磷酸呋喃酸性簇分选蛋白 2;PACS2
KIAA0602
HGNC 批准的基因符号:PACS2
细胞遗传学定位:14q32.33 基因组坐标(GRCh38):14:105,300,774-105,398,147(来自 NCBI)
▼ 说明
PACS2 基因编码参与核基因表达和通路交通调节的多功能分选蛋白。它在细胞核和细胞质中都有作用(Olson 等人总结,2018)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人(1998)通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,克隆了 PACS2,并将其命名为 KIAA0602。推导的蛋白质含有962个氨基酸。RT-PCR 检测到所有检查组织中都有不同的 PACS2 表达,其中骨骼肌和肾脏中的表达水平最高。
Simmen et al.(2005)通过在EST数据库中搜索与PACS1(607492)相似的基因,然后筛选大脑皮层cDNA文库,克隆了PACS2。推导的 889 个氨基酸蛋白与 PACS1 整体具有 54% 的同一性,在 140 个氨基酸货物/转换因子结合区域具有 81% 的同一性。Northern 印迹分析检测到 3.8 kb PACS2 转录物的广泛表达,其中骨骼肌中表达最高,其次是心脏、大脑、胰腺和睾丸。小鼠横纹肌肉瘤细胞系的共聚焦免疫荧光显示 Pacs2 与内质网(ER)标记共定位。
▼ 基因功能
Simmen et al.(2005)发现,在小鼠横纹肌肉瘤细胞系中,Pacs2的缺失会导致Bap31(BCAP31; 300398)依赖的线粒体断裂和线粒体与内质网的解偶联。Pacs2 还控制内质网稳态和线粒体相关膜上内质网脂质合成中心的形成。为了响应凋亡诱导剂,Pacs2将全长Bid(601997)易位至线粒体,从而启动Bid截短、细胞色素c释放和Casp3(600636)激活等一系列事件,导致细胞死亡。Simmen et al.(2005)得出结论,PACS2整合了内质网线粒体通讯、内质网稳态和细胞凋亡。
多囊蛋白-2(PKD2;173910)在质膜或内质网上充当钙渗透性非选择性阳离子通道。Kottgen等人(2005)发现多囊蛋白2的亚细胞定位和功能是由PACS1和PACS2指导的,PACS1和PACS2识别多囊蛋白2的C端结构域中的酸性簇。与这些转换因子蛋白的结合受到酪蛋白激酶 2(参见 CSNK2A1, 115440)ser812 上多囊蛋白-2 磷酸化的调节,这是多囊蛋白-2 在 ER、高尔基体和质膜区室之间路由所必需的。Kottgen et al.(2005)得出结论,PACS1和PACS2参与离子通道运输,将含有酸簇的离子通道引导至不同的亚细胞区室。
▼ 测绘
Nagase等(1998)通过辐射杂交分析将PACS2基因定位到染色体14。通过辐射杂交分析和基因组序列分析,Simmen等(2005)将PACS2基因定位到染色体14q32.33。
▼ 分子遗传学
14名无关的发育性和癫痫性脑病-66(DEE66;Olson et al.(2018)在PACS2基因中发现了一个反复出现的从头杂合错义突变(E209K;618067)。610423.0001)。前2名患者的突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。随后的患者是通过国际数据共享来确定的。体外功能表达研究表明,与野生型相比,PACS2 E209K 变体与客户蛋白 SIRT1(604479)、HDAC1(601241)和 TRPV1(602076)有更大程度的相互作用。这些发现表明,突变降低了预测的自动调节域调节 PACS2 和客户蛋白之间相互作用的能力,这可能会扰乱细胞功能。研究结果可能与显性负效应一致。
▼ 等位基因变异体(1个精选示例):
.0001 发育性和癫痫性脑病 66
PACS2、GLU209LYS
14名无关的发育性和癫痫性脑病-66(DEE66;618067),Olson et al.(2018)在PACS2基因中发现了一个从头杂合的c.625G-A转换(c.625G-A, NM_001100913.2),导致在酸性疏水结构域中高度保守的残基,导致极性和蛋白质构象变化。前2名患者的突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。在 gnomAD 或 Exome Variant Server 数据库中未找到它。通过国际数据共享,确定了另外 12 名具有相似表型和新生杂合 E209K 突变的个体。所有突变都是通过研究或临床诊断全外显子组测序发现的,表明这种反复出现的突变是造成表型的原因。患者在出生后的最初几天或几周内出现各种类型的癫痫发作。