溶质载体家族 26(阴离子转运蛋白),成员 6: SLC26A6
HGNC 批准的基因符号:SLC26A6
细胞遗传学定位:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:48,625,723-48,635,461(来自 NCBI)
▼ 说明
SLC26A6 与 SLC26 家族的其他成员一样,是一种阴离子交换剂(Chernova et al., 2005)。
▼ 克隆与表达
通过在数据库中搜索新的 SLC26A 基因,然后对合并的 cDNA 文库进行 PCR,Lohi 等人(2000)克隆了 SLC26A6。推导的 738 个氨基酸的蛋白质具有 12 个跨膜结构域和细胞内 N 和 C 末端。胞外环 2 有 2 个潜在的糖基化位点。外显子 17 中的选择性剪接导致 611 位处谷氨酰胺的存在或缺失。Northern 印迹分析检测到主要的 3.0-kb 转录物在肾脏中大量表达,在胰腺、胎盘和骨骼肌中表达较低。PCR 分析检测到肾脏和胰腺中的表达最高。原位杂交揭示了肾管壁细胞亚群中 SLC26A6 的局部表达。免疫组织化学分析显示,SLC26A6 在肾小管顶端和基底外侧表面以及胰管刷状缘中表达。
Waldegger et al.(2001)通过以SLC26A3(126650)为查询条件检索EST数据库,然后通过人胎盘cDNA的5-prime和3-prime RACE,克隆了SLC26A6。推导的 759 个氨基酸的蛋白质包含 11 个跨膜结构域、一个细胞内 N 末端和几个 N-糖基化位点。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 2.6 kb 的转录物,其中肾脏和胰腺中的水平最高。在肾脏、胰腺和心脏中检测到了其他转录本。表位标记的 SLC26A6 在转染的犬肾细胞的质膜上表达。蛋白质印迹分析检测到范围从 84 kD 到超过 200 kD 的宽蛋白条带,与广泛的 SLC26A6 糖基化一致。
Chernova等人(2005)报道了6个SLC26A6剪接变体,编码699至758个氨基酸的蛋白质。其中四种蛋白质的不同之处在于 N 端延伸的存在与否以及 C 端 STAS(硫酸盐转运蛋白和抗 σ 拮抗剂)结构域中谷氨酰胺(Q632 或 Q611,取决于 N 端)的存在与否。 。其余 2 个蛋白质均缺乏 N 末端延伸。一种缺失了 2 个跨膜结构域并且缺少 Q611,而另一种则具有替代的 C 末端,没有 STAS 结构域。Chernova et al.(2005)指出,仅已鉴定出小鼠 Slc26a6 的 2 个剪接变体,它们编码具有或不具有 N 末端延伸的蛋白质;两者都没有与 STAS 域中的人类 Q632/Q611 等效的密码子。
▼ 基因功能
Chernova et al.(2005)发现6种SLC26A6亚型中的4种在非洲爪蟾卵母细胞中表达时是功能性阴离子转运蛋白;缺乏 2 个跨膜结构域的异构体和缺乏 STAS 结构域的异构体是无活性的。所有活性 SLC26A6 转运蛋白均显示双向草酸盐通量、Cl-/HCO3- 交换和 Cl-/OH- 交换。Cl-/HCO3- 交换对 cAMP 敏感,并且通过共表达野生型而不是突变体 CFTR(602421)增强。所有人类SLC26A6亚型均表现出比小鼠SLC26A6亚型更慢的Cl-和硫酸盐转运速率,并且人类和小鼠SLC26A6亚型对药理学调节剂的反应不同。小鼠和人 SLC26A6 均介导电中性 Cl-/HCO3- 和 Cl-/OH- 交换。相比之下,小鼠Slc26a6的Cl-/草酸交换是生电的,而人SLC26A6的Cl-/草酸交换是电中性的。Chernova et al.(2005)得出结论,直系同源的小鼠SLC26A6蛋白和人类SLC26A6蛋白在阴离子选择性、转运机制和急性调节方面有所不同,但两者都介导电中性的Cl-/HCO3-交换。
▼ 基因结构
Lohi et al.(2000)确定SLC26A6基因含有20个外显子。Waldegger et al.(2001)确定SLC26A6基因包含21个外显子,跨度9.7 kb。
▼ 测绘
Lohi等(2000)通过辐射杂交分析将SLC26A6基因定位到染色体3p21.3。
▼ 动物模型
Jiang et al.(2006)表明Slc26a6缺失小鼠草酸钙尿石症的发病率很高(167030)。Slc26a6缺失小鼠具有显着的高草酸尿症和血浆草酸盐浓度升高,而饮食限制草酸盐可大大减轻这种情况。体外通量研究表明,缺乏 Slc26a6 的小鼠肠道草酸盐分泌存在缺陷,导致草酸盐的净吸收增强。Jiang等(2006)得出结论,SLC26A6在限制草酸盐的肠道净吸收方面具有主要的组成作用,从而预防高草酸尿症和草酸钙尿石症。Kleta(2006)评论说,这些发现为人类常见的肾结石疾病提供了遗传学解释。