富含 AT 相互作用结构域的蛋白 4B; ARID4B

含干燥蛋白质 4B
SIN3A 相关蛋白,180-KD;SAP180
视网膜母细胞瘤结合蛋白 1 样蛋白 1;RBP1L1
RBBP1 样蛋白 1;RBBP1L1
乳腺癌相关抗原 1; BRCAA1

HGNC 批准的基因符号:ARID4B

细胞遗传学定位:1q42.3 基因组坐标(GRCh38):1:235,166,902-235,328,179(来自 NCBI)

▼ 说明

ARID4B 是组蛋白脱乙酰酶的一个子单元(参见 HDAC1;601241)依赖的SIN3A(607776)辅阻遏物复合物(Fleischer et al., 2003)。

▼ 克隆与表达

Cao et al.(2001)通过用乳腺癌患者血清对乳腺癌细胞系cDNA表达文库进行免疫筛选,然后对卵巢细胞cDNA文库进行5-prime RACE,获得了编码ARID4B的全长cDNA,他们将其命名为ARID4B。 RBP1L1。推导的 1,226 个氨基酸的蛋白与视网膜母细胞瘤结合蛋白(例如 ARID4A;180201)。Northern 印迹分析检测到 7.5 kb 转录物在睾丸中高表达,而在胸腺、前列腺和卵巢中表达较低。在检查的其他 9 个组织中几乎没有检测到表达。RT-PCR 检测到乳腺癌、卵巢、肺癌、结肠癌和胰腺癌组织中 RBP1L1 的表达,但前列腺癌组织中未检测到 RBP1L1 的表达。

Fleischer等人(2003)从K562人红白血病细胞中纯化了SIN3A复合物。通过对与复合物相关的多肽进行微测序,然后进行数据库分析和 K562 mRNA 的 RT-PCR,他们克隆了全长 ARID4B,并将其命名为 SAP180。推导的 1,312 个氨基酸蛋白具有 N 端 Tudor 结构域,随后是 ARID 结构域和染色结构域。Tudor 结构域和染色结构域在蛋白质-蛋白质相互作用中发挥作用,而 ARID 结构域则结合 DNA。Northern 印迹分析检测到所有检查的人类细胞系中 ARID4B 的表达。ARID4B 的计算分子量为 148 kD,但体外分析得出的蛋白质表观分子量为 180 kD。

Cui et al.(2004)确定ARID4B(他们称之为BRCAA1)包含一个亲水性N末端和10个糖基化位点。

▼ 基因功能

Fleischer等(2003)通过对K562红白血病细胞进行免疫沉淀,证实SAP180是SIN3A复合体的成员。除SIN3A外,与SAP180免疫共沉淀的其他蛋白还包括SAP130(609697)、SDS3(608250)、HDAC1和HDAC2(605164)。表位标记蛋白的免疫沉淀表明 SAP180 和 SAP130 可以占据相同的 SIN3A 复合物,并且两种蛋白均结合 SIN3A 的 C 端 HDAC 相互作用结构域。当靶向 DNA 时,SAP180 和 SAP130 都会抑制转录。SIN3A 和 HDAC1 结合 SAP180 的 C 端区域,抑制转录约 23 倍。SAP180 N 末端区域也显示出适度的转录抑制。

Cui et al.(2004)发现,60名乳腺癌患者中有39名(65%)的血清样本含有高滴度的BRCAA1抗体,而30名健康捐献者中只有4名(13%)的血清样本有高滴度的BRCAA1抗体(p小于0.001) 。

普瑞德威利综合征(PWS; 176270)和天使综合征(AS;105830)分别是由父本和母本染色体15的印记基因表达缺陷引起的。PWS/AS 结构域的基因组印记通过 SNRPN(182279)启动子内部和上游的二分顺式作用印记中心(IC)进行调节。Wu et al.(2006)利用基因陷阱诱变选择小鼠胚胎干细胞中 SNRPN-EGFP 融合基因的表达改变,鉴定出了 Arid4a 和 Arid4b。免疫共沉淀实验和染色质免疫沉淀测定表明,人 ARID4A 与 Arid4b 和 SNRPN 启动子相互作用。为了进一步阐明ARID4A和ARID4B在印记调控中的作用,Wu等(2006)在小鼠体内删除了Arid4a和Arid4b基因。Arid4a 纯合缺陷和 Arid4b 杂合缺陷联合改变了 PWS-IC 的表观遗传修饰,组蛋白 H4(见 602822)lys20 和 H3(见 602810)lys9 的三甲基化减少,DNA 甲基化减少,使母系等位基因向父系表观基因型转变。 。Arid4a、Arid4b或Rb1(614041)的突变抑制了由AS-IC突变引起的AS印记缺陷。Wu等人(2006)得出结论,ARID4A和ARID4B是表观遗传复合体的成员,调节PWS/AS结构域的基因组印记。

▼ 基因结构

Cui et al.(2004)确定ARID4B基因包含18个外显子,跨度93.9 kb。

▼ 测绘

Cui et al.(2004)通过FISH和基因组序列分析,将ARID4B基因定位到染色体1q42.1-q43。

▼ 动物模型

Wu等人(2006)发现Arid4a -/- 小鼠能够存活并具有生育能力,而Arid4b -/- 胚胎在胚胎第7.5天之前死亡。

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