蛋白质酪氨酸磷酸酶,受体型,R;PTPR
PC12 蛋白酪氨酸磷酸酶;PCPTP1
HGNC 批准的基因符号:PTPRR
细胞遗传学定位:12q15 基因组坐标(GRCh38):12:70,638,073-70,920,738(来自 NCBI)
▼ 正文
有关蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)的一般信息,请参见 PTPRA(176884)。
▼ 克隆与表达
为了克隆编码在神经系统中表达的 PTP 的 cDNA,Shiozuka 等人(1995)使用基于保守 PTP 结构域的简并寡核苷酸对大鼠 PC12h 细胞 mRNA 进行了 RT-PCR。他们通过用 PCR 产物筛选 PC12h 细胞 cDNA 文库,孤立出全长大鼠 PTP cDNA,并将其命名为 Pcptp1。最长的开放解读码组包含 6 个甲硫氨酸密码子,可以作为读数起始位点。使用针对 Pcptp1 C 末端区域的抗体对 PC12h 细胞裂解物进行蛋白质印迹分析,检测到主要的 65-kD 和次要的 42-kD 蛋白质,它们分别对应于从第二个和第五个蛋氨酸密码子开始的转录。Pcptp1是一种受体型PTP,具有单个PTP催化结构域,位于C端胞质区域。42-kD形式的氨基酸序列与大鼠非受体型PTP Step的氨基酸序列有54%相同(参见PTPN5;176879)。对大鼠组织的 Northern 印迹分析检测到,大脑大部分区域和肾上腺中存在 3.9 kb Pcptp1 转录本,几乎仅在小脑中存在 3.3 kb 转录本,而大脑和许多非神经元组织中则检测到 1.7 kb 转录本。作者将人脑PCPTP1 cDNA的核苷酸序列存入GenBank(D64053);cDNA编码657个氨基酸。
▼ 测绘
Gross(2014)根据PTPRR序列(GenBank BC110900)与基因组序列(GRCh37)的比对,将PTPRR基因定位到染色体12q15。