BACE1 反义 RNA: BACE1AS

HGNC 批准的基因符号:BACE1-AS

细胞遗传学定位:11q23.3 基因组坐标(GRCh38):11:117,291,346-117,292,170(来自 NCBI)

▼ 说明

BACE1AS 基因与相反链上的 BACE1 基因(604252)重叠。BACE1AS 的转录产生一种非编码调节 RNA,它似乎可以稳定 BACE1 的表达和功能(Faghihi et al., 2008)。

▼ 克隆与表达

Faghihi et al.(2008)鉴定出BACE1AS,这是一种从染色体11的正链转录而来的2 kb保守非编码RNA,其方向与重叠的BACE1基因相反。RACE 分析在小鼠和人类中发现了一个额外的 BACE1AS 剪接变体。两种人类 BACE1AS 转录物均含有 104 个核苷酸,与 BACE1 的外显子 6 互补,是多聚腺苷酸化的,并且缺乏明显的 ORF。Northern 印迹分析检测到所有受检人体组织中都有不同的 BACE1AS 表达,其中在胰腺、肝脏和肺中表达最高。在脑、胎盘、骨骼肌、心脏、肾脏、脾脏和结肠中检测到较低的表达。在检查的所有小鼠大脑区域中均检测到 Bace1as 表达。

▼ 基因功能

淀粉样前体蛋白的顺序切割(APP;104760)由BACE1(604252)和γ-分泌酶(参见PSEN1;104311)产生淀粉样蛋白(A)-β-40和A-β-42,启动淀粉样蛋白级联反应,这是阿尔茨海默病(AD;AD;104300)。A-β-42 寡聚物影响 AD 的关键方面。Faghihi等人(2008)通过对小干扰RNA和短发夹RNA的人体细胞进行体外研究表明,BACE1AS以剂量依赖性方式一致调节BACE1 mRNA和蛋白水平。包括 A-β-42 在内的各种细胞应激源导致 BACE1AS 水平增加、BACE1 mRNA 稳定性增加,并通过转录后前馈机制产生额外的 A-β-42。AD 患者死后脑组织中的 BACE1AS 转录物浓度升高了 6 倍,所有脑区域平均增加了约 2 倍。在转基因 AD 小鼠中也观察到了类似的变化。在具有 AD 诱导 APP 突变的人类细胞系中,敲低 BACE1AS 会导致 A-β-40 和 A-β-42 浓度降低。Faghihi et al.(2008)提出,神经元利用BACE1AS来维持BACE1表达的精确调节,并且这种调节的改变导致BACE1活性增加,可能通过A-β加工的变化促进AD的发病机制。

Modarresi等人(2011)使用AD的APP转基因小鼠模型表明,通过将修饰的小干扰RNA输注到第三脑室来敲低Bace1或Bace1as,导致Bace1和Bace1as的一致下调。Bace1 下调后,不溶性 A-β 产生和 A-β 聚集减少,以及成体神经发生标记物正常化。Modarresi 等人(2011)得出结论,与 A-β 产生相关的成人神经发生的扭曲是淀粉样蛋白发病机制的早期标志。

▼ 测绘

Faghihi等人(2008)通过基因组序列分析,将BACE1AS基因定位到染色体11q23.3,与相反链上的BACE1基因重叠。

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