ATONAL bHLH 转录因子 7; ATOH7

ATONAL,果蝇,同源物,7

此条目中代表的其他实体:

调节元件,顺式作用,增强子,ATOH7 上游 21.7 KB,包括;RECE-ATOH7,包括

HGNC 批准的基因符号:ATOH7

细胞遗传学定位:10q21.3 基因组坐标(GRCh38):10:68,230,595-68,232,113(来自 NCBI)

▼ 说明

ATOH7是碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)蛋白家族的成员,与果蝇的“无调性”相似,这是一种控制光感受器发育的原神经bHLH基因(Brown et al., 2002)。

▼ 克隆与表达

Brown等人(2002)利用Atoh7/Math5 cDNA筛选基因组文库,孤立出人ATOH7克隆。通过数据库序列分析,他们鉴定了相应的 ATOH7 cDNA,该 cDNA 编码与 mu Atoh7 具有高度序列同源性的蛋白质。

▼ 基因结构

Brown et al.(2002)确定ATOH7基因含有单个外显子。

▼ 测绘

Brown et al.(2002)通过FISH将人类ATOH7基因定位到染色体10q21.3-q22.1;该区域与 Brown 等人(1998)为 Atoh7 鉴定的小鼠染色体 10 位置显示同线性同源性。

▼ 基因功能

Brown 等人(1998)确定 Atoh7 在发育中的视杯中表达,从胚胎第 11.5 天开始,其时间和空间模式与视网膜神经节细胞的形成一致。

▼ 分子遗传学

在一个伊朗近亲家庭中,患有先天性失明、眼球震颤、浅前房、巨大的晶状体后肿块和染色体10q21(PHPVAR; 221900),最初由 Ghiasvand 等人(1998)研究,Ghiasvand 等人(2011)鉴定出位于 ATOH7 转录起始位点上游 21.7 至 15.2 kb 的纯合 6.5-kb 缺失,该缺失与家系中的疾病完全分离(609875.0001) )。该删除删除了由 3 个保守非编码元件(CNE)组成的簇。ATOH7 区域和远程 CNE 中主要增强子的活性比较表明转​​基因表达模式在空间和时间上都有重叠。Ghiasvand et al.(2011)得出结论,RNANC是由ATOH7基因的这个远程增强子缺失引起的。

Khan等人(2012)在一个患有角膜混浊、小眼症、眼球震颤、玻璃体变性和双侧视网膜脱离的巴基斯坦家庭和土耳其家庭的受影响成员中鉴定出错义突变的纯合性(E49V;ATOH7 基因中分别存在 609875.0002)和 1-bp 缺失(609875.0003)。这些突变在每个家庭中随疾病而分离,并且在 170 个种族匹配的对照中没有发现这两种突变。

Prasov et al.(2012)在巴基斯坦 PHPVAR 家族 6 代受影响成员中鉴定出 ATOH7 基因(N46H;N46H;609875.0004)。该突变按照谱系中的预期分离,并且在 72 个视力正常的对照或 NHLBI 外显子组变异、1000 基因组计划或 dbSNP 数据库中未发现。

▼ 动物模型

Brown et al.(2001)产生了缺乏 Atoh7 的小鼠。突变小鼠有眼睛,但缺乏视网膜神经节细胞和视神经。Brown等人(2001)得出结论,Atoh7在视网膜神经节细胞和视神经形成中发挥核心作用。

▼ 等位基因变异体(4个精选例子):

.0001 持续性增生性原发性玻璃体,常染色体隐性遗传

ATOH7,6.5 KB DEL,-21.7 KB

在一个伊朗近亲家庭中,患有先天性失明、眼球震颤、浅前房、巨大的晶状体后肿块和染色体10q21(PHPVAR; 221900),最初由 Ghiasvand 等人(1998)研究,Ghiasvand 等人(2011)鉴定了位于 ATOH7 转录起始位点上游 21.7 至 15.2 kb 的 6.5 kb 缺失的纯合性,该缺失与家族中的疾病完全分离。该删除删除了由 3 个保守非编码元件(CNE)组成的簇。ATOH7 区域和远程 CNE 中主要增强子的活性比较表明转​​基因表达模式在空间和时间上都有重叠。Ghiasvand等(2011)得出结论,RNANC是由ATOH7基因的远程增强子(RECE-ATOH7)缺失引起的。

.0002 持续性增生性原发性玻璃体,常染色体隐性遗传

ATOH7、GLU49VAL

巴基斯坦农村近亲家庭(MEP57 家族)的受影响成员患有角膜混浊、小眼症、眼球震颤、玻璃体变性和双侧视网膜脱离,对应染色体 10cen(PHPVAR; 221900),最初由 Khan 等人(2011)研究,Khan 等人(2012)鉴定出 ATOH7 基因外显子 1A 中 c.146A-T 颠换的纯合性,导致 glu49-to-val(E49V) bHLH 结构域中的取代。该突变在家族中随疾病而分离,并且在 170 个种族匹配的对照中未发现。

.0003 持续性增生性原发性玻璃体,常染色体隐性遗传

ATOH7,1-BP DEL,53C

一对土耳其兄妹患有角膜混浊、小眼球、眼球震颤、玻璃体变性和双侧视网膜脱离(PHPVAR;221900),Khan et al.(2012)鉴定出 ATOH7 基因中 1-bp 缺失(c.53delC)的纯合性,导致预计会导致提前终止的移码(Pro18ArgfsTer69)。该突变在家族中随疾病而分离,并且在 170 个种族匹配的对照中未发现。在同胞中观察到的其他特征包括白内障、持续性胎儿脉管系统、视神经发育不良以及玻璃体膜、视网膜和玻璃体钙化。

.0004 持续性增生性原发性玻璃体,常染色体隐性遗传

ATOH7、ASN46HIS

患有持续性原发性玻璃体增生症的巴基斯坦第 6 代家庭受影响成员(PHPVAR;221900),最初由 Khaliq 等人(2001)描述,Prasov 等人(2012)鉴定出 ATOH7 基因中 c.136A-C 颠换的纯合性,导致 asn46-to-his(N46H)取代bHLH 结构域中高度保守的残基直接接触 DNA。该突变按照谱系中的预期进行分离,并且在 72 个视力正常的对照或 NHLBI 外显子组变异服务器、1000 基因组计划或 dbSNP 数据库中均未发现。HEK293T 细胞的转染研究表明,N46H 代表无效等位基因,无法结合 DNA 并且没有可检测的转录活性。此外,N46H突变体未能恢复Atoh7 -/- 小鼠胚胎外植视杯中视网膜神经节细胞的发育。

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