转运蛋白颗粒复合物，子单元 6A; TRAPPC6A

TRAPP 复合物X, 子单元 6A

HGNC 批准的基因符号：TRAPPC6A

细胞遗传学定位：19q13.32 基因组坐标（GRCh38）：19:45,162,933-45,178,237（来自 NCBI）

▼ 说明

TRAPPC6A 是 TRAPPI 和 TRAPPII 复合物的子单元，在内质网-高尔基体转运中发挥作用（Gwynn et al., 2006; Mohamoud 等人的总结，2018）。

▼ 克隆与表达

Gwynn et al.（2006）克隆了小鼠Trappc6a，并通过数据库分析鉴定了人类TRAAPPC6A。缪和人类 TRAPPC6A 编码推导的 159 个氨基酸的蛋白质，它们具有 83% 的同一性，计算出的分子量为 17.4 kD。这两种蛋白都含有 TRAPPC6B（610397）和几个酵母 TRAPP 子单元中保守的 2 个基序，包括 TRAPPC6A 和 TRAPPC6B 的推定同源物 Trs33。Northern印迹分析检测到Trappc6a在所有检查组织中表达，其中在肾脏、肝脏和睾丸中表达最高。小鼠Trappc6a 的表达在培养的黑素细胞中高于在肾脏中的表达。

▼ 基因结构

Gwynn et al.（2006）确定Trappc6a基因含有6个外显子。

▼ 测绘

Mohamoud et al.（2018）指出TRAAPPC6A基因定位于染色体19q13.31。

Gwynn et al.（2006）将小鼠Trappc6a基因定位到染色体7。

▼ 分子遗传学

关联待确认

有关综合征性智力发育障碍与 TRAPPC6A 基因变异之间可能关联的讨论，请参阅 610396.0001。

▼ 动物模型

Gwynn等人（2006）在小鼠中发现了一种隐性突变，称为“马赛克色素沉着不足”（Mhyp），该突变会导致眼睛视网膜色素上皮层出现马赛克性皮毛色素沉着缺失和斑片状色素沉着缺失，并伴有异常黑素体。他们确定 Mhyp 是由 8.4 kb 逆转录病毒整合到 Trappc6a 基因的内含子 1 中产生的。

▼ 等位基因变异体（1个精选示例）：

.0001 意义不明的变体

TRAPPC6A、TYR107ASN

该变异被归类为意义不明的变异，因为其对综合征性智力发育障碍的贡献尚未得到证实。

Mohamoud et al.（2018）在沙特阿拉伯一个患有综合征性智力发育障碍的多代近亲大家庭的 5 名成员中，在 TRAPPC6A 外显子 4 中发现了纯合 c.319T-A 颠换（c.319T-A, NM_04108）基因，导致高度保守的残基处由 tyr107 替换为 asn（Y107N）。该变异是通过纯合性作图和全外显子组测序相结合发现的，并通过桑格测序证实，与该家族中的疾病分离。随后在大中东变异组（GME）数据库中的 1 名无关土耳其个体中发现了相同的纯合变异，该数据库针对神经发育障碍个体进行了丰富。在 40 个对照沙特染色体或 40 个外显子组的内部数据库中未发现该变异；它还根据 ExAC、1000 基因组计划、dbSNP 和外显子组变异服务器数据库进行了过滤，并且在这些数据库中不以纯合状态存在。将突变转染至 HEK293 细胞中表明，突变蛋白比野生型蛋白更稳定，野生型蛋白易被蛋白酶体降解。作者推测突变蛋白的异常积累可能会对蛋白质运输产生不利影响。没有对患者细胞进行研究。患者运动发育正常，但智力发育受损、学习困难、言语迟缓和面部畸形，包括宽额头、大耳朵、鼻孔前倾和上唇厚。其他更多变化的特征包括第五趾的斜指畸形和手和/或脚的轴后多指畸形。3名患者的智商分别为67岁、68岁和73，年龄从7岁到12岁不等。外显子组测序显示，沙特家族中所有受影响的个体还携带其他4个基因的纯合变异（RSPH6A，607548；ANKK1, 608774; AMOTL1，614657；和 ALKBH8, 613306）也与家庭中的疾病隔离；不能排除这些变体的影响。