雄激素孤立细胞中 RNA 下调,非编码; DRAIC
长非编码RNA DRAIC
长链非编码RNA DRAIC
HGNC 批准的基因符号:DRAIC
细胞遗传学定位:15q23 基因组坐标(GRCh38):15:69,561,720-69,571,440(来自 NCBI)
▼ 说明
长非编码RNA(lncRNA),如DRAIC,是含有超过200个核苷酸的调节RNA,不显示蛋白质编码潜力(Sakurai et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析和定量RT-PCR,Sakurai等人(2015)鉴定出DRAIC,与LNCaP衍生的雄激素非依赖性C4-2B细胞相比,DRAIC在雄激素依赖性人LNCaP前列腺癌细胞中表现出更高的表达。DRAIC 是 1.7 kb 的剪接转录物,没有显示出蛋白质编码潜力。Sakurai et al.(2015)还鉴定了 3 个带有额外 5-prime 外显子的剪接变体,这些变体在 LNCaP 细胞中表达较弱。半定量RT-PCR显示DRAIC主要表达于LNCaP细胞胞质中。
▼ 基因功能
Sakurai et al.(2015)通过定量RT-PCR发现LNCaP细胞中雄激素下调DRAIC。DRAIC 在雄激素非依赖性人前列腺癌细胞系中也被下调。染色质免疫沉淀和PCR分析证实雄激素受体(AR; 313700)被招募到DRAIC启动子区域。FOXA1(602294)和NKX3-1(602041)也被招募到与3个AR结合位点重叠的区域的DRAIC启动子中。Sakurai et al.(2015)发现AR下调DRAIC表达,而FOXA1和NKX3-1上调DRAIC表达。AR和FOXA1对PCAT29(616273)的表达具有相同但孤立的影响,PCAT29位于DRAIC下游20 kb处,编码lncRNA。过表达和抑制剂研究表明,DRAIC 促进增殖但抑制 LNCaP 细胞的迁移和侵袭,而 PCAT29 抑制 LNCaP 增殖。数据库分析表明 DRAIC 的表达是多种癌症良好预后的预测因子。
▼ 基因结构
Sakurai et al.(2015)确定DRAIC基因包含10个外显子,跨度约为108 kb。
▼ 测绘
Sakurai et al.(2015)通过基因组序列分析,将DRAIC基因定位到染色体15q23,PCAT29基因上游20 kb。