黑色素瘤抗原,D 族,2; MAGED2
MAGED
HGNC 批准的基因符号:MAGED2
细胞遗传学定位:Xp11.21 基因组坐标(GRCh38):X:54,807,745-54,816,015(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Lucas et al.(1999)通过以MAGEA10(300343)序列为查询条件的数据库检索,鉴定出一个关系较远但同源的基因MAGED2,并将其命名为MAGED。推导的 606 个氨基酸的蛋白质在其中心区域包含一个片段,该片段与其他 MAGE 蛋白质 C 末端的 200 个氨基酸的 MAGE 片段同源。RT-PCR 分析表明,与许多 MAGE 基因的睾丸和肿瘤特异性表达不同,MAGED2 在正常人体组织和大多数(如果不是全部)细胞类型中普遍表达。MAGED2和necdin(602117)的序列分析没有揭示任何已知的MAGE抗原肽。
Langnaese et al.(2001)也克隆了人类MAGED2以及大鼠和老鼠的直系同源物。人类蛋白质含有几个假定的核定位信号和蛋白激酶的潜在磷酸化位点。它与大鼠直向同源物和人 MAGED1(300224)分别具有 86% 和 43% 的总体序列同一性。Northern 印迹分析在人脑、骨骼肌、心脏、胎盘和胰腺中检测到 2.2 kb 的转录物,在肾脏和肺中检测到少量转录物。在人脑的几个区域中可以检测到表达。大鼠脑原位杂交显示,在海马、小脑、脉络丛、下丘脑和脑干的各个核团中均有明显表达。在大鼠睾丸中,MAGED2 仅在间质中检测到,最有可能在 Leydig 细胞中检测到,而在肾小管中未检测到表达。
▼ 基因结构
Lucas et al.(1999)确定MAGED2基因含有14个外显子,其中2个是替代第一外显子。ORF从外显子2开始,到外显子12结束。Langnaese et al.(2001)指出该基因跨度约为8.3 kb。
▼ 测绘
Lucas等(1999)通过基因组序列分析,在通过FISH定位到Xp11的PAC克隆中鉴定出了MAGED2基因。Langnaese et al.(2001)将MAGED2基因与Xp11.2热点一起鉴定为X染色体连锁智力低下(XLMR)。
有关 X 染色体编码具有 MAGE 结构域的蛋白质以及其他癌睾丸抗原基因的高频率基因的讨论,请参见 300016(Ross 等人,2005)。
▼ 分子遗传学
Langnaese et al.(2001)在XLMR患者的MAGED2蛋白序列中鉴定出5个编码同义氨基酸的SNP。
9个短暂性产前Bartter综合征家系(BARTS5;Laghmani 等人(2016)发现了 MAGED2 基因的突变(参见例如 300470.0001-300470.0004),其中受影响的男性胎儿的母亲会出现早发性严重羊水过多。 300971)。通过新生突变(K133X;K133X;300470.0005)在1个家庭受影响的男婴中检出。
▼ 等位基因变异体(5个精选例子):
.0001 巴特综合症,5 型,产前,暂时性
MAGED2、TYR346TER
患有短暂性产前巴特综合征5型(BARTS5; 300971),Laghmani et al.(2016)在MAGED2基因的外显子7中发现了c.1038C-G颠换,导致tyr346-to-ter(Y346X)取代。该突变与 3 名受影响的男性和两位携带者母亲共分离,并且在 110 个对照或 1000 个基因组或 ExAC 数据库中未发现。
.0002 巴特综合症,5 型,产前,暂时性
MAGED2、IVS6、AG、-2
德国一个患有短暂性产前巴特综合征5型(BARTS5; 300971),最初由 Engels 等人(1991)报道,Laghmani 等人(2016)在 MAGED2 基因的内含子 6 中发现了一个剪接位点转换(c.991-2A-G)。这种突变在 110 个对照或 1000 个基因组或 ExAC 数据库中没有发现,但存在于携带者母亲和所有 3 个受影响的儿子中,其中最大的儿子仅患有羊水过多,出生后没有表现出多尿症。
.0003 巴特综合症,5 型,产前,暂时性
MAGED2、2-BP 删除、386TG
佛兰德斯家庭患有短暂性产前巴特综合征5型(BARTS5; 300971),最初由 Reinalter 等人(1998)报道,Laghmani 等人(2016)在 MAGED2 基因的外显子 3 中发现了 2-bp 缺失(c.386delTG),导致移码,预计会导致提前终止密码子(Val129GlyfsTer2)。该突变存在于母亲和她受影响的儿子身上,但在 110 个对照或 1000 个基因组或 ExAC 数据库中未发现。早期妊娠还因羊水过多而变得复杂,一名男婴在妊娠 25 周时早产,并在出生后 7 小时内死亡。
.0004 巴特综合症,5 型,产前,暂时性
MAGED2,ARG446CYS
一名早发性严重羊水过多的女性及其男性胎儿在妊娠 22 周时死亡(BARTS5; 300971),Laghmani et al.(2016)在MAGED2基因的外显子11中发现了c.1336C-T转变,导致arg446到cys(R446C)的取代。在 110 个对照或 1000 个基因组或 ExAC 数据库中未发现该突变。
.0005 巴特综合症,5 型,产前,暂时性
MAGED2、LYS133TER
患有短暂性产前 Bartter 综合征 5(BARTS5;BARTS5;300971),Laghmani et al.(2016)在MAGED2基因的外显子3中发现了一个从头c.397A-T颠换,导致lys133-to-ter(K133X)取代。在 110 个对照或 1000 个基因组或 ExAC 数据库中未发现该突变;在先证者的母亲中也没有检测到这种基因,她经历了早发性严重羊水过多,从而证明胎儿基因型足以满足完整的产科和围产期表型。