德裔土耳其人,患有 3-甲基戊烯酸尿症 III 型(MGCA3;258501),Kleta 等人(2002)在 OPA3 基因的外显子 2 中鉴定出纯合的 18 bp 缺失,导致密码子 108 和 113 之间 6 个氨基酸缺失。该男孩小时候有共济失调步态,3 -甲基戊烯酸尿症。9 岁时诊断出视力下降并伴有视神经萎缩。13岁时,他体力活跃,智力正常,但有轻度共济失调性不安。
.0005 3-@甲基戊二酸尿,III 型
OPA3、LEU11GLN
2个堂兄弟(DYAF09家族)患有III型3-甲基戊烯二酸尿症(MGCA3;258501),其父母为巴基斯坦近亲所生,Arif等人(2013)在OPA3基因的外显子1中发现了纯合的c.32T-A颠换(c.32T-A, NM_015136),导致了leu11-to -gln(L11Q)在进化上保守的残基处取代。该突变通过全基因组纯合性作图和外显子组测序鉴定,并通过桑格测序验证,并与家族中的疾病分离。NHLBI 外显子组变异项目数据库或 342 名巴基斯坦对照中不存在该变异。该突变影响 OPA3 转录本(OPA3A 和 OPA3B),并且位于潜在的线粒体前导序列内,可能导致线粒体靶向异常。两名患者的 TSHZ3 基因(c.941C-G、A314G)均存在纯合突变,该突变与该疾病在家族中分离。作者认为 OPA3 突变具有致病性,因为已知与 OPA3 突变相关的临床特征,但不能排除 TSHZ3 突变可能具有的修饰作用。两名患者均出现视盘苍白以及舞蹈样和肌阵挛运动。
.0006 3-@甲基戊二酸尿,III 型
OPA3、GLN314TER
一名18岁的3-甲基戊烯酸尿症III型患者(MGCA3;Ho et al.(2008)在 OPA3 基因的外显子 2 上发现了一个纯合的 c.415C-T 转换(c.415C-T, NM_025136.2),产生了 gln139 。 -to-ter(Q139X)替代。预计早期终止密码子会导致 OPA3 转录本的无义介导的衰变。通过桑格测序发现的突变在父亲身上以杂合状态存在,但母亲的 DNA 无法用于测试。Ho et al.(2008)不能排除患者遗传自其母亲的2号外显子缺失的可能性。患者尿液中3-甲基戊二酸和3-甲基戊二酸升高。她患有双侧视神经萎缩和轻度共济失调和痉挛。